Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_TTC3_0015900
Sequence Length
709 nt
GC Content
0.4006
GUCGAACAGCAAAUAAGGAUCCAAUUAAAGCCUUUUAUGAAAACAGGGCCUACACACCUAGGAGUUUAUCAGCACCUAUAUUUACUACUUCACUUAACUUUGUGGAGAAGGAAAGAGAUUUCAGAAAAAUUAAUCACGAAAUGGCCAACGGUGGUAAUCAGAAUCUAAAGGUGGCGGAUGAGGCGUUGAAGGUAGAUGAUUGUGACUGUCAUCCUGAAUUUUCACCACCAUCAAGUCAGCCUCCAAAACAUAAAGGAAAACAAAAAUCUCGAAACAAUGAAUCAGAAAAGUUCAGUUCUAGUUCACCAUUGACUUUACCAGCAGAUUUGAAGAACAUCUUGGAGAAACAGUUUUCUAAAUCUUCCAGAGCUGCACACCAGGAUUUUGCUAAUAUAAUGAAAAUGCUGAGAAGCUUAAUUCAAGAUGGCUAUAUGGCCUUAUUGGAGCAGCGUUGCCGCAGCGCUGCACAGGCCUUUACAGAGUUGCUGAACGGUUUAGAUCCUCAAAAAAUAAAGCAAUUGAACCUGGCCAUGAUUAACUAUGUUUUGGUCGUCUAUGGACUUGCCAUUUCUCUCCUUGGAAUAGGACAGCCUGAGGAAUUAUCUGAAGCCGAAAACCAGUUUAAGAGGAUUAUUGAACACUACCCCAGUGAGGGCCUUGAUUGCUUGGCCUACUGUGGAAUUGGAAAAGUAUAUUUGAAAAAAAACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-160.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -175.00
Frequency: 0.0000
Diversity: 208.24
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.........((((((....(((((((...(((((..........))))).........((((.(((....))).)))).........((((((........))))))..((.....(.(((((((..((((..(((.((((((((....((((((.....(((.....(((((((((......((((.......)))).......)))))).))).....)))))))))...((((((((..((((((((((................((((.....(((((.((((........)))).)))))...))))........((((.((((((((.....((((((((....)))))))).)))).)))).))))....(((.(((((............))))).)))..........(((((...((((....))))...)))))(((((((((...)))))))))...((((.......(((((((......(((.((...)).))).....)))))))......)))).........))))))))))..).))...)))))))))))))..((((......)))).....)))..)))).))))))).).....)).((((((........)))))).....((((((..(((((..(....)..))))))))).)))))))))......))))))...........
Thermodynamic Ensemble Prediction
,,.......((((((,,..(((((({...(((((,,........}}|}},,.......{(((.(({....|)).)))}..,,..((.((((((........)))))).)),,|,..,.{({{{{{........|{..{{{{{(((,...{(((((.,,{{(((,,,..,(((((({({({{,{,({({{{{,{.||||{{.....,,))))))}}..,}})))))),)).}}{{{||{||,,(({{{{{{{,..||,...........,,,......(((((.((((........)))).)))))...})),.,,.....((((.((((((((.....((((((({....}))))))).))))},))).))))...,{((,{{{{{............}}}}),)))...},,,...{((((...((((....))))...))))}(((((((((...))))))))).,|((((.......{{{{{{{...,,,(((,({,,,|||,,......}}}}}}}......||||,,|,,....}}})))}))),,),},..,)}}}}})}}}|||..{(((.|,...,}},.,.,})))))).,..)))))))}},.......((((((........)))))).....{{{{{|,.|||||..|....)..))))}}})).))})))))}....,.}}))))..........,
Back