Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ZNF292_0005100
Sequence Length
2696 nt
GC Content
0.3642
ACAGAUAAGGAAACUUCACAGAACAACUUCAUACUGUGUUUUGCGAGAAAGAGGAUCAAGAGAUGGGAAGAAACAGGGGAAGGUCGGAGAGACUCUGAGGCUGCUUCUUCAGCAUGUCAAAGUGCCACAGUUUGGGGUAUCAGUUUCUGAGCCCCAGCACCUGCAAAAGUGAGUCUCUGGAUUGGGAUUAUAUGUAUAAUAGUGACAUGAUUAGGCAAAUAAAAGGCUUUAAUUUCUGUGUUUACAUCGAAGCUGAAUAAUCUUGGAUAUAAUGUAGGCAGCUUGGGUAUAAUGUAGGCAGCUUCAUCUCAUGACCAGCUACAAUGUCAUUUGUUCAUCAUUACAUUUAACAAUGCCAAGAGGGUACAGAAACAUGGAUUCCCCUCUUCCCCAGCAUCUCUGUCCCUGCUUGGAACUUAAAAGAUCAGGAAUAGCUUUACCUUUGGGUUUCAUGUGGAUUGAGCUAAGGAACUUAUCUCUGGUUGUUUUUAUCCUCACGUAGAAUCUAUUUUGUACCAUGAAGGUUUGGGAUAUAAUGGGAUUGUGAGGUGAGGUGCAAGUGUGGAUGAGAGCAAAUUUGUUUCAGGGUUCAUCUGGGAAAGAUUGCAGUGUUUUUUCCUGGAUAUCUGAGAAACACGUUUUUCCACUUCAACUUUACUGAGAAAUUUUGCUGUGGAGUUGGUUUUGGACCUAGUUGAGUAUCCCCCGACACCCCAUCCUACAUCCUGCACUGUGGCUGCAGGUUUUCUGUCCUUUCUGUCUCUAGCAAUCAGUAUUUGCCCUCACUUCUUAGGGGGAAAGGAAAGGAAAGGAUUAGUUGAGAGCCAAGGUCUGUGAAUAUAUGGCUACUCAGUCGGUGAGUAGUUAUUUUGUUGCCCUUUAGUUUACCAGCUUACUUUUUCUAUUGCUUUCGUCUAAUCACUUACUAAUUCUGUUAGUUGGAAGUUAGUAGAGAGGUCAAGGUAGUAAGUGCUUUGGUAGUAGAAUACAAUCCCCCCCACCCCUUCCCUCCCUCCAGUUUUUAAAAGUGCUUCUGUAUGCCAGAGGAUACAGGCCCUCAGGAAAUUUUUUUUUCCUUCAAUACCCUAUUUUCUAGGAAAAGAAACCUGAAUUUCCAUAUGUUUGAUUAAAUGAGUCUUAAACCCUGAAGUGUGGAGAGGACCAAUUGUGGCAGUCUUCUGUGUUAUAAAAACAUUUAAUUAGAAUCUCUCUUCAUUUAGCAUAACUAUAGAACCUUUUAGGUAAGAGUCUUAACAUGUGUGUUUCUGUAUAACUUAUCUUUCCAUUAUCUCCCAUCUCUUAUUCAGUAAGAUAAAUAGCAUCUUUUAAAGUAAUUCUGAUGAGGUAAAUUUAAAAUAUUCACUUAAUUGAAAGAUGAGAAAUAUUUUUAAUUAAAAAAACACUAUUACAAAAAUUACUUAACCUUAUAAUAAUUCUUUAAUAUCUUUAAUGUUGAUUUUUAUAUGUUGAAAGUCUUUGGAUGACUUUUUAAUUGCUAGUGCUUGUCAAAAAAUUAUUAAUUUGUAUGUACUGUUAUUUUUUUAUGGACUGAAAAAGGACACGUCUUUGCUGACCAUACAUGAUUUAUUUUGUUGUUCAAUAUUGAAUUUUCUGCUGCUUCUACGAGAAAUAGAAAACAGAUAUUAUUUCAAAUUCUUCACUGCAUGCCUGGUCAACUGUUACUUGCUCAGAUGUCUUUUUAAAAUAACUUUUAAAACUUACUAGGGAAUAGAGGAGAUAACUCUUGCCCUAUUUAAAACUAGCCUUGAUGAAAUUAUGCUGUUGCUGGAUGAAUUAAUACUAAUCUUUUCUCCUACAGAGAGCUGCCAAAAAUAUGACUAUGACUUUAUUUCAUUUAAUAUUUUAAUCAAUAUAAACUACUUUUUGUUUUUAUAAAUAAAAAUCUGUAUUUUUCAAAAUUUUUCAGGAAAAAACAGCUGAUGAGUCAAUGUAUAUUUUGAUUUACAUUUUGAAUACUUUUUAUUAUUCCUUCCAAAACAGACACUCCUAGAAUAUGCAGAGAAAUGGAAAACUUCAGAAGAUCCUUUACCUUUAUUGGAGGUAUACACAGUGGCUAUCCAAAGUUAUGUUAAAGCCCGACCUUAUCUUACCUCUGAAUGUGAAAAUGUAGCCUUGGUUCUGGAACGCUUGGCAUUAAGCUGUGUUGAACUUUUACUGUGUCUGCCUGUUGAGUUAUCAGAUAAACAGUGGGAACAAUUUCAGACACUGGUGCAGGUAGCUCAUGAAAAGCUGAUGGAGAAUGGCAGCUGUGAAUUGCAUUUUUUAGCUACUCUAGCUCAAGAGACUGGGGUGUGGAAAAACCCGGUACUGUGCACUAUUCUUUCCCAGGAACCAUUGGAUAAGGAUAAAGCUUUUGAGGGUCCCAUCUUGUUGGAUAUGAGAAUUAAACAUCUAAUCAAAACAAAUCAGUUAAGUCAAGCAACUGCUCUAGCAAAGCUGUGUUCUGACCAUCCAGAGAUUGGCAUAAAAGGUAGUUUUAAGCAAACUUACCUUGUCUGUCUUUGUACAUCAUCACCAAAUGGAAAGUUAAUCGAAGAGAUUUCAGAAGUUGAUUGCAAAGAUGCACUGGAAAUGAUCUGUAACUUAGAAUCUGAGGGUGAUGAAAAAAGCGCUCUUGUUUUAUGUACUGCGUUUUUGUCACGUCAGCUCCAACAAGGAGAUAUGUACUGCGCUUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-652.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -709.28
