Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_UBAC2_0002900

Sequence Length

326 nt

GC Content

0.5368

AUGGAGUUUCUCCCUGUCGUCCAGGCUGGAGUACAAUGGUGUGAUCUCGGCUCACUGCAGUCUCUGUCUCCUGGGUUCAAAUGUCCGGUCUGUGCUACGACAGCAAAAUGUUCCAGGUGCAUCAGGUGCUCUGCAUCCCCAGCUGGAUGGCAAAAUUCUUUUCUUGGACACUUGAACCCAUCUUCUCUUCUUCAGAACCCACCAGCGAAGCCAGAAUUGGGAUGGGAGCCACGCUGGACAUCCAGAGACAGCAGAGAAUGGAGCUGCUGGACCGGCAGCUGAUGUUCUCUCAGUUUGCACAAGGGAGGCGACAGAGACAGCAGCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-106.90 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -114.47

Frequency: 0.0000

Diversity: 73.18

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.(.(((..((.((((((..((((...))))..)))..)).).)).))).)((..((((.(((((((((.(((((((((((.(((((((.((((......)))))....((((((((.((.....(((((...)))))..)).)))))..)))............)))))).))))))))...((((.......))))(((.((((((...(((.........)))......))))))........((((.(.((((((((.((((((((...))))))))..))))))))).))))......)))))).))))))))).)))).))

Thermodynamic Ensemble Prediction

.(.(((..,{.(({(((..((({...})))..)))..)).).)}.))).)||..((((.(((((((((.(((((((((((.(((((((.{{((,,....}}))}....{{{{((((.((.....(((((...)))))..)).))))).,))}...........,)))))).)))))))),..,{(({({...,|||.(((,((,{({...,......}}},.}}}}.,|..,,||||....))}},{,{.|,((((((({.((((((((...))))))))..}))))))),.})))}...,})))))).))))))))).)))).,)