Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ZBTB44_0005300
Sequence Length
672 nt
GC Content
0.4256
GACAUUUCUGAUUUAUUUGCAUCCUUGAAGAGCAUCUGUAGAAGAGGAAGUAAAAGAUGGGUGUGAAAACAUUUACUCAUAGCUCCUCUUCCCACAGCCAGGAAAUGCUUGGAAAGCUAAAUAUGCUGCGAAAUGAUGGACAUUUUUGUGAUAUCACUAUUCGUGUCCAGGACAAAAUCUUCCGGGCACAUAAGGUGGUACUAGCAGCUUGCAGUGAUUUCUUUCGCACCAAACUUGUAGGCCAAGCCGAGGAUGAGAACAAGAAUGUGUUGGAUCUGCAUCAUGUUACAGUGACUGGCUUUAUACCUCUUUUAGAAUAUGCUUACAGCCACUCUAUCAAUUAACACAGAAAAUAUUAUUGAUGUUCUAGCAGCAGCCAGCUAUAUGCAAAUGUUCAGUGUUGCCAGCACCUGCUCAGAGUUCAUGAAAUCAAGCAUUUUAUGGAAUACACCCAACAGCCAACCUGAAAAGGGUCUAGAUGCUGGACAAGAAAAUAAUUCUAACUGCAAUUUUACUUCUCGAGAUGGGAGCAUUUCUCCCGUGUCCUCAGAGUGCAGUGUGGUAGAAAGAACCAUUCCUGUCUGCCGAGAAUCCCGGAGAAAGCGCAAAAGCUACAUUGUUAUGUCUCCUGAAAGUCCUGUAAAGUGUGGCACACAAACAAGCUCACCCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-174.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -186.64
Frequency: 0.0000
Diversity: 196.49
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.((((.((.((((((.((((((((........((((.((((((((..((..((.(((((((....)))))))))..))..))))))))..))))(((((.....)))))..(((.......)))..((((((.....))))))(((..(((((((....((((((.(((........)))))))))....)))))))...)))(((((((((((......))))........))))))).....)))))))).(((((...(((((((((..((((....(((((.((((.(((....((((..(((...))).))))....))).)))).(((((((................)))))))...)))))))))))))).)))).....)))))..(.(((((((((.(((.......((((((((((.....))))))))))....((((..(((.....)))....)))).))).)))))).))).))))))).))..((((((.......((((.((.(((((((.....))))))).))...)))))))))).(((((((.((........)).)))))))........(((((....((((........))))....))))).)))))))(((....(((.(((..........))))))..)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.((((,{{..{,(((,((({{{{{...,{{,,((((.((((((((.,({..((.(((((((....)))))))))..)},,))))))))..))))((({(....,)))))..(((,.....{|||((({{{((,,{.,|||||||||,.{((({({.,..((((((.(((........)))))))))....||||||},,,{{{({((({{((((......))))..,,..,,}})))))...}}}}}}}}|},|{|||,||||||{|{{,.,,||}},},||||,.|||{,{{||||.{{....{{,...}}}...,},,...))))),},||{{{{{................)))))))}|||,||||},,,.,||,,,||}},,,}|||||||||{||,,||,.||},|,||,|((((((((((.....)))))))))}....,,,,..,,,....,)))...,))}},||},))))))})}|{{{.....}))}.((((((.......{{((.((.(((((((.....))))))).))...)))))))))).{((((((.((........)).))))))}........(((((.,..((((........))))....))))).)))))))(((....(((.(((..........))})))..)))
Back