Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_ZNF292_0001300

Sequence Length

2836 nt

GC Content

0.4718

AUGGAGUCUCACUCUGUCGCCCGGGCUGGAGUGCACUGGCUUGAUCUCAGCUCACUGCAACCUCCACCUCCCAGGUUCAAGAGAUUUUUCCUGCCACAGCUUCCCGAGUAGCUGGGAUUACAGGUGUGCACCAUCAUGCCCAGCUAAUUCUUGUAUUUUUAGUGGAGACAGGGUUUCACCAUGUUGGCCAGGAGGGUCUCGAACUGCCAACCUCAGGUGAUCCGCCCGCAUCAGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGAAUGAGCCACUGUGCCUGGCCAAUGUGGACUCUAUAUGGUAUAAAGGAGUAUGUAAACUGUGGAGAGAAGUAGGGCUAUUUUCUACAGCAGUGGUCUUCAAAUUUUUUAAUUGGGUACCUUACCAGAAAACAUUUGAAUAGAAAACCUCAAUAUAAGUAUGUCUAAUUAUAAAUCAUAUGUAUAAAUAUAUAUACUAUUUCGGCUUAUAUAGUUUUUCAAGUCUGUUUAUGAUGUAAUUUUAUGUUUCAGAACAAUUUAAUAUACUUUUUUUCCUGCUGUACUUCAGUGUACAUCCUCUGUUUGGAAACCACUAGUUCAUAGUGCUGUGAGUAAUGAAGUUUUCUAAGAAUACAUUAUUAAAUAACUGCCUGAUUUAUUUGCCCUAUUUCCUCCAUGUACGGAGACAUUACAGCAACAGCCCAGUCAGAUUUUUUUCAUGCUAUCUUUUAGUCAGAUUUAAUUUAAUGUGUAUUUCUAGUUUAUUGCUUCUGCCAUGUUUUAUUCUUUAUGAAGAUCCCCGAGUAUUGAGUGUGCCAGUUACCAGAUUCUCUCCCAGCUCUAAAUUACCUCUUCAUUACUUGAUCUGCAAUAUUGGAGCCUAACCCUUUAGGCCAGGGGUGUCCAAUGUCUUGGCUUCCCUGGGCCACAUUGAAAGAAUUGUCUUGGGCCACACAUAACAUACACUAACAAUAGCUGAUGAGCUGAAUCGCAAAACAAAACAAAACAAAAAAACAGAACAAAACAAAAACCUUAUUUACAAAUUUGCAUUGGCCCGCAUUCAAAGCCAUCCUGGGCCACAUGUUGAUGUUGAACAAGCUUGCCUUCGGCAUUUCUUCUUUAUGUGAUGUUAAUUUUGUGAGUGGAGAGUGCUGGAAGGACAGUGCACAAGGGCGGGCUUAUGGUUUUGUUUCUUCUUACUGUGAAUGCACGGCUGCCAGUAGUGUGGCUAUGGAUAUCCAGGGGUCCUCUGCCCCAAGUAUGUGCCAAGAGCAGACAGACCCUUGUCUAGCUCACAGCCCCAGCGUCAGCUUAGUGACCUCCUCUCUGUAGUUUUCCCAGCAUGAGGCUGCACACCCCAGACCUCAUGCCUGCCUUCUGGAGAGCCAGCUGCCAAUAUUCCAACUUCCCCUGCAUGUCUACUUACACUCAGGAGGGCUUUCCUUGUGCAGGCCCUGCUGGUAAUGAGAUUCUCAAUGUCCCAACUGACUGUGUAUGCUCAACCUCGAGCCCCUUAAGCCCCAGCAACCACAGGGAGAACUACUUUGCCAUCCAGUGGGCUGCAGCCAUAAUUCCAAUAAGGCCUGAACCCUAGUUAUGGGGAGUGGGGACCCUCUUCUAAGUUUGUUCCUUCCGUGGAUACCCUCACUCAGCCCUUGAGUACUUGAGUAUUCUUCAGAAUUUUCAUUACACAUUGAUAGUUAUUUUCCUAUUACAAUUAAUAAUUGUAAUUGAGAGUUCCCUGAUUCCCCUUGCAGGAGGUGUGACAGAGGUGUGGCUCACCUGCUUGGUCGCCCCGCAGCUCAAACCCCUAGGGCGAGCAUGCAGACAGGUAGGUGCAGAGACCAGGAGGAAGCUUUGGGCUCUUGGCCCCAUGGUAAUGUCUAGGGGUGAGUGCCUGCAACCCCACUGUUACAAAGCUCUUUCUUUCAGCUUUGCCGUCUGCAGACGGCUUUGAGUGUUAAUCAGCUCAAUGGACCCUCUGCUUUAUUGCAAGGAAGAGGGCCAGUGUGACAGCCUUCCAUAUCCCACGCUGUUCCCUAGCGUCCCGGAUCACACGCAGGCUCGAAGGAUGAGUGCAAGAUUUUACUGAAUGGUGGAGGUGGCUCUCAGUGAGAUGGAUGGGGAGCCAGAAGGUGGGGAGGGGUGGGGGAUAUAAUCUUCCCCUGGAGUUCAGCUGUUCUCAGCCAAACUCCUCUCAAUAUUCAGGUGCCUCUUUCCUCCUCUGCCAUGCCACCCUGCUGCUCUCUGCCGCUCUCCACCGCUUCUCUUGACAUUCAGCAGUUUGUGUGUGUGCCCACUAAGGUCUUGGGUUAAAUGGGGGCAAGAUGGGGGAAGUGGUGGGCCAAAGGCAACUUUUUGGGCGCAAAAACAGGAAUGGCUGUCCUCUUUUAGGGCCACUGGUCUUCAGACUUGAGUGUGGGGCAUUUGCCGGGGAUCUGCCCUCUUCUACCCAGUAUUUUCCUGUCUUCUGUUCAUGUGUAUAUGAAACUUUGCCUGUUCAAGUUAGGGUGUGGUUCUUUUUUGUUUUGUUUUUUUUUUGAGAUGAAGUCUCCCUCUGUAGCCUAGGCUGGAGUGCAGUGGCACUGUCUCGACUCACUGCAACCUCCGCCUCCUGGGUUCAAGCAAUUCUCCUGCCUCAGCCUCCCAAGUGGCUGGGAUUACAGGCACGCACCACCACACCCAGCUAAUUUUUUUUUAUUUUUAGUAGAGAUGGGGUUUCGCCAUGUUGGCCCGGCUGGUCUCAAACUCCUGACCUCAGGUGAUCCGCCCAUCUCGGCCUCCCAAAGUGCUGAGAUUACAGGCGCCCGGCGGUUCUCAUUUUUUUGAUUGGAUCCUACCAGAUGCAAUGGGCUAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-914.90 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -971.05

