Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_UBAC2_0001800
Sequence Length
1308 nt
GC Content
0.4480
GUGGUGGUGGGGGAAGCAGGACUGUGAGAACCCCCUGCAGUCGUCAAAGGGUGGCUCAUUGCUUUCUGUGGCUUUUACUCCUGAGUGAAGCUGCCUUUCUUAUUACCCUCCUUGUCCGUUCCCCGUCACCUGUGCUGUGAUCUGGUUUGGAAGUUUGAAGUUACCCCAAGCUCUCUUCUACUUUUUUGCAGACCUCCAACCCCCUCAUUGUUCUCCUUAAGCAGAUUGUCCCCCACCCCACCCUUUUUGGAGAGUUUCUAGGAUUUUAUUUUGGGGGAAUAAAUAAAUUUCUUUCCAACUGGGAUGGUGGUGAAAAGGCUGUUUGUAGACUGUGGGUGGGGAAGGGUUUGAGGCCCCACUGCUGUCAUGCUUGUUCGGUGGCAUUUGCACCACUGGAGAUGAUUUUAGACAGGGUGUCAGCCCAGCAGUAAACAUCAUUGAAAUAGAAGUCAGGUCAUGACUCCCUUUUCAGUUCUUUUCUUUUUGUUUUUUUUUUUUCUUGGGGGAUAUGACCUUUAUUGAGCUUAUCCACCACAGUGGAAAUAAUGUCUGUACAAAGCCAAAUGUUUGUUACUAUAACUUCUGCAUUACAAUUAAAAUCCAAACAGUUUUUUAAAAACAGUCAGCUCAAUCAAAGCCCAGUACUUCAGAAUCAAUAGCUUCCUUGAAGCCACAGUAUCACUUAAAUAUGGUUAAGACUCAAAUGCAGAAAUUUGGUUGGAAAGCUAAUUAAACUUCCAACUUGCCCAAAUAGAAUUACAAAAAGACAAAAUUGUGUUUUUCACAGAAAUAUAGUCCACUGGCAUCACCAACACUGGACAGCUGUUCUUUUAUUUAGAGUCCUGAGAUAACAAGGAAUCCAGGCAUACAUUAGACAGUCUUCUGUUGUCCUUUCUUCCCAAUCAGAGAUUUGUGGAUGUGUGGAAUGACACCACCACCAGCAAUUGUAGCCUUGAUGAGAAUCCAAUUCUUCAUCUGCACGAAUAGCAAGUUGCAAGUGACGAGGGGUAAUAUACACUUUACCUUUAAGUCUUUUGAUGCAUUUCCUGCCAGUUCAAGUCCCUCUGCGGUGAGGUACUCCAGGAUGGCUGCGCUGUACACAGCGGCAGUUGCACCCACAUGUCUGUGACCCGUCGUCCUAGAUUUCAGGUGUUGAUGAAUACAGCCCUCUGGGAACUGCAAGCCGGCUCUCUGCGAGCGGGAAACCGCCUUUGUCUUGGCCUUUCCGGAGUCCUUCCCAGCCUUACCGUCAGCCAUUUCGAGUUCUGCUGAAGCUCAAGCAAGGCAGAGAAAGGGCUAAUCAGACCC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-369.38 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -394.80
Frequency: 0.0000
Diversity: 372.77
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((((((((((.((((((((((.((......))))))))....((((((((((..((((((...(((.....)))....)))))))))))))))).............))))...)))))))))))).((.((((((...(((..(((((((((.........)))))).)))...)))...))))))))......(((((((((.((.((......((((((.(((...((((((((((...((((((((((((((((((...)))))))))).............))))))))..))).))).))))....))).)))))))))).))))).))))..(((((((((((((.....(((((.((((((((((((((........))))))))((((.(((......((((....))))......)))))))(((((....((((((((((((((.(((((....................................))))).))))))))..((((((((..(((((....)))))......(.((((...........((((((...............................))))))...........)))).))))))))).........).)))))....))))).(((((...)))))..(((((..((((....((((((..(((......(((((...(((((.(((((((..(((((((((.((((((((..............(((((.(((....))).)))))............(((((.((..........)).))))).((((............(((((((((........((((...(((((.(((..(((...)))..))))).)))...))))...)))).)))))((((.((.(((......)))))))))))))..((((.((...(((((((((...)))).))))).))))))...)))))))).))))(((.((((((((........))))))))..)))..))))))).))))).)))))..........)))))(((((((((((((.(((.((((.(((((....)))))((((((...((((...(((((.(((.....))).)))))...(((.((((.......))))))).)))))))))).))))((((....((((((((....))))..))))...))))..))))))))........)))))))))))))))))...))))..))))).....)))))).))))).....)))))..))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
..((((((((((((.(((((({.(((((.,{{{{{{||,,..,....||||,||{,....}},....((((({((((((....)))))))))))...,.........,)}},,))...)))))))))))).{,.((((((...(((..(((((({{(..,......}})))).})),,.)))...)))))),}......(((((((((.({{((...,,{((((,{.{{{...((((((((((...((((((((,{{{{{((({...|||}}}}})),,,..........))))))))..))).))).))))....)))}))))),)))).))))).))))..(((((((((((((..,,.(((((.((((((((((((((........))))))))((((.{{{,...,.((((....)))).,...,}}}})))((((({{..(,(((((,,,,,||}||,|,.}}}}}},......,.,,,,{,..,,,,...,..,,|||||,,,||,,||({((((((((..(((((....))))).....{(.{{({,,,,{,...,,{{|||{|{|...,,,,....}}}}}.....,,,,,..,..,,.|,,||,,.,,,)),}.,)))))))).}}}}..,,,.,}}}}.,..,},,..(((((...)))))..{{{{{..{(((.,..,{{{||..|{{.,,,,,{{{{{.|||||((,(((({{,..,,,,,{{||,||||||{|,,||,.||||..|||}|||}|{|..,,{{|{|||||...,}}}}}}},{{{{(,(({,....||,.,,.)))}}.{{{{|{{,,,,,,,..{{{((((({.......|{{{|,,.{(({,.(((..{((,,,,|,.}))})},},}||||}.....}})),))}}|((((.{(,(({......))))))))),,,,..,{{{.((...(((((((((...))))}})))).))}})),,,))}}||}},|||,(((.((((((((........))))))))..))).,))),,)).}}}}},)))))}.........}||||(((((((((((((.(((.((((,(((((....))))){({{((,,,((((...{,((({(,,.,{{,|}|{|}|,,...}}|.|{||,}}..,})))}},,.))))}})))).}}||{((({...{{||||((,...}}||,.,,,,...))))..))))))))........)))))))))})))}})},,.})))..)))))..,,,)))))).))))),,...)))))..))))))))
Back