Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_ZNF292_0004800

Sequence Length

914 nt

GC Content

0.4300

AAAGGCAAUUUUUACUUUCUGCGGAAAGGGUGCUCCUUGCAGAUGGAACAAUGGUGAGACCACACCCGGACAGGGGAGGGGAAGGAGUUCUUGUUCCUGACGCAGGUAUCCCCUACUGCUGUGUCAUUCCUGUAUUGGCUAGGGUUGGCCCGCACAGUCUAAGCUAAUUCCAACUGGCUAUUUUAAAAAGAGCAGGGGGUAUGAGCCAGAGUGGUAGGGUGAGUAGUUUGGCGGGAAGGAUGGUUAGAAACAGGUAACUAAAGGUGACUUAGGUCAGAGCAGGUGACCAGGGGUGACUCAGGUAAAGCAGGUGACCGGGAUGAGUCAGGAUGGACCAGGUGACCAGGGAACAGAUGUGAACUACUGAUUAGGACUGGUGGGAAAGUUGUUUACUGAAACUUAGAAGCAAGGGGGUGAAGAGAACCAGGAAGCUAAACUUUAAAAUGGAGAAUCAAAGAAUAAGAGAGCUGAACAUACUGACAUACUGAUUCUUUGAAGAGAAACUUGGGGUUCACUAUAUUUAACAGGAUCAAAGGAAAAGAAACCUGAAUUUCCAUAUGUUUGAUUAAAUGAGUCUUAAACCCUGAAGUGUGGAGAGGACCAAUUGUGGCAGUCUUCUGUGUUAUAAAAACAUUUAAUUAGAAUCUCUCUUCAUUUAGCAUAACUAUAGAACCUUUUAGACACUCCUAGAAUAUGCAGAGAAAUGGAAAACUUCAGAAGAUCCUUUACCUUUAUUGGAGGUAUACACAGUGGCUAUCCAAAGUUAUGUUAAAGCCCGACCUUAUCUUACCUCUGAAUGUGAAAAUGUAGCCUUGGUUCUGGAACGCUUGGCAUUAAGCUGUGUUGAACUUUUACUGUGUCUGCCUGUUGAGUUAUCAGAUAAACAGUGGGAACAAUUUCAGACACUGGUGCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-233.40 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -253.99

Frequency: 0.0000

Diversity: 206.51

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((..........))))((((((((.(((.(((((((.(...........((((...))))..(((.....)))....).))))))).))).))))((((((((.............))))))))(((((((...(((((...((.((((...((.(((..(((....((..(((.((.(((...))).)))))..))....))).))).))...)))).)))))))..)))))))...((((((........))))))..((((((((((((((.......)))))(.(((((((.(((..((((....(((((((..(((((((((.((..((((..((((((((.....((((....(((...(((((...((((((((((((((((.((((...))))))))))(((((((((.....(((((...((...(((((.....((((((((.......((.............)).......)))))))))))))))...)))))..))))))...((((((((((((..............((((((((((((...((((((((((((.(((((....((........))..)))))...((((((((........))))))))...))))))))))))...(((((.......(((((...........((((((......)))))))))))))))).)))))))..)))))..)))))).(((((((...)))))))......((((((......)))))))))))).)))...))).))))))))))))..)))...))))..))))))))))))..)))))))).)))..))).))))..))))..))).))).)))).)))))))))).......(((((..............)))))..))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

((((..........))))((((((({.(((.(((((((.(...........{{((...}})}|.(((.....}))}.,,).))))))).))).})))(((((((({{{.....,,},.)))))))){((((((...{((((...((.((((.,.((.(((..(((.,,.((..(({,((.{(,...,}}.)))))..)).,,.))).))).)),,.)))).)})))))..)))))))...((((((........))))))..((((((((((((((.......))))){.(((((((.(((..((((....(((((((..(((((((((.((..((((,.{(((((((.,{,.,,,{...,{{{...{{{((,..(((((((,{{{(((((.((({...)))))))))},((((((((((({.,,,,({..{{,,.{{{{,...}}}||..(((((((({.((....,........,.,.....)).)))))))))......((((((((((.(((.(((((((,,((({....(((((,,....}}...)))))....})))}.))))))))))....)))))),))))..{{((({{{({,....}}}..,)))))}{((((.....}))))....,}}}..}}))))))))|(((((((((((...,....((((((......)))))}......,.....,(((...,||,..,,}.))}.,|{{||{|..,|))))}}......,|||},.)}}}.))))))))))),.)))..,)}}.)))))))))),,.,}},...,)))..))))))))))))..)))))))).)))..))).))))..))))..))).))).)))).}))))))))).......(((((.{{,....,}}...)))))..))))