Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ZBTB44_0003800
Sequence Length
1407 nt
GC Content
0.4456
GACAUUUCUGAUUUAUUUGCAUCCUUGAAGAGCAUCUGUAGAAGAGGAAGUAAAAGAUGGGUGUGAAAACAUUUACUCAUAGCUCCUCUUCCCACAGCCAGGAAAUGCUUGGAAAGCUAAAUAUGCUGCGAAAUGAUGGACAUUUUUGUGAUAUCACUAUUCGUGUCCAGGACAAAAUCUUCCGGGCACAUAAGGUGGUACUAGCAGCUUGCAGUGAUUUCUUUCGCACCAAACUUGUAGGCCAAGCCGAGGAUGAGAACAAGAAUGUGUUGGAUCUGCAUCAUGUUACAGUGACUGGCUUUAUACCUCUUUUAGAAUAUGCUUACACAGCCACUCUAUCAAUUAACACAGAAAAUAUUAUUGAUGUUCUAGCAGCAGCCAGCUAUAUGCAAAUGUUCAGUGUUGCCAGCACCUGCUCAGAGUUCAUGAAAUCAAGCAUUUUAUGGAAUACACCCAACAGCCAACCUGAAAAGGGUCUAGAUGCUGGACAAGAAAAUAAUUCUAACUGCAAUUUUACUUCUCGAGAUGGGAGCAUUUCUCCCGUGUCCUCAGAGUGCAGUGUGGUAGAAAGAACCAUUCCUGUCUGCCGAGAAUCCCGGAGAAAGCGCAAAAGCUACAUUGUUAUGUCUCCUGAAAGUCCUGUAAAGUGUGGCACACAAACAAGCUCACCCCAGGUAUUGAAUUCUUCAGCUUCCUACUCAGAAAAUAGAAACCAACCAGUUGACUCUUCCUUAGCUUUUCCUUGGACUUUUCCUUUUGGAAUUGAUCGAAGGAUUCAGCCUGAGAAAGUUAAGCAAGCAGAAAAUACCCGGACUUUAGAAUUACCUGGCCCAUCUGAGACCGGUAGAAGAAUGGCUGAUUAUGUGACUUGUGAGAGCACAAAAACUACCUUGCCUUUAGGUACCGAAGAAGAUGUCCGGGUCAAAGUAGAAAGAUUAAGUGAUGAGGAGGUCCAUGAGGAAGUGUCCCAGCCUGUCAGUGCAUCUCAGAGUUCGCUGAGUGAUCAGCAGACAGUUCCAGGAAGUGAACAAGUCCAAGAGGACCUUCUGAUUAGUCCACAGUCUUCCUCUAUAGGCUCAGUAGAUGAAGGCGUUUCUGAGGGCUUGCCUACACUUCAAAGCACGUCUAGCACUAAUGCUCCUCCGGAUGAUGAUGAUCGAUUGGAAAAUGUUCAGUAUCCCUACCAACUCUACAUUGCUCCUUCCACCAGCAGUACAGAGCGACCAAGUCCAAAUGGUCCCGACAGACCUUUUCAGUGUCCAACCUGCGGGGUGCGAUUCACCCGUAUUCAGAACCUAAAGCAGCACAUGCUCAUCCACUCAGGAAUUAAACCAUUUCAGUGUGACCGCUGUGGGAAAAAGUUCACCAGGGCUUACUCGCUAAAGAUGCAUCGCCUAAAGCAUGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-380.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -406.56
Frequency: 0.0000
Diversity: 385.00
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....((((((.((((..((((((.(((..(((...((((.((((((((..((..((.(((((((....)))))))))..))..))))))))..))))(((((.....)))))..(((.......)))(((....(((((.....(((.((((((((((....((((((.(((........)))))))))....)))))))...((.(((((((((((......))))........)))))))...))...(((((((......((((((.((......)).))))))...(((.(((.(((((....(((....(((((((...............(((((((................)))))))(((((((((..((..((.((((...........)))).))..))..))))).))))..((((((((.....))))))))((((.(((((..(((...(((((((((((.(((.(((((((((((((((.....)))).((((((.......((((.((.(((((((.....))))))).))...)))))))))).(((((((.((........)).)))))))........(((((....((((........))))....))))).((..((.((...((((((((((........(((((...((.((((((...((((...((((.((.(((((........(((......)))............(((..(((((.(((..((((....))))..).)).)))))...))))))))..))..))))....)))))))))).))...((((((...(((.......(((((.((.(((((.(((.(((((....((((.(((....)))))))....((((.((((((...((((.(......).)).))))).))).))))........(.((((.(((((((((....((((.((((...((..((((......(((((......)))))))))..)).)))).)))).(((..........)))....))))))))).)))).)...)))))))).))))).))))))).......)))...))))))))))))))).))))))...)).)).)).((((....))))..(((((.((((....)))).)))))...)))))))))))........((((..((((((.........))))))..)))).(((((........))))).....)))))))))))).)).....)))..)))))..))))...))))))))))...)))))))))))...)))))))..))).))).....)))))....)))....(((.((((((....))).))).)))...)))..))).)))))).....)))).)).))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
,...{{((({.{{{{..{{((({,{{{..((({{{((,{.({((((((.,({..((.(((((((....)))))))))..)},,))))))||{{||||({{((..,,{|||||,.{((....,.,|||(((({{((.,,.,|||||||||..(((((((.,..((((((.(((........)))))))))....))))))},,,|||{.{{{|,((((......))))..}},.,,}}}}|||,,.))},,{({((((.,||.,||{{{{,{{....,|)},}}}}}}.,,(((.(({{(({{{....{{{....(({{{{({,.....}}}.....{((((((................))))))){((((((((..((..((.{{{({,....,}...)))).))..))..))))).)))},,((((((((.....))))))))((((.(((((..(((...(((((((((((((((.(((((((((((((((.....)))).((((((.......{{((.((.(((((((.....))))))).))...)))))))))).{((((((.((........)).))))))}......,.(((((.,,,{{{{..,,....}}}}..,.))))).|,..({.((...((((((((({.......,((({{...((.((((((...{{((,,.((({.{{.,{{,{......|..........|||{{{{.{{.{((((((..(((((.(((..((((....))))..).)).)))))...))}})))),}))}})))}}}),})}})))))).)).{,((((({...(((.,..,,,((({(.((.(((({.(((.(((((....{(((.((({,{.,},)))),...|{((.{,|||{...||}|||,.....},}},))))),}},.})}}...,,,..,.((((.(((((((((.{..(((,.((((,..{{((({{,,,,...(({{{.....,))))},,,}}})).)))).}}}).||,...,.,}}..)))..,.))))))))).)))),),..)))))})}.))))}.))}))}).,,,.,.))),,.))))))))))))))).))))))...)).)}.,,.((({....))))..(((((.((((....)))).)))))...)))))))))))........((((..((((((.........))))))..)))).(((((........))))).....)))))))))))).)).....)))..)))))..))))...}))))}))))...}}}})))}}}}.}})))}}}|.,...{{{{,.....,}})))}}})},.,,})))|||||,.,{{{||.,,,})))}}.,,}.})},,)))))}.....,}},,)).))))
Back