Frequency: 0.0000

Diversity: 627.68

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((.(....(((((((((((.(((.(((((((((.(((((.(....)))).)).))))..)))))...))).)))...((.((....)))).((((.......((((((((((((......(((....)))......))))))))...))))........)))).))))))))..).)))).((((((.(((((((((.((((((((.((((.((((.........((....)).(((((......)))))...(((((.(((((((....(((.(((((((((((((((.(((((((....(((((((.(((((((((((((.((((((((((.........(((((((....(((((((.((((..((((........)))))))).)))))))((((((((.(((.(((((((((((..(((...((((..(((((((....)))))))..)))).(((((..(......)..)))))(((((..((((((....))))))...))))))))..))))))))..........(((((......)))))(((.......)))...(((((.....)))))......))).))).))))))))..................)))).)))........))))))))))))))))....(((((...((((..........((((.((((..................)))).))))..........)))))))))))))))))))))))))))))).....((((....)))).....)))).....(((((((.(((....(((((.(((.(((((((((.........(((.....))).........)))))((((((....))))))((((((.(.((((....))))).))))))((((.((..((........)).)))))).......................))))..)))..)))))....)))............(((((.(((((((((((((((....................((((...........))))....(((((((((.(((((.(((((((.((.((((...)))).......((((((((((((.(((.....((..((((((((((((..(((.((......(((((((((...(((((.............(((((....)))))..((((......))))..((((((((..(((((.....)))))..).)))).))).((((((((((....)))))).))))...((....))((((......))))((((.....((((........(((((((((((.......))).)))))))))))).....)))))))))...)))............(((((.(((.((...(((((((((((((((((((.(.....).)))))))..((((((.(((.(((((..(((.....(((.((......((((......))))......))...))).....)))..))))))).).)))))).(((((((.((((((((((...(((......((((((.(((((....)))))(((((((..((((((.....(((((.(((.((((((.(((((((..(((..(((.((((((....))))))....((((((((((((((.((((((.((.((......)).)).))))))...))))).)))))))))((((..........)))))))..)))..)))).)))..))))((((.((.((((((.................)))))).)).))))...)).))).)))))....))))))..((...((((.((..(((((.(((......)))))))).)).))))))..)))))))(((((((((((.........))))))((((((....)))))).((((((........))))))(((.((((((.((((.....)))).)))))))))..))))).((((.((((.((((.((((((((((......(((((..((((((((((((.....(.(((((((((((.......((((((((((((((((....((.(((.(((..(((..((((((.((.((((((((((((((((........))))))((((((..((((....))))..))))))...............)))))))))).))))))....))..)))..)))))).))))))).)))))))).)))))))).)))))).)))))))))))))..))............)))......)))))).)).)).)))).)))).)))).((((....)))))))))).........))))))))))).........)).)))))))........))))))))))))..)).))).)))))..)))))))))))..))))))))))))..))....))).)))).)))))))).....)).)))))))))))).))))))))).))))))))))))))).)))))(((((...)))))....((.((((((((.(((((((((((((..(......)..))))))))..)))))...)))))))))).(((.......)))(((((((........)))))))......)))))))(((.(((......(((((.............))))).....))))))....))))))))))).)))))).))))...))))))))).))))....((((.((((((((((.....)).))))))))....))))...))))))))(((......)))..))))))).))..........)))))).

