Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_TTC3_0027600
Sequence Length
389 nt
GC Content
0.5501
GCCCCAUGUGUCCACGUGGGAGUUGAGGGUGAGUCUUGGGCUUCCGUCCAGGAGUACUAGGGGAAGAGCAGGACUGGGGAGGCUGCCUGAGGCUGGUUUCCAAAACACUGACUUUGAGUUGCCUUGGAAUCACCCAAGUGGAUUUGCAGAUUUGGAUCUCAGGAAAAUAUUCUAGACUGCAAACUUUUAAAAAGAUUUGGCCUCAGGCAGCUGCAUGGGGAGGAGUGUCAGCACUGCAGGCGUGGACGGAGGCCUGAGAGCUGCCAGGAGAGCUGGCAGGGAAGAGGAGGCGGCCCCCUGGGAUGGAGACAGCUCUGGGGAGUGUGGUGGCCAUGAUGUUCCAUCUGUCAGCUACAUGGUUUAGCUCAGAAGGGGAAAAGUGUAACCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-144.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -152.98
Frequency: 0.0000
Diversity: 81.79
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((....))))))).))(...((((..(((((((((((((((((.(...............((((..(((....(((((((((((((((((((((((..((((.......)).))..))))))..))).....((.(((((((.((((((..............))))))))))))))).............))))))))))))))((((........)))))))..))))...).)))))))))))))))))..)))).....(((((((((((((.(...(((.((((((((((.((....))..))))))).....))).)))....).))))..)))))))))...(((((..(((............)))..))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((((....))))))).}}{...(((...(((((((((((((((((.(....{{.,.......{|{{..||{|...((((((((((((((((,{(((((..{(((.......))},)..)))))}.|,,||..},}}.{((((((.((((((..............))))))))))))){{,,....,,}...,)))))))))))))),|,{.......,|||}}}}},))})...).))))))))))))))))|,{||||,....(((((((((((((.(...(((.((((((((((.((....)).,))))))).....))).))).,..).))))..))))))))).,.||||{.,||||...........}}}..}}))}}
Back