Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_TULP4_0012000
Sequence Length
1654 nt
GC Content
0.5387
UUUGCACAACAGGAGCCUGCUGUGGUCCUUCAGCCGCUGUACCCACCCAGCCUCUCCUAUUGCACCCUGCCCCCCAUGUACCCAGGAAGCAGCACGUGCUCUAGUUUACAGCUGCCACCUGUCGCCUUGCAUCCAUGGAGUUCCUACAGCGCCUGCCCGCCCAUGCAGAACCCCCAGGGCACUCUCCCCCCAAAGCCACACUUGGUGGUGGAGAAGCCCCUUGUGUCCCCACCACCUGCCGACCUCCAAAGCCACUUGGGCACAGAGGUGAUGGUAGAGACUGCAGACAACUUCCAGGAAGUCCUCUCCCUGACCGAAAGCCCAGUCCCCCAGCGGACAGAAAAAUUUGGAAAGAAGAACCGGAAGCGCCUGGACAGCCGAGCAGAAGAAGGCAGCGUUCAGGCCAUCACUGAGGGCAAAGUGAAGAAGGAGGCUAGGACUUUGAGUGACUUUAAUUCCCUAAUCUCCAGCCCACACCUGGGGAGAGAGAAGAAGAAAGUGAAGAGUCAGAAAGACCAACUGAAGUCAAAGAAGUUGAAUAAGACAAACGAGUUCCAGGACAGCUCCGAGAGCGAGCCUGAGCUGUUCAUCAGCGGGGAUGAGCUCAUGAACCAGAGCCAGGGCAGCAGAAAGGGCUGGAAAAGCAAGCGCUCCCCACGGGCCGCCGGCGAGCUGGAGGAGGCCAAGUGCCGGCGGGCCAGUGAGAAGGAGGACGGGCGGCUGGGCAGCCAAGGCUUCGUGUACGUGAUGGCCAACAAGCAGCCGCUGUGGAACGAGGCCACCCAGGUCUACCAGCUGGACUUCGGGGGGCGGGUGACCCAGGAGUCCGCCAAGAACUUCCAGAUUGAGUUAGAGGGGCGGCAGGUGAUGCAGUUUGGACGGAUUGAUGGCAGUGCGUACAUUCUAGACUUCCAGUAUCCGUUCUCAGCCGUGCAGGCCUUUGCAGUUGCCCUGGCCAACGUGACUCAGCGCCUCAAAUGAAGAGACUGGUGUGGGGAGGAGAGAGAUGCAGAGAGCCUUUGGAAGAGGUCUUCGGAGAUGCCAGAGGAGCCCUCUAGGGGUCCGAUGCCUGGGAGGACCAGAAGCCAACAGCAAAACUGGAAAAGCCCGGCAGGCCCAGGAGAGGGCGCUGACCUGUGGUCGUCAUUUAUUUGGUUGGGUUUUAUUACCUUUUAUUGUCUGUUCUUCUUUUCUUCUUUCAUUUCAGUGGCAUUUGGAAGCAAAGAGUGCUAGGCACCUGCUGUUCUUUCAGGAAACAGCUUGGCUGUGGUAAUGCUCUACUGGGCCCUUCAGAAUGAAGACAGUCUGCCUUAGAGCCUGCUAUUCUUUUAGACAUAGGGAGGAUGCAUUAUCCUGUAUUCUCCUCCAACAUCACCACUAGCGUAAAAGCAAAAAGCUUUUACAAAACACAGCCAAAAAUUCUCAAGAUGCAGGUUCUUGGGGAAUGGGAUGGGGACAGCAUUUGAUUUACACUGAUUAUGUUACUCCCCAAAAGGUGACUUAAUUAAUAAAGGGCAUUUGGGCAGACACACUGUGUUGGACCAACAAAGUAGGCUCUUUACAGGGGUGUUCUCACCAGGUAGAAAUGCGAUUUGCUCACUGAGGAUGUUGGGGAAGGGACGAAGGGUAAAGAAGAAACUGCACGUAUACACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-590.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -617.71
Frequency: 0.0000
Diversity: 494.10
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((....(((((...((((.(((....(((...))).....)))))))..)))))..)))(((((....(((.......((((..(((((..(((........))).)))))..))))((.((..((((((...((((.......(((.(((((......((.(((((((((.((((..(((((((((((........)))).)).))))).))))..((((((((((((...((((....(((((((((((((((((.....(((.(.((.(((((((.................))).)))))).).)))....)))))((((......)))).......(((((.........)))))...((((((((.(((...........)))...))))))))..(((((........)))))....(((((.((((...(((((....)))))...)))).)))))..((((....))))((((..(((((((((((.((((((.((((.....(((((...........))))).............(((((.(((...((((...))))...))))))))(((((((......))))))).....((((((((((((((((((.((((((.(((.(..(((....)))...(((((.((((((((..(((((......)).))))))))))).)).))).....