Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_ZFR_0007400

Sequence Length

681 nt

GC Content

0.4244

ACUUAUAAAGAACAUUUAGAAGGACAGAAACAUAAAAAAAAAGAAGCUGCAUUGAAAGCCUCACAAAAUACCAGCAGCAGCAACAGUUCUACUCGUGGGACUCAAAAUCAGCUACGUUGUGAGCUCUGCGAUGUGUCUUGUACAGGAGCAGAUGCGUAUGCUGCCCACAUUCGUGGUGCUAAGCAUCAGAAAGUGGUUAAGUUACACACAAAACUUGGUAAACCCAUUCCAUCAACAGAACCAAAUGUUGUUAGCCAAGCUACUUCUUCAACAGCUGUAUCUGCUUCAAAGCCGACUGCCUCUCCUUCAAGCAUUGCAGCAAACAAUUGUACUGUGAAUACGUCAUCAGUUGCAACGUCUUCAAUGAAGGGUCUUACGACUACAGGAAACUCGUCUCUUAAUAGCACAUCUAACACUAAAGUAUCAGCAGUGCCUACAAAUAUGGCUGCCAAGAAAACAUCUACCCCCAAAAUAAAUUUUGUUGGUGGUAAUAAGCUGCAGUCAACAGGAAAUAAAGCAGAAGACAUAAAAGGAACCGAAUGUGUUAAAAGUACUCCUGUCACUUCUGCUGUGCAGAUUCCUGAAGUAAAGCAAGACACAGUGUCAGAACCAGUCACACCUGCAUCUCUUGCUGCUUUACAGAGUGAUGUGCAGCCAGUGGGCCAUGAUUAUGUGGAAGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-161.00 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -174.79

Frequency: 0.0000

Diversity: 220.70

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((................((((((.((...............((.(((........))).))((((.((((..((((.(((.((((.......(((((.............)))))))))..)))))))...)))).))))...((((((((((((...((((.((((.(((.((((((...))))))))).))))(((((((........)))))))..............(((((........))))).((((...)))).........))))))))))))))))...((.....)))).))))))..((......))......(((((((((((.....))).))).)))))...((((...))))((((....))))...........))(((((....((((..((.((......))...))..)))).........(((((((..((.......(((((..(((((....)))))..))))).......)))))))))((((((..........((.((((............)))).))........))))))((((...((((((((.((((.((((((..(((((((..(((.((..((.....))..)))))....)))))))))))))..))))..)))))))).))))..((((......)))))))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

((...,,,{.....,}},{{{(({.{{...............{{.(((,,......}}}.}}{{{,.,,,,..{{{{|{{|...(({{{,{,,(((((|,|{,.....,.,}}}})}}}})))})))))}},)))}.})}}...((((((((((((...((((.((((.(((.((((((...))))))))).)))),,,{(((........}}}||((,.............({{{{........))))),|{||..,)))).........))))))))))))))))...{{...|||}}}.}}}}}}..{(.{{{{{||......,|||({{{(({.....))}.})))))))).)}||{{..,))})|(((....)))}..,{,...,,.))(((({....((((,,({.,{,,....||...}}..)))}{{{{,..,,((((({(..,{.......{((((.,(((({....,})))..))})),,....,|||||||||.((((((....((((((((,,,,...{(((....................))))}}..)))))))).......))))))..(({{(((((((..{{({({,,{,.....,,,,},}))..,,)}}}}})))))))}...,})))})))))},,}},)))|||,.,,.))))})))))