Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_VIM_0003500
Sequence Length
267 nt
GC Content
0.5468
GAAAUCCAGGAGCUGCAGGCUCAGAUUCAGGAACAGCAUGUCCAAAUCGAUGUGGAUGUUUCCAAGCCUGACCUCACGGCUGCCCUGCGUGACGUACGUCAGCAAUAUGAAAGUGUGGCUGCCAAGAACCUGCAGGAGGCAGAAGAAUGGUACAAAUCCAAGUUUGCUGACCUCUCUGAGGCUGCCAACCGGAACAAUGACGCCCUGCGCCAGGCAAAGCAGGAGUCCACUGAGUACCGGAGACAGGUGCAGUCCCUCACCUGUGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-78.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -83.40
Frequency: 0.0006
Diversity: 54.35
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
........(((((((.(((.((((.((..((((((.((((((......))))))..))))))..)).)))))))..))))).)).(((.((((....)))))))...........((((.(((.........(((((((((((((..(((.......)))..))).))).)))).))).))).)))).((((.((...(((..(((((..........))))).)))......)).))))..(((((((.((...)))))))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
........(((((((.(((.((((.{{..((((((.((((((......))))))..))))))..}}.)))))))..))))).}}.(((.((((....))))))},,,,....,},|(((.(((.,,....,.{(((((((((,,(,.(((.......)))..))).))).)))),))).))).))),.((((.((...(((..(((((..........))))).)))...,..)).))))..(((((((.{{...}})))))))...
Back