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((((((...)))))}}.(((((((.(((((((((.(((({,(....)))).)).))))..)))))...))).,,,....((((((((((((((((({....,.,(((((((((((......(((....)))......)))))))}.}}),||,..,....,,||||||,||},..,,)}.))}})),})))))))))))((((((((.((((.(((({{,,,.,..{,..,.||.({{{{....,.)))))...(((((.(((((((....(((.(((((((((((,{,,.(((((((....(((((((.(((((((((((((.((((((((((.........(((((((....(((((((.((((..{(((........)))))))).)))))))((((((((.(((.{{{{(((((((..({{{..,,,,..{({((({,..,}}))))),.,,...(((({..|..,...,..}}}}}(((((,{(({{{{....}}}},,,}}}))))}}}..)))))))}...,,,,.,,(((((......))))){{{.......))),,.((({(,,...}}}}),,}}}.))}.))).))))))))..,......,,....,,.))))},))........)))))))))))))))},,..,,,,{|,.{{,.((....}}...,,.,(({,....||..((((.....)))}|,}},..,,,,,,,),)),.,,,,})))))))))))))))))))))....,{{....,})}|,.,,,,|}}|...,.(((((((.{,.....{{....,,....(((((((.........(((.....))).........)))))))...........(((((((((.(.((((....})))).}))))})})).....,..(((((((.((((((((.{,...................,(({(..(((((..(((.(((((.(((((((((((((((,..{((((....,....,{{{,,.......,{,.{{{{(((({{{........}},.....||||||{||,|{|||.{((((((.((.,{((((((((({{(((((((((((.(((....))).)))))).))))))))))}))))).}|((((.(((((((((,(((((((..((((.........,,(((....)))((((((((,,....}|||..(((((({{,.(((((.....)))))..}.}))).))}.((((((((({....}))))).)))).{||||,.{{.((((......)))),,.......(((((((((((.{((((((((((.......))).)))))))|(((({....((((((((,{....................((((..(((......)))..)))).|))))))))..,.)))))}..{(((((...((((...}}}|..(((......))).,||...((((......))))..}}}..,..))))))......)))))))))))...,|,,,.,.}}))))))})))}))))..))},)))),)),...(((.......)))((((((((.....,.....,|...,,{{{......)))..,)))))))).))))))).))))}{(((....,}))}|{,.(((((((((((((.(((((..((((((..(((((((({...})))))))).))))))..((((..........)))).((.({(({((((({(,,,.,|}|||,|,.,||}|||||(((((((...(((...))).))}).|||(((({((,((({((.(((,..{(((((.,((({{{(((.{{,.(((((,(({....,,||}|||||,}}.}}}.||,|}}}}...,,..|||||||,,,,,,,,,})))))||||||,,,,}})})}.((((((........)))))).|{.{(((,({(,.....}}))))..|||||||{({(.(((((((((((....((((((((.(((((((..((((({(..((((((((((((.....,.(((((((((((.......((((((((((((((((....((.(((.,((.,(({,.({(((,,((.((((((((((((((((........))))))((((((..((((....))))..)))))).,,........,,..)))))))))).))))))....}),,)))..))}))).))))))).)))))))).)))))))).)))))).})))))))))))).,||{,,........)))),......)))))....))))))))))}}))))((((((,....}})}))}...,.......)))).)))))))|{{{...})}),)}))))))))}}}}},,,)})))))))),,,.)))|)}},.}},))))))}}},},,.}}}}},.)))))}}.))))).))))))).)))))).,,.)).)))))))}}))),))))}))))))))))))))))))))..))))).)))..)).)))..,,.,}}|}..((((.((((((((((((.........}.,})))))))..))))))))..})))))))))))))))).....(((((((........)))))))....,.))))))),,{.,,{..,,{,{{{{{.........,...})))),},}.)))))}....))))))))))).)))))).))))...)))))}))).))))....((((.((((((((((.....)).))))))))....))))...)))))))).{{......}}{(((.(((......))).))))))))....