Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_TTC3_0008700
Sequence Length
1431 nt
GC Content
0.3871
GAAGGAGAACUAAUGAAAAUGAAAGGAAAUGAAGAGUUUUCCAAAGAAAGAUUUGAUAUAGCUAUUAUCUAUUACACCAGAGCCAUUGAAUAUAGACCUGAAAACUACCUUCUUUAUGGUAACCGAGCUCUUUGUUUUCUUCGUACUGGACAGUUUAGAAAUGCACUCGGUGAUGGAAAGAGAGCCACUAUUCUGAAGAACACUUGGCCAAAGGGUCAUUAUCGUUAUUGUGAUGCUCUUUCUAUGCUGGGGGAAUAUGACUGGGCCCUGCAAGCAAACAUAAAAGCUCAAAAACUCUGUAAAAAUGACCCUGAGGGAAUCAAGGAUCUAAUUCAGCAGCAUGUAAAGUUACAAAAACAAAUAGAAGACCUACAAGGUCGAACAGCAAAUAAGGAUCCAAUUAAAGCCUUUUAUGAAAACAGGGCCUACACACCUAGGAGUUUAUCAGCACCUAUAUUUACUACUUCACUUAACUUUGUGGAGAAGGAAAGAGAUUUCAGAAAAAUUAAUCACGAAAUGGCCAACGGUGGUAAUCAGAAUCUAAAGGUGGCGGAUGAGGCGUUGAAGGUAGAUGAUUGUGACUGUCAUCCUGAAUUUUCACCACCAUCAAGUCAGCCUCCAAAACAUAAAGGAAAACAAAAAUCUCGAAACAAUGAAUCAGAAAAGUUCAGUUCUAGUUCACCAUUGACUUUACCAGCAGAUUUGAAGAACAUCUUGGAGAAACAGUUUUCUAAAUCUUCCAGAGCUGCACACCAGGAUUUUGCUAAUAUAAUGAAAAUGCUGAGAAGCUUAAUUCAAGAUGGCUAUAUGGCCUUAUUGGAGCAGCGUUGCCGCAGCGCUGCACAGGCCUUUACAGAGUUGCUGAACGGUUUAGAUCCUCAAAAAAUAAAGCAAUUGAACCUGGCCAUGAUUAACUAUGUUUUGGUCGUCUAUGGACUUGCCAUUUCUCUCCUUGGAAUAGGACAGCCUGAGGAAUUAUCUGAAGCCGAAAACCAGUUUAAGAGGAUUAUUGAACACUACCCCAGUGAGGGCCUUGAUUGCUUGGCCUACUGUGGAAUUGGAAAAGUAUAUUUGAAAAAAAACAGAUUUCUAGAAGCUCUCAAUCACUUUGAGAAAGCAAGAACCUUGAUUUAUCGUCUUCCUGGAGUGUUAACUUGGCCCACGAGUAAUGUGAUUAUUGAAGAGUCUCAGCCACAAAAAAUAAAGAUGCUGUUAGAGAAAUUUGUUGAAGAAUGCAAGUUCCCUCCAGUGCCAGAUGCCAUUUGUUGCUAUCAGAAGUGCCAUGGAUAUUCUAAGAUCCAGAUAUACAUAACUGAUCCAGACUUUAAGGGUUUUAUACGCAUCAGCUGUUGCCAGUACUGUAAAAUAGAAUUUCACAUGAAUUGCUGGAAGAAGUUAAAAACUACAACCUUUAAUGAUAAAAUUGACAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-326.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -355.27
Frequency: 0.0000
Diversity: 417.86
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.((................(((((........)))))............((((.......)))).....(..(((.(.((((...((((((.........((((........))))...(((((...(((((.(((.(((..((.(((((......(.(.((((((.((((((((((...(((.((..(((.((.....(((((....))))))).)))..)).)))...))))))))))))))))).)....)))))..)).)))))).)))))....)))))......))))))..)))).).)))..)(((((((((.(((..(((((((((.(((((((..................(((((...)))))........(((((((..(((..((.((((.(((.((((...(((.........)))..((((((.((((((..........((.((((((........)))))).))((((....))))..........(((((.............)))))...((((((((...((((...((((..(.((.((((((.((((((.......))))))....)))))))))..))))(((((((..(((..........)))....................(((((.((((........)))).)))))...))))))).....((((.((((((((.....((((((((....)))))))).)))).)))).)))).)))).))))))))...............)))))).))))))..))))))).)))).))))))))))))...(((((((((...)))))))))......)))))))..)))))))))(((((((((((((((....................((((((.(((.......))).)))))).....((.((..(((((((.......))))).))..))))))))))....)))).))))).......((((((........)))))).....((((((..(((((..(....)..))))))))).))...(((((......(((((........))))))))))...((((((((.....))))))..)).))).))))))))).)).)))))((..(((.(((((((...((((((...((((((.......(((((((.(((.(((((..........((((...(((.(((((((........)))))))..)))))))...........))))).)))(((((..(((...(((((........)))))......)))..)))))..)))))))...((((((((..(((...((((....))))..)))...))))))))))))))...))).)))...)))))))..))).......(((((......)))))..))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{.,(,.,..|,.......,{{,{{(((((((((((((({,,|,,,....,,|,|{{{{....,,,}}}},.......{{{.{{,{{.,...||{|..,,,.....{(((........)))}...}))))))))))))))))}||,((((((((((.......{(,(({{{(..{,,,..|||.|}{{{,.,((((({(((((..(((((..{{{({{(((,|,{...,.,||{.{||,||,,,.{((({{(({..{.....}}..})}},},})})..,,.}}.)))))}......,,}},..,}))})})),.})(((((((((.(((..{((((((((.(((((((.,................(((((...)))))......{.,{{((((..{{{..,,.{(((,|{{.{{{,..,|{(|,,,.....}}).,((((({.((((((..,...,{..((.((((((........)))))).)){{||..,,||||.,........,||,,,..,}.{{{{...,))))...((((((((...(((({{.(((({{(.(.(((((((.((((((.......)))))).,..})))))),).}),))|,|||,|}}{{{..........}}}...........,,.......(((((.((((........)))).)))))...}))}}},.....((((.((((((((.....((((((({....}))))))).))))},))).)))).}}}).))))))))...............)))))).,)))))..})))|}}.)))}.,,}))))))}))|,.(((((((((...)))))))))...,,,)))))))..))))))))}(((((((((((((((....................,(((((.(((.......))).)))))},,...{|.|{,{|{|{{{(,.,,,,.}}}},,))..)},}))))))....)))))))))).......((((((........)))))).....({((((..(((((..(....)..))))))))).))..,((((({.....,((({.....,..}}}})))))),..((((((((.....)))))}.,)).))).))))))))).,|{|{|,|((((((,,,{,(((((.....))))},|||,{,,,.,,....,,||{{(((.,{..........,..}}}}...|}|,{((((((........))))))),,)))))),}..}}}}))))..)))).)).))))}}||}...(((((........)))))......,..}}))),)}})),|.|{,,{|(({,,....,|...,{{{,,..|||||{|{{{.,,||...}}}},}}}.,...))})))...,)))).....,}..,,)||||||{......}})},..}}
Back