Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_TULP4_0002100

Sequence Length

418 nt

GC Content

0.5000

UCCUGGGUCAAGCUGAGUAUCUCCACGUUUAGGUGCACAAAUACUAUUUUGUGAAGAUCUUAAAUUUGUGGUAUAAGAACUUGAAGGAAAUAGAACUGAUUUGUUACUUCUAAAAGAUGGUCCGGCAGCAUAUCCCAUCCCAGUGCAGAACAUCAAGCCUCUGCUCACCGUCAGCUUCACCUCGGGAGACAUCAGCUUAAUGAACAACUACGAUGACUUGUCUCCCACGGUCAUCCGCUCAGGGCUGAAAGAGGUGGUAGCCCAGUGGUGCACACAGGGGGACUUGCUGGCAGUCGCUGGGAUGGAACGGCAGACCCAGCUUGGUGAGCUUCCCAAUGGUCCCCUUCUGAAGAGUGCCAUGGUCAAGUUCUACAAUGUUCGUGGGGAGCACAUCUUCACACUGGACACUCUCGUGCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-130.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -138.37

Frequency: 0.0000

Diversity: 59.89

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(.(((((((..(((((.((((((((((((((((..((((((......)))))).....)))))))..))))...........((((..((((((.....)))))).))))....))))).).)))).((.....(((((((((((.....((.((((((((((..(((((...(((((((((((((((((((((...................)))..))))))))....(((.((......)).)))..))))))).)))....)))))....))))))..)))).)).....)))))))))))....)).))))))).(((..((((((.(((.((((.(.(((...))).).)))))))..))))))..))).....(((((((.....))))))))(((.((......)).)))

Thermodynamic Ensemble Prediction

(.(((((((..(((((.((((((((((((((((..((((((......)))))).....))))))}..)))).........,.((((..((((((.....)))))).))))....))))).),,))).((...,.(((((((((((,....((.((((((((((..(((((...(((((((((((((((((((((...,..,..........,.)))..)))))))).,{{{{,.{{.....,)).))}..))))))).)))...,)))))....}}))))}.)))).))...,.)))))))))))....)).))))))).{((..((((((.((,{((((.{.(((...})).).)))))))..))))))..))}.....(((((((.....))))))))(((.((......)).)))