Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_ZFR_0000900

Sequence Length

2625 nt

GC Content

0.4491

GAUUCAUACUCAUAUGUAAGGUCCACAGCUCCUGCUGUAGCUUAUGAUAGUAAGCAAUACUACCAACAACCAACAGCAACUGCUGCUGCUGUAGCUGCCGCUGCCCAACCUCAGCCUUCUGUUGCUGAAACUUACUAUCAGACAGCCCCCAAAGCAGGUUACAGCCAAGGUGCAACUCAGUAUACUCAAGCCCAGCAAACUCGACAAGUGACAGCCAUAAAACCAGCCACACCAAGUCCAGCUACCACUACUUUCUCCAUCUAUCCUGUAUCCUCCACCGUACAGCCAGUAGCAGCUGCGGCUACUGUGGUGCCAUCCUAUACUCAGAGUGCUACUUACAGUACCACAGCAGUUACAUAUUCUGGUACGUCUUAUUCAGGUUAUGAAGCAGCAGUGUAUUCAGCUGCAUCUUCCUACUAUCAACAGCAGCAGCAGCAACAGAAGCAGGCAGCAGCAGCAGCUGCUGCUGCUGCUGCAACAGCUGCCUGGACAGGGACCACCUUUACUAAAAAAGCACCAUUCCAAAAUAAACAACUGAAACCAAAACAGCCUCCCAAACCACCACAGAUUCACUAUUGUGAUGUUUGUAAGAUCAGCUGUGCUGGACCACAGACUUAUAAAGAACAUUUAGAAGGACAGAAACAUAAAAAAAAAGAAGCUGCAUUGAAAGCCUCACAAAAUACCAGCAGCAGCAACAGUUCUACUCGUGGGACUCAAAAUCAGCUACGUUGUGAGCUCUGCGAUGUGUCUUGUACAGGAGCAGAUGCGUAUGCUGCCCACAUUCGUGGUGCUAAGCAUCAGAAAGUGGUUAAGUUACACACAAAACUUGGUAAACCCAUUCCAUCAACAGAACCAAAUGUUGUUAGCCAAGCUACUUCUUCAACAGCUGUAUCUGCUUCAAAGCCGACUGCCUCUCCUUCAAGCAUUGCAGCAAACAAUUGUACUGUGAAUACGUCAUCAGUUGCAACGUCUUCAAUGAAGGGUCUUACGACUACAGGAAACUCGUCUCUUAAUAGCACAUCUAACACUAAAGUAUCAGCAGUGCCUACAAAUAUGGCUGCCAAGAAAACAUCUACCCCCAAAAUAAAUUUUGUUGGUGGUAAUAAGCUGCAGUCAACAGGAAAUAAAGCAGAAGACAUAAAAGGAACCGAAUGUGUUAAAAGUACUCCUGUCACUUCUGCUGUGCAGAUUCCUGAAGUAAAGCAAGACACAGUGUCAGAACCAGUCACACCUGCAUCUCUUGCUGCUUUACAGAGUGAUGUGCAGCCAGUGGGCCAUGAUUAUGUGGAAGAGGUACGAAAUGAUGAAGGAAAAGUAAUUCGGUUCCAUUGUAAAUUAUGCGAGUGCAGCUUUAAUGAUCCCAAUGCUAAGGAGAUGCACUUAAAAGGGCGAAGACACAGACUUCAAUAUAAAAAAAAAGUAAAUCCAGAUUUGCAAGUAGAAGUAAAGCCUAGUAUUCGAGCAAGAAAGAUUCAAGAAGAGAAAAUGAGGAAGCAAAUGCAGAAGGAGGAGUACUGGCGAAGACGAGAAGAAGAGGAGCGUUGGAGAAUGGAAAUGAGACGUUAUGAAGAGGACAUGUACUGGAGGAGAAUGGAGGAAGAACAACAUCAUUGGGAUGAUCGCCGCCGAAUGCCAGAUGGAGGUUAUCCUCAUGGUCCUCCAGGCCCAUUAGGCCUUCUGGGAGUCCGACCAGGCAUGCCUCCUCAGCCUCAGGGGCCUGCACCCUUACGUCGUCCUGACUCAUCUGAUGACCGUUAUGUAAUGACAAAACAUGCCACCAUUUAUCCAACUGAAGAGGAGUUACAGGCAGUUCAGAAAAUUGUUUCUAUUACUGAACGUGCUUUAAAACUCGUUUCAGACAGUUUGUCUGAACAUGAGAAGAACAAGAACAAAGAGGGAGAUGAUAAGAAAGAGGGAGGUAAAGACAGAGCUUUGAAAGGAGUUUUGCGAGUGGGAGUAUUGGCAAAAGGAUUACUUCUCCGAGGAGAUAGAAAUGUCAACCUUGUUUUGCUGUGCUCAGAGAAACCUUCAAAGACAUUAUUAAGCCGUAUUGCAGAAAACCUACCCAAACAGCUUGCUGUUAUAAGCCCUGAGAAGUAUGACAUAAAAUGUGCUGUAUCUGAAGCGGCAAUAAUUUUGAAUUCAUGUGUGGAACCCAAAAUGCAAGUCACUAUCACACUGACAUCUCCAAUUAUUCGAGAAGAGAACAUGAGGGAAGGAGAUGUAACCUCGGGUAUGGUGAAAGACCCACCGGACGUCUUGGACAGGCAAAAAUGCCUUGACGCUCUGGCUGCUCUACGCCACGCUAAGUGGUUCCAGGCUAGAGCUAAUGGUCUGCAGUCCUGUGUGAUUAUCAUACGCAUUCUUCGAGACCUCUGUCAGCGAGUUCCAACUUGGUCUGAUUUUCCAAGCUGGGCUAUGGAGUUACUAGUAGAGAAAGCAAUCAGCAGUGCUUCUAGCCCUCAGAGCCCUGGGGAUGCACUGAGAAGAGUUUUUGAAUGCAUUUCUUCAGGGAUUAUUCUUAAAGGUAGUCCUGGACUUCUGGAUCCUUGUGAAAAGGAUCCCUUUGAUACCUUGGCAACAAUGACUGACCAGCAGCGUGAAGACAUCACAUCCAGUGCACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-745.40 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -794.85

Frequency: 0.0000

Diversity: 679.47

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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