Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_TULP4_0009200

Sequence Length

1166 nt

GC Content

0.4160

AGGAAAUUAAAAAGGUCUCCGAUCCACUUGGUUUUUCUCUAUUACUGUCUCAGAGGAACAUCACUAAAGAACUUUGGCAGCGAAGGAAGGUAACUCGCACUAUUGUUUUAGUGUAUCACCAGCACUGGAAUUUACGACCUGUGCAAAAGAACCUAGAAUUCCACAUAGCUCUUGGUCCCUGCCCAGGCCUCUUCUGCAUCAGCCAGCACACUUCAUUUUCACUGCAGAUGUGUCUGUGGGCUCAAAGGCCGGGUUCUGGGGAGGGUUAGGCUCUGAUUUUGCUUGGCCGUGGUUUGCUGAGGAAGUUCUGCCUUCUUCAGAUUCUCUUCCUUCAGAACAGGGACUUCUCUUCAUCACGCAAUAAGCAGGGAAUUGAUUCACUUUGCUUGGGGUUUUUACCCAUUGUUAUGACUUCUACUCUUUUCCUGAGUAGAAAUAAUUCAAUCAGGAGUUCAGGAAUUUUCUGCCCAAGCCAGUUCAUCCCUCAGUGGCAAAGCAGACUCCCAGAGGCACUCAUUUCAUCCCACACUUGCCUUGAAAUUAAAAGCUCCAACCCCUGAGCUUUGUUUGUGUUUUUUGUUUUGCAGAAUUUUCUCUUUUUGUCAUUUCAUUAAGCACACUGAAAAAAUGAGGAGGGAAUUUUUGAGGCAGGUGGUUUCAGUCAUUGAUGCCAUCUGCUCCUGUGGGCAGACCUGAUAAGAUUUGCCCACGUCGUCCUCAUUGAGUACGUGCCCCUUUUUUUCAGUCCUUGCAGUGAAACAUACUUCUUAAAGGAAAAAAAAAUGUACCUGUUAUUUUAUCAUCACACACUUUGCUAAUUAAUUAGUUGCUCUUUCCUCCACCCCCCACUGCUCCACAUGCACGUGUGUAUGCACAUACACAACAUGCAUGUCUAAUGACUAAUAAAGAGGUGAAUCAUGCACAUGGUAAUCUAAGGGACAAAGAACUGGAUAACUUCAGACUCCAAACAGUAGCUGCAAUAUAUAUGGUGCUUGAUAAGCACUCCUUUCUUUUUCUGUUAAAAUUUAGCUGCCUCUUUUUGACCCAGUAAUACCACACAAAGGGCUUCUUGUUAAUACAAAAGAACUAAAUUUUCACUGACUUCAUAUAACCUUCCAGACUUUUACCAAAAAGGAUCCAUAAGAUUUUCUGGCUAAAAGAGAAUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-310.40 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -333.11

Frequency: 0.0000

Diversity: 228.16

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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