Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ZNF292_0001200
Sequence Length
2745 nt
GC Content
0.3982
CUGGUGUUCUUAAAAAGAGGGAACAUGCCUAGUUUGCUGAAUUGUAAGUAAUUAAAUCUUGUUGAAUGGUUUUCUCCUUGAAUAGGUGGUUUCAAUUUUUGGAAGAAAGGUGAAUUUUGUGCCUUUAAGAAGCUGUUCUUUACUGAAAUUAUGUUACUUUUGACUAUUCUUAUUUCAUCUCAUUUCUGAAUUGGAUAUCUAUAUUCAGGGCAAGGAUUCAGUUUGAUCAAACAGUUCUUAUAAAGCAAAUGUGAGUGUAUAAUAAGUAGUAGUACUCUUAUUAGCUUACAUUUAUUAAAGUUAUAUGCCAGGAACUGUUACGUUUGUGUGUUGUGUAUGUCUGCCUAUGUGUAUAAGAGAGAGGGAAAUUAUUUAUUUAGUCCUCAGCACCUCUCUGAAAUAGGUGGUUACUAUCCCUGUUUAUUUAUGAGACCACUAAGGUACAGAGAUGUAAAAUAACGACCUAGUCAAGUAACUAGGAAUUUUUAACAACACAAGAAAAGCAGAACCCAAACUAAGUAAAACAUUUUAUUUCUUUUUUUAGGGACAGUGUGUAGGUGUGAUUGUUGAAGUUUGCUUUAGGGUACUAAAGGAAUUUGUGAAAGAAAACUUGAAUCUUUUGAAACUAAGUUUCAGGAAAGCAGAAUGUAAGCAUUUUACCCUUGUGGAGGCUUAGUAAUACCCUUAUUUAAGAAUGUGCUAAUUAGGGUUCUUUAUUCUAUAUUAGUGGGAAUUUCAUUAGUUUUGAAUUUAAGUGAUGUAUAGGCCCUUUAAAGGUUGAAUAAUACAUAUUUAUGAACUAUAGUGAUAGCAAUUUGUUGCAGACAUUGUUUCCCAAUCUUUAAAUAUUAAUAUAAGAUUAUUUGUUUUAUUGGAUUAAACAAAAACAAGUCUGUAUUUGUGAUAUAUGUGGCUUUUUUUUUUUUUUUUUGGGAGAUGGAGUCUCACUCUGUCGCCCGGGCUGGAGUGCACUGGCUUGAUCUCAGCUCACUGCAACCUCCACCUCCCAGGUUCAAGAGAUUUUUCCUGCCACAGCUUCCCGAGUAGCUGGGAUUACAGGUGUGCACCAUCAUGCCCAGCUAAUUCUUGUAUUUUUAGUGGAGACAGGGUUUCACCAUGUUGGCCAGGAGGGUCUCGAACUGCCAACCUCAGGUGAUCCGCCCGCAUCAGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGAAUGAGCCACUGUGCCUGGCCAAUGUGGACUCUAUAUGGUAUAAAGGAGUAUGUAAACUGUGGAGAGAAGUAGGGCUAUUUUCUACAGCAGUGGUCUUCAAAUUUUUUAAUUGGGUACCUUACCAGAAAACAUUUGAAUAGAAAACCUCAAUAUAAGUAUGUCUAAUUAUAAAUCAUAUGUAUAAAUAUAUAUACUAUUUCGGCUUAUAUAGUUUUUCAAGUCUGUUUAUGAUGUAAUUUUAUGUUUCAGAACAAUUUAAUAUACUUUUUUUCCUGCUGUACUUCAGUGUACAUCCUCUGUUUGGAAACCACUAGUUCAUAGUGCUGUGAGUAAUGAAGUUUUCUAAGAAUACAUUAUUAAAUAACUGCCUGAUUUAUUUGCCCUAUUUCCUCCAUGUACGGAGACAUUACAGCAACAGCCCAGUCAGAUUUUUUUCAUGCUAUCUUUUAGUCAGAUUUAAUUUAAUGUGUAUUUCUAGUUUAUUGCUUCUGCCAUGUUUUAUUCUUUAUGAAGAUCCCCGAGUAUUGAGUGUGCCAGUUACCAGAUUCUCUCCCAGCUCUAAAUUACCUCUUCAUUACUUGAUCUGCAAUAUUGGAGCCUAACCCUUUAGGCCAGGGGUGUCCAAUGUCUUGGCUUCCCUGGGCCACAUUGAAAGAAUUGUCUUGGGCCACACAUAACAUACACUAACAAUAGCUGAUGAGCUGAAUCGCAAAACAAAACAAAACAAAAAAACAGAACAAAACAAAAACCUUAUUUACAAAUUUGCAUUGGCCCGCAUUCAAAGCCAUCCUGGGCCACAUGUUGAUGUUGAACAAGCUUGCCUUCGGCAUUUCUUCUUUAUGUGAUGUUAAUUUUGUGAGUGGAGAGUGCUGGAAGGACAGUGCACAAGGGCGGGCUUAUGGUUUUGUUUCUUCUUACUGUGAAUGCACGGCUGCCAGUAGUGUGGCUAUGGAUAUCCAGGGGUCCUCUGCCCCAAGUAUGUGCCAAGAGCAGACAGACCCUUGUCUAGCUCACAGCCCCAGCGUCAGCUUAGUGACCUCCUCUCUGUAGUUUUCCCAGCAUGAGGCUGCACACCCCAGACCUCAUGCCUGCCUUCUGGAGAGCCAGCUGCCAAUAUUCCAACUUCCCCUGCAUGUCUACUUACACUCAGGAGGGCUUUCCUUGUGCAGGCCCUGCUGGUAAUGAGAUUCUCAAUGUCCCAACUGACUGUGUAUGCUCAACCUCGAGCCCCUUAAGCCCCAGCAACCACAGGGAGAACUACUUUGCCAUCCAGUGGGCUGCAGCCAUAAUUCCAAUAAGGCCUGAACCCUAGUUAUGGGGAGUGGGGACCCUCUUCUAAGUUUGUUCCUUCCGUGGAUACCCUCACUCAGCCCUUGAGUACUUGAGUAUUCUUCAGAAUUUUCAUUACACAUUGAUAGUUAUUUUCCUAUUACAAUUAAUAAUUGUAAUUGAGAGUUCCCUGAUUCCCCUUGCAGGAGGUGUGACAGAGGUGUGGCUCACCUGCUUGGUCGCCCCGCAGCUCAAACCCCUAGGGCGAGCAUGCAGACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-740.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -798.33
