Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_ZFR_0011300

Sequence Length

466 nt

GC Content

0.3863

AUGGGGUUUUUGCCAUGUUGCCCAGGUUGGUCUCAAGCUCCUGGAUUCAAGCGAUCCGCCUGCCUUGGCCUCCCAAAGUGCAGGGAUUACAGGCCUGAGCCACCGUGCCUGGUGAAUUCUUUCAUCUUUUGUGAAGUUUGUGCACUAAAAUAUACUUGAUAUGGUUCAUUAGUGGACAAAUGCUGAAAACAGAUGCUUUAUAUAAAAGUGAUUGGAAAAAAGUAGUUGGUGUAGAAAUGAGUUAUUAGAUUAAACAUUCCAAAUCUAAAAUUGAAAAUGUUUUGCAGGUAGGGAGUAAAGAAGAUGGCCAUCUCUUUAACAAAAUAGGAGCCAUCAGACAUUUCAGAAAAAAUUUUUAUGGAUUGUAUUUUGACCCUGCAAGUGCAGGAAGAAGAACCAGAAGUAAUGAUGAACCAGAUAGAACUUGUUAGAGAUAUAUUUCAAAUCUGGAGUCAGCAUUUGUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-109.90 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -120.56

Frequency: 0.0000

Diversity: 137.50

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((.(....).)))).(((((((((((((.((((.(((..((((((.....))))))((((((((((....)).))).))))).......))).)))))))....)))))).......((((((.....)))))).((((.((((((.....(((......)))...)))))).))))(((((((...((((((((((.....)))))((((((((.....(((((...((((.......))))..)))))....)))).)))).....(((((((((((((((((((......((((((.(((....))))))))).(((((((.((.((((.(((.((((......)))).))))))).)).)))))))..(((((....)))))..................................))))))..))))))).)))))))))))...)))))))..)))).

Thermodynamic Ensemble Prediction

((((.{....}.)))).((((((((((((({((((.(((..{(((((,....)))))}((((((((((....))}}}).))))).......))).))))}})}},.)))))),,,,...,||||{,....}}}}}|,{(((.((((((.....(((......)))...)))))).)))|{((((((...((((((((((.....)))))((((((((.....({{((,{{{{{,.......,))),,})))}....))))}}})).....{{{{{{{{{((({((({((,.|,..{{{{(,,(((....}})))))}}.(((((((.{{.((((.{((.({((......}}}},))}}))).}).)))))))..(((((....)))))........,|,..,,,..|,.,...,,,......})))))..})))))).))))}})))))...)))))))}.)))).