Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_VIM_0001500
Sequence Length
417 nt
GC Content
0.6451
CCGCGCUCCCACCACCCACACCCACCGCGCCCUCGUUCGCCUCUUCUCCGGGAGCCAGUCCGCGCCACCGCCGCCGCCCAGGCCAUCGCCACCCUCCGCAGCCAUGUGGAGCUGCAGGAGCUGAAUGACCGCUUCGCCAACUACAUCGACAAGGUGCGCUUCCUGGAGCAGCAGAAUAAGAUCCUGCUGGCCGAGCUCGAGCAGCUCAAGGGCCAAGGCAAGUCGCGCCUGGGGGACCUCUACGAGGAGGAGAUGCGGGAGCUGCGCCGGCAGGUGGACCAGCUAACCAACGACAAAGCCCGCGUCGAGGUGGAGCGCGACAACCUGGCCGAGGACAUCAUGCGCCUCCGGGAGAAAUUGCAGGAGGAGAUGCUUCAGAGAGAGGAAGCCGAAAACACCCUGCAAUCUUUCAGACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-150.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -158.63
Frequency: 0.0000
Diversity: 102.57
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((((.(((.............((((.((.((((.((........)))))).))...))))........((.((((((((..((((...(((((((....)))))))..((((((.((...((.(.((((((.......((((.....)))).......)))))).))).....)).))))))((((((((((.....)))))...))))).)))..)..).))))))))).(((((....))))).(((((((((((((((((....))))...)))))..............))))))))..))))))))))).........((((((.(.......)))).)))((((.((((((((..(....(((((........)))))......)..)))))))).))))......
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((((((({(((.....((((..((((((.(((.,((((.((((((((,{(((...({((((({....}|,,}..((((((({..,(((...{((((((....))))))|{{,(((((((,...,,,{,{{{(((.......{{{|,,...)))}.}},,}})),))),((((.......,.))))|(((((((((.....)))))...)))),.)))..),.).)))))))))})}}}}....)))))))).)))})})..)))}}))..))))|....,,,......{{{{....,..,.)))}.))))))))))).,...{{(,((((((.{.......})))},))((((.{(((((((..(....(((((........)))))......)..)))))))),)))).,...,
Back