Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_VIM_0005800
Sequence Length
287 nt
GC Content
0.5122
GAGUCCACUGAGUACCGGAGACAGGUGCAGUCCCUCACCUGUGAAGUGGAUGCCCUUAAAGGAACCAAUGAGUCCCUGGAACGCCAGAUGCGUGAAAUGGAAGAGAACUUUGCCGUUGAAGCUGCUAACUACCAAGACACUAUUGGCCGCCUGCAGGAUGAGAUUCAGAAUAUGAAGGAGGAAAUGGCUCGUCACCUUCGUGAAUACCAAGACCUGCUCAAUGUUAAGAUGGCCCUUGACAUUGAGAUUGCCACCUACAGGAAGCUGCUGGAAGGCGAGGAGAGCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-78.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -83.67
Frequency: 0.0002
Diversity: 49.24
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.(((((((...........(((((((.((...)))))))))..)))))))..)((...(((..((((((.(((.((((....))))..((((..(((((.(((....))).)))))...)).))..........)))..))))))...)))(((((.((..((((((((..(((..(((.......))).)))..))).)))))..))...)))))(((((((((((......)))))))))))..(((((.((..(((....)))..))..))))).......))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.(((((((...........(((((((.{{...}})))))))..))))))).}{({...{((..({{{{{.{||,((((....))))..(({{..(((((.{({....)),.)))))...)).||,.....,{,,},}..,}))))...}}}(((((.((..((((((((..(((,.(((.......))).)))..))).)))))..))...)))))(((((((((((......)))))))))))..{((((.{(,,(((....))).,))..))))),,.,,}}})
Back