Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_TULP4_0005400
Sequence Length
567 nt
GC Content
0.3774
GCGUGAGCCACCGUGCCCGGCCUAAUAAUCUGCUCAUUUUCUAAUGGAAAAAAAAAAAAAAAUGCCUGCAUCAUAGGUAUCCUGCACAGGUAUAGUUAUAUUAUUGUUUAACAAAUCACUUGAAAAAUAAACUUACUGUUUAAAAAUAUAACUUUUUGAAGACAUCAAAGUAAGUUAACCUUAAAUUAUGGCCAAUUAGUGGCAUAAUUGAAAUCUCACAAAAGAAGGAUAUGACACAGACCAGAGUGGAUCCCAGUGUGUCCCUGGGUUCUGCAGAAGCACUCUGUGGUGACAGCAGAGGUGGCACCUCCCACCACGGGUAGCUGCCAUGGUGGACACAGUGAUUUACUGUUGUUAGUCUGUCGAGGUUUCAUUUCUCUCUGAUUCCUUGUCUGAGUUUUGAAAAUGACUGUCCCAACUCAAUGUGAUGUGGUGUACUGAUUUAUAGUGGAACUACAAACCAGAAUAAACAACAGUUUCAUAAUUUUGCCAGGUAUAUGUUUUUGCUUAAAGUAUCUUGAUAGGCAAAGGAUUUAAUUUUAUCACAAAAUUUAUAAAAGGCACCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-131.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -144.81
Frequency: 0.0000
Diversity: 152.48
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((....))(...(((((...........((((.((.((((((...))))))..........(((((((.....((((...))))..))))))).((((((((..(((((..(((.....)))..)))))((((((((((((..(((........)))..)))).....)))))))).......(((((((.(((.....))))))))))....(((......)))..))))))))...)).))))(((((.(((((.......))))).)))))...(((((.((((((((......(((((...))))).)))))))))).)))(((.(((((((....((((...(((((((((..((((.(((((..(((........)))..)))))..((((((..((.........))..))))))..((..((((((.(((((.....)))))..)))))).))))))...))))))))).))))...))))))))))......(((((((((..(.....)..)))))))))(((........)))...............)))))..)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((....))(...(((((..(({,,...,{{(({({.(((((,...))))),..........(((((((.....{|{{,,,}}}}..}}|||}}.((((((((.{(,({{.,|{,.....}})...,,},(((((((({((({{(({......}})))||,,}}.....})))))))....,..((((((,{(((.....)))))))))).,...,{,.....}}},.))))))))....},}.}}|||||,(((((.{...,|))))).}}|||,,,,{||({(((({,,,.,.,}}|||(({{{|,|||{{,,,,.))).,).))))}|||{|||.,..((((...(((((((((,.((((.(((((..(((........)))..)))))..((((((..((.........))..))))))..{,..((((((.(((((.....)))))..)))))).,,)))).}.))))))))).))))...}}})))}}}},...,|{{{{{{{{{.,|...,}}..)))))))}}|{{....,,,,}},...,,,,,.......)))))..)
Back