Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_UBAC2_0002800

Sequence Length

420 nt

GC Content

0.4476

ACAAGGCGCCUCUGUCGAAGAGCCUUCUGCUGGUCCCCAGUGCCCUCUCCCUCCUGCUCGCCCUCCUCCUGCCUCACUGCCAGAAGCUCUUUGUGUAUGACCUUCACGCAGUCAAGAACGACUUCCAGAUUUGGAGGUUGAUAUGUGGAAGAAUAAUUUGCCUUGAUUUGAAAGAUACUUUCUGCAGUAGUCUGCUUAUUUAUAAUUUUAGGAUAUUUGAAAGAAGAUAUGGAAGCAGAAAAUUUGCACCUGGCACCUGUGUUUGCUCUGUUUGUACCAUUUUACUGCUCCAUACCAAGAGUCCAAGUGGCACAAAUUCUGGGUCCGUUGUCCAUCACAAACAAGACAUUGAUUUAUAUAUUGGGACUGCAGCUUUUCACCUCUGGUUCCUACAUCUGGAUUGUAGCCAUAAGUGGACUU

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-95.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -104.89

Frequency: 0.0000

Diversity: 69.37

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.(((((((.......((((((((.(((((.((((...(((............................)))....)))).)))))))))))))........((((.((((........(((((((((....)))))))))...)))))))).......)))))))....(((((...))))).((((....))))..........((((((.....))))))...(.((((((.(((((((((.((((...((((........)))).....))))..))))).)))))))))).)..(((((((.(((((((((..(((((((.((.((((............)))).))...........(((((((.((........)).)))))))...))))))))))).)))))...)))))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

.(((((({..,,...(((((((,{(((((((((,..,|||,{.............|...,,.........},...|||}|})))))))))))).....},.((((.((((|{{,....,{(((((((....)))))))))},.)))))))).......,))))))....(((((...))))).((((....))))..........{{{{{{,...,}}}}},...{.((((({{(((((((((.((((...((((........))))..}..))))..))))).)))))))))).,..(((((((.(((((((((..(((((((.{(.((((............)))).})...........(((((({.((........)).}))))))...})))))))))).)))))...)))))))