Frequency: 0.0000
Diversity: 763.23
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((.....(((((((((((.(((.((((((((...((((((((((.......(((((.....(((((..(((((((((...(((((((((((..(((((..(((((((.(..(.....(((((((((..(((......))).....)))..)))))).....)..).)))))))..))))))))))))).)))..)))))))))....((((((((((.(((((((((((((((((.(((((((((((((...(((((((.(((...))))))))))))))))))))......))).))))...)))))))))..(((((((((((((((..((((.((((...((((((((((((((.........................))))))).(((((((.(((....)))))))))).......(((((.((((((((((....)))..........((((((......))))))((.(((((((((((((......(((...((((((..(((.(((........))))))..))).)))....))).....)))).))))))))).)))))))))))).))...((((.(((((..((.((....((((((((((((((((((((((....(((.((((((....))))))...)))...))))))))))...(((((.(((............))).)))))...((((((.((.((((.(((.....(((((.((........)).)))))......))).))))..)).))))))((((((((((((((((((....))))........(((((((.((((((.(((((...((((((............))))))....))))).........)))))))))))))))))))).)))))))...................(((.((((((((...)))))))).)))(((.(((((((((.(((((.(....)))).)).))))..)))))...)))...)))))))))))))).))..))))).))))....((((((((......(((....)))......))))))))...)))))))...))).).))))(((((....((((((((((((((.((((...((.(.(((.......)))).)).))))((....)).(((((......))))).(((((..........))))))))))))))))))))))))(((((((....(((((((.(((((((((((((.((((((((((.........(((((((....(((((((.((((..((((........)))))))).)))))))((((((((.(((.(((((((((((..(((...((((..(((((((....)))))))..)))).(((((..(......)..)))))(((((..((((((....))))))...))))))))..))))))))..........(((((......)))))(((.......)))...(((((.....)))))......))).))).))))))))..................)))).)))........))))))))))))))))....(((((...((((..........((((.((((..................)))).))))..........))))))))))))))))))))))))))))))....(((..(((..(((((...(((((.((((.(((..((((...(((...)))...))))......)))...)))).))))))))))...)))..)))((((((....))))))((((((.(.((((....))))).))))))((((.((..((........)).))))))..))))))))))))..)))......)))))))))))))).........................)))))..))))).....))))))))))(((.(((((((((((...............))))))).)))).))).........((((((((((((((((.((((((((((.(((....))).)))))).)))))))))).))))).))).)).....))))))))...)))..))))))))))).....)))))).)))(((...(((((.(((((.((((((((..(((((.....)))))..).)))).))).((((((((((....)))))).))))...((....))((((......))))((((.....((((........(((((((((((.......))).)))))))))))).....)))))))))))))).................((((((((.((((((.(((((..((((((.......(((((.(((((.((((((.(((.(((((..(((.....(((.((......((((......))))......))...))).....)))..))))))).).))))))..))).)).)))))(((.............))).....(((.......)))((((((((................(((((......))).)))))))))))))))))))))...))))))....(((((((((((((((((.((((((.((.((......)).)).))))))...))))).)))))))))..)))....((..