(((((((((..((((((.((.(.(((....((((((((.((.((((.(((...(((((((((..((...(((.(((...((((((((((((((((.((.(((((((...)))....)))).)))))....))))).))).).)))).))).)))..))..))))))..)).)...))).)))).))))))))))))).).)))))))).))))))))).....).))).))))).).)))))))))))...(((..(((..(.(((((.((.(......).)).))))).)..)))..)))..(((.((((((...)))))).)))...(((((((.(((.(((((((..(((((...((((.(((....((((..((.....))....)))).....))))))))))))...))))))).....))).))).)))).....)))))))((((......)))).......)))))))))))))))))))))..)))))))))).))))))((((.....)))).))))...((((((((....)).))))))(((((((((.....((((((.(((((.(((((...)))))...)))))...))))))..((((..............(((((((((((......))))))))))).............))))((((((((.....))))))))....)))))))))...(((((((((.......)))))))))...)).)))))))).))............((((((.((((((........)))))).)))))).((((((((..((((...(((((...)))))...))))........))))))))..)))).)))))))...)))))...))).....)))).....)))))).)).)).)))....))))).......)))(((..........)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((,{,,,,.(((((.,,((((,(((.,..(((..,|||..,,,||||}}}..|||||.,}}|(((({,{(((((.,{{...((((.,((({,..,|||,,,.,..}}}.|||||{.||||({{(({.((,({{.,((,,,,{|,,,{({(,((((({(({{.((,.{..,(({{.((((..(((((((((((........)))).)).))))).))))..,{((((((({.,.,(((({..,,((((({((((({{((((.....(((.{.((.{((((((.,.,......,,...|.}))||)))|),}.)))....))))}((((......)))).......{((((.........))))}.,.((((((((.(((...........)))...))))))))|.(((((........))))).,..(((({.((((,..{{(({,..,|||}},,,)})).|))))..((({....)))){{{{,.{{{{{{{{{{{.({{({(,({{{..|||{{{{{,.,,}}...,,}}||}.....|{,...,.{{{{|((((...((((...))))...))))}|||({{{{{||||,,,}}}|,|||,,,,|||,,||(((((((((((.,,{(((|({|,...,{{..,,))}.,.(((((.((((((((,.,{(((......))}.}))))))))).)).))).}..,||(({{{({,,|((((|,|||,.,(({{,,(({(((({,.{,(({{.{{{...|||||{|||..||,,,|||.(((.,.(((({{{{{|||{|{{.||,|||||||},.}},,,,,)})).))|||||,,|}||}.|||,|,,}}|,})|,}||,,||..}|}}}|..||,|,{,|}}.|||}{{|}}}}}}}},,,.,,)),)))}},)))))))}}.}}..},))}|))))}.|.))))))))))),..{((..(((..(.(((((.((.,.....,|,|},}}}}|,|,,|||..}}|{,(({,{(((({...}})))}}))}.,.(((((((.(((.(((((((..(((((...((((.(((....((((..((.....))....)))).....))))))))))))...))))))).....))).))).)))).....,}))))}{{{{......)))).....,.))))))))))))))))))))),.)})))))))).)))))},||,..|.||||,.,)))}}}(((((({|....}),,,))))(((((((((.....((((((..((((.(((({...}))))...}}}})}},)))))).,((((......,,}.....(((((((((((......))))))))))).............,}}}((((((((.....))))))))....)))))))))...,{|||||{{,,.,,},))))))))).}))).))))})))})}............((((((.((((((........)))))).)))))).,,||||||..,,||}}}|,{{|.,,)))},})}))),,...))))))}}}}|}|,))||{|,,,,))}}.}))))...})),..,|))}|.}}}.)))})),)))},.))).}..}}})).......)))(((..........)))
Back