Frequency: 0.0000
Diversity: 809.37
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((....(((.(((((((.(........)))))))).))).....((((.(((((((((((.((.....((((((((.(((((((.((((((((((((.....)))).)))..(.((((((((((((((((.((((...))))))))))......(((....((((...(((((..((((.................((((((.....((((...((((((...(((((((.(((((((((.((((((..((...............))..)))))).).....))))))))((((((((...))))..)))).((.(((.(..(((........)))..).))).))(((((((((.(((((....(((.............))).....))))))))).)))))............)))))))))))))...))))....))))))((((..(((((.(((.....))).)))))......))))....(((.((......)).)))...(((((..((((.......(((((((((((.(..((((((.(((((((((.....((((.((((((.((((..((((((((((((.........))))))))))))))))..)))))).)))).((((..((((((((((..............))))))))))...))))....((((.........))))....))))).))))..))))))..).))((((.....))))........((((((.(((..((((((((((((.(((((((.(((.(((((.((((((((((...(((((.((((.((((...((((....(((((((((((.....)))))))))))....)))).)))).))))..)))))..)))))))).)).))))).))).......(((((((((((.....))).)))))))))))))))..)))..)))))))))))).))).))).))))))))).))))..)))))..)))))))))..))))....))).(((((((.(....).)))))))...(((((....(((((((((((.................)))))))))))))))).(((((((((((((((...........))))))......))))))))).....)))))))))).).....(((((.....)))))....))))).))))))).......(((((.....(((..(((......)))..))).....)))))(((.......)))..))))))))....)))))))))))))))))(((((..((((.(((((((.((((((.((((...(((((((.((((.(((((((((((((......))).)))...))))))).))))............................)))))))...)))))))))).............((((((((.....))))))))...))))).)).)))).)))))(((((.((.((((..........)))))).)))))((((((((.....(((((((..(((((((.((......((((((..((((..........(((...((((((...(((((((...(((....)))...)))))))..))))))....)))...........))))..)))))))))))).)))..)))...))))....)))))))).............(((((...((((.......))))..)))))((((((((((.((((.......((((((((...(((((((.............((.((((((..(((.((((((((.(((((((....((((.......))))...)))))))................(((((((((....))))))))).((((.((((((...........)))))).))))(((((((.(((((((((((((((...........(((((........)))))((........)).......))))))))))........(((...(((...))).)))....((......))(((((.(((((((((((((......(((((((.........................)))))))....))))))..(((((...(((((..(((.....)))))))))))))...))))))).)))))))))).))))))).....(((((..............))))).....))))))))........)))..)))))).)).(((((.(((......))).)))))(((((((.((....)))))))))((((....((((........((..(((((((..((((......))))..)))))))..))......)))).)))).(((((.(((...(((........))).)))..))))).........((((((((.(.(((.......))).))))).)))))))))))....))))))))))))))))))))))........))))))))))(...((((((.(((.((...((((.....((((.....))))......((((((.(((((((((((.............(((.(.((((((..(((.((..(....)