(((((..(.((.(((....))).)).).)))))..))((((((.................)))))))))))))).)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((((.,,..(((((((((((.(((.((((((((.,.((((((((((.......{((((.....(((((,,(((((((((,{,(,,((((((((..(((({..(((((((.,..{.....,{((({(((..(((......))).....))}.,)),})}.....,..,.)))))))..))))))))))))),))),,)))))))))...|((((((((((.(((((((((((((((((.(((((((((((((..{(((((((.(({...))))))))))))))))))))......))).)))}..,)))))))))..(({,{((((({(((({(((,,.,,((({{((...,,((((((({..,{,,......},,}.,,,....})))))).,{{{{((,(({....}}||||||||..........((((((((((((({.,.,{{......,,..((((((......)))))),,.{((((((((((((......(((...((((((..((({(((....,}}}))}}})..}}}.)))....))).....)))).))))))))).}}.|(((((....)))))|(((.(((((..(({({,,,,((((((((((({((((((({((|,{{{{(.((((((....)))))}.,.|}}.,|)))))))))}...(((((.{{{..{{......||}}}.))))}...,,{{((.{,{((({{(({....||||||,|{..,,,,..)),}}}}}.,,},,))},||||||||,|}||||{{{{{{{||||{{{,,({{{,,,|,|{{.....,|||{{{{.|{{{{{..,|{{|||||||,,..,,|{,}||}}},||{|{{|,,,.|,,..,}}}}}})))))))))))}|}}}}}},))))}}}}}},...............(((.((((((((...)))))))).)))(((.(((((((((.(((({,(....)))).)).))))..))))).,.))),}}))))))}}}})))),})..))))).)))}.{{{((((((((......(((....)))......)))))))}.}))))))))}}}))))))})))||||,....((((((((((((((,(((({{,(,.({(,{.....,,|||||||.}}}|((,,..||,(((((......))))).{((((..........))))})))))))))))))),}}},(((((((....{((((((.(((((((((((((.((((((((((.........(((((((....(((((((.((((..{(((........)))))))).)))))))((((((((.(((.{{{{(((((((..({{{..,,,,..{({((({,..,}}))))),.,,...(((({..|..,...,..}}}}}(((((,{(({{{{....}}}},,,}}}))))}}}..)))))))}...,,,,.,,(((((......))))){{{.......))),,.((({(,,...}}}}),,}}}.))}.))).))))))))..,......,,....,,.))))},))........)))))))))))))))},,..{,{{{|,.{{,.{{....}}...,,.,((,,....||..((((.....)))}||}},..,,,,,,})})),,,,,,})))))))))))))))))))))....{((..,{{},|||||...{{{{{.||||,{||..||||...|||,,}})}...}}}|{{,,..},,....|||.}}}})))}}}...}}},,)))((((({....})))))((((((.(.((({....})))).))))))((((.((..{{.,......)).))))))}}))))))))))))}.}))}..}},)))))))))))))).....................,,,,..,.,..,,,,}.....)))))))))){||.{((((((((((,.......,,.....,)))))).}))}.,}},,....,..(((((((((((((({{(((((((((((.(((....))).)))))).))))))))))}))))).))).)).....))))))))...)))..)))))))))))..,,.)))))).)))((((({......||||..((((((({..(((((.....)))))..}.)))).))}.((((((((({....}))))).)))).(((({{,{(,((((......))))}}.......(((((((((((.(((((((((((.......))).)))))))){{{(,....||||{((({|,.,...............,.((((..(((......}))..)))),|||||}}}}....}|})}|,,(({(((,..{(((...||||.,(({......}}},.,,...((((......))))..,,,.,}..}))))}...,},)))))))))))..,},,...,,).)))))),|((({({.,{{.....{,||{{...,(((.{,...|||(((((((({,.,{{.....,,...{,{({......))).,,,}}}||||||.,,})))))...|||}}},,}.,,,|(((({((({{{{{.{{{{{{.{{.,,......||,||,||}}}}.,,)))))}.))))))))}}},)}}}}}}.,)))))}))},},,..}}},})))))),,,((((.((.((((((...,{............)))))).)).)))).}))
Back