Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_TTC3_0025300
Sequence Length
763 nt
GC Content
0.4063
AUUUGAUAUCACCCAGACACCGCCAGCAUACAUAAACGUGUUACCAGGUUUGCCCCAGUACACCAGCAUAUAUACACCCUUGGCCAGCCUUUCUCCUGAAUAUCAGCUACCAAGAUCAGUACCAGUGGUGCCGUCUUUUGUAGCCAAUGACAGAGCAGAUAAAAAUGCUGCUGCCUAUUUUGAGGGUCAUCAUUUGAAUGCUGAGAAUGUUGCUGGUCACCAGAUUGCCUCUGAAACACAGAUCCUUGAGGGCUCUUUGGGAAUAUCUGUAAAGUCACACUGCAGCACAGGUGAUGCUCAUACAGUCCUGAGUGAGUCUAACAGAAAUGAUGAGCACUGUGGAAAUUCUAACAACAAAUGUGAAGUAAUUCCAGAAAGCACCAGUGCAGUAACAAACAUUCCACACGUGCAGAUGGUUGCCAUACAGGUAUCUUGGAACAUAAUACACCAAGAAGUCAAUACUGAGCCAUAUAAUCCUUUUGAGGAACGACAAGGGGAAAUUUCACGGAUUGAAAAGGAGCACCAAGUAUUACAAGACCAACUUCAAGAAGUGUAUGAAAAUUAUGAGCAGAUAAAACUUAAGGGCUUAGAAGAGACCAGGGACCUGGAAGAGAAGUUGAAAAGGCACUUAGAAGAAAACAAGAUCUCAAAGACGGAAUUAGAUUGGUUCCUUCAAGAUUUGGAAAGAGAAAUUAAAAAAUGGCAACAGGAAAAAAAAGAAAUCCAAGAAAGACUAAAAUCACUGAAGAAGAAAAUUAAAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-162.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -176.85
Frequency: 0.0000
Diversity: 123.93
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((....((...(((.....(((((((.((((....((((.((..((.....))..))))))((((((.((...(((((((((.(((.......(((..(((..(((((.(((((..(((((...))))).)))))..)))))..))).)))((((........))))))))))......)))))).......)).))))))...)))))))))))..((.(.(((((((((.....))))(((((..((((((((.((...(((((((...(((((.(((.....))))))))..(((((((.((.(((((..((((......(((.((..(((((((((((..............((.(((....)))))....(((....)))...........))))))).))))..)).)))(((.....))).((((((...........)))))).((.(((((((..((......((((((((........))))))))..(((((.....))))).))..)....)))))))).))))..)).))).))..))))))).........)))))))...)).))))))))..))).))((((....))))..((((..(((....................)))..))))...((.(((((((...))))))).))..(((((........))))).......)))))).))................................)))..))...))))(.....)
Thermodynamic Ensemble Prediction
,((({,,.{{...,,|.....(((((((.((((....((({,((..((.....))..))))))((((((......(((((((({{(((...,,..(((..{{(..(((((.(((({..(((((...))))).)))))..)))))..})).)))((((........))))))))))......)))))).......}}.))))))...)))))))))))..,,.{.(((((((((.....)))}(((((..((((((((.((...(((((((...(((((.(((.....))))))))..(((((((.({,(((((..((((......,{{.{(..(((((((((((......,,......||}{{{....})},,....(({....})).,,........))))))).))))..}).}}|(((.....))),((((((...........)))))).{(.((({(({.,{|......((((((((........))))))))..{((({.....))))}.||..}.,,.,))})}}}.))))..))}})}.),}.))))))).........)))))))...)).))))))))..))).},((((....))))..((((..(((......,.............)))..))))...((.(((((({...})))))).))..|||||,.......}}}}}.......))))),.{|{...........}}}..............,,.}},..,......})|,,...,
Back