..)).)))..)))))).)))))))))))))))...))))))))))....)).))))))))).......)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((((....(((.(((((({,(........)))))))).))).....((((.(((((((((({{((.....(((((((({({,((((...(((((((((({....,|{((,,,...}|||{{({{,{((((((.((((...))))))))))}{{{.,|,....|||((((((......)))))}.,,|{,...,,.{|{{{{|(({{((((.........))}},}}}}.,,}}||||||(((.((((((..{{..,{{{....,,}.,))..)))))).))}....,},))))))))))))))).)))}}.,,..{{.{{{.{..{({........}}}..}.}}).}}(((((((((.(((((....(((.............))).....))))))))).))))).......,,,,,{((({{{{{{(((((((..(((({{{.(((((.(((.(((((((({......(((((((((((((({...(({({(.({......}}.)))...(((((..((((.......((((((((({({({{(({(((,(((((((((.{.,.{(((.((((((.((({..((((((((((((.......,.))))))))))))))))..)))))).)))}.((((..((((((((((.,.{,....}}.,.))))))))))...))))....((((.{......,))))....))))).}}},|,||||}}...,})|||||....}}}},,..,{|,,||{{{,{{{.,|{||||||||||}|||||{,.(((.(((((.(({(((((((.,.(((((.((((.((((...((((..,.(((((((((((.....)))))))))))....))))}))),.))))..))))).,)))))))).)).))))).)))......,(((((((((({.....)))))})))))))))}))},{|||{,}}}},))))))).}}}.,,,.,)))))))).))))..)))))..,|,|{,{{,..,,.....{||{,{((({{{.{|.,,)}})))))}...(((((....(((((((((((..{{.........,,..)))))))))))))))).,,{{{{{{{{(({(({{.....}}}},,)))}...,,,)})))))|||||{{|...,})),,,},},}})}}..}))))))))....)))))).......))).}))))).)))))))})))))}...))))}))}))...........)))))))).,...,..}}})))))....))))))))))))))))),(((((.......((((((....(((((((..((((.(((({{{{{.{{((({{{,,{((,,{{,,||},}}},..))))))),)))),,...............,.,,,,,.,{,||..|||{{.|||,..||||{{{..||,|||||||}|,}}}}}.||||{(((((.......)))))}}.,,,,{{,(((({.,{.((({..........}}}}||.}}}}}|{,.,{{{{{,,.,...|}}}}}||||}|.({(,,,...}|)}},|||{{|,,..,||||,,{,||{|{{{|}},{((((((...{((,...}})...)))))},.,}}}}}},..,},,,....,||..}|,))))).))))...)))))))....)))))}..{(((((({....}))))))}}}}}}|((((...((((.......))))..))))},((((((((,{((((.......(((((((({{.(((((((.,..,........,,.{(((({..{{|,{(((((((.(((((((....((((.......))))...)))))))................{((((((((....))))))))}.((((.((((((...........)))))).))))(((((((.(((({{{{{{{{|||,,,,,..,,,,((({{........})}}}....,,.,..,|....,,.}})))}}}))}|,,,,,,(({...{||||,|||.}}|,,|.((,.....))(((((.(((((((((((({.,,..,(((((({..{{,..,{......,....,,,,,}}})))}....)))))}..{((((...,(((({{({{..,,})),))}},))))}..,))))))).)))))}}})).))))))).....(((((.{{,....}))...))))).....)))))))).......,))}..)))}}},}},{{{{{.{{{..,,..|||,}||||{{{{{||||,.,,}}||||||||,.,,....||||,}}.....{{..(((((((..((((......))))..)))))))..)),,,,,,))}}.}}}},|{{{{||{{.,,|,,.......,))},}}}|.||||,..|||||..{{|{(((..,.|||...}}..)))}))))).))},))))))).})}}))))))))))))))))))))}.....,,.))))))))))(...((((((.(((.((...(((,.....{(((.....)))).,...,((((((,(((((((((((..{{{.....}}}({,{(.((((((..(((,((,.{.......}),))),,)))))).)))}))))))))))},,.))))))))))....)).))))))))).......)
Back