Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ZNF292_0005200
Sequence Length
1241 nt
GC Content
0.4069
ACAGAUAAGGAAACUUCACAGAACAACUUCAUACUGUGUUUUGCGAGAAAGAGGAUCAAGAGAUGGGAAGAAACAGGGGAAGGUCGGAGAGACUCUGAGGCUGCUUCUUCAGCAUGUCAAAGUGCCACAGUUUGGGGUAUCAGUUUCUGAGCCCCAGCACCUGCAAAAGUGAGUCUCUGGAUUGGGAUUAUAUGUAUAAUAGUGACAUGAUUAGGCAAAUAAAAGGCUUUAAUUUCUGUGUUUACAUCGAAGCUGAAUAAUCUUGGAUAUAAUGUAGGCAGCUUGGGUAUAAUGUAGGCAGCUUCAUCUCAUGACCAGCUACAAUGUCAUUUGUUCAUCAUUACAUUUAACAAUGCCAAGAGGGUACAGAAACAUGGAUUCCCCUCUUCCCCAGCAUCUCUGUCCCUGCUUGGAACUUAAAAGAUCAGGAAUAGCUUUACCUUUGGGUUUCAUGUGGAUUGAGCUAAGGAACUUAUCUCUGGUUGUUUUUAUCCUCACGUAGAAUCUAUUUUGUACCAUGAAGGUUUGGGAUAUAAUGGGAUUGUGAGGUGAGGUGCAAGUGUGGAUGAGAGCAAAUUUGUUUCAGGGUUCAUCUGGGAAAGAUUGCAGUGUUUUUUCCUGGAUAUCUGAGAAACACGUUUUUCCACUUCAACUUUACUGAGAAAUUUUGCUGUGGAGUUGGUUUUGGACCUAGUUGAGUAUCCCCCGACACCCCAUCCUACAUCCUGCACUGUGGCUGCAGGUUUUCUGUCCUUUCUGUCUCUAGCAAUCAGUAUUUGCCCUCACUUCUUAGGGGGAAAGGAAAGGAAAGGAUUAGUUGAGAGCCAAGGUCUGUGAAUAUAUGGCUACUCAGUCGGUGAGUAGUUAUUUUGUUGCCCUUUAGUUUACCAGCUUACUUUUUCUAUUGCUUUCGUCUAAUCACUUACUAAUUCUGUUAGUUGGAAGUUAGUAGAGAGGUCAAGGUAGUAAGUGCUUUGGUAGUAGAAUACAAUCCCCCCCACCCCUUCCCUCCCUCCAGUUUUUAAAAGUGCUUCUGUAUGCCAGAGGAUACAGGCCCUCAGGAAAUUUUUUUUUCCUUCAAUACCCUAUUUUCUAGGAAAAGAAACCUGAAUUUCCAUAUGUUUGAUUAAAUGAGUCUUAAACCCUGAAGUGUGGAGAGGACCAAUUGUGGCAGUCUUCUGUGUUAUAAAAACAUUUAAUUAGAAUCUCUCUUCAUUUAGCAUAACUAUAGAACCUUUUAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-329.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -357.80
Frequency: 0.0000
Diversity: 428.38
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(......(((....(((.(((((((.(........)))))))).)))...((((....((((((((((((..(((((((...((((((((((((((((((......)))))((((......))))..(((.(((((((.((((...)))))))))))...))).......)))))))).....(((((..............(.((((((.....((((...((((((...(((((((.(((((((((.((((((..((...............))..)))))).).....))))))))((((((((...))))..)))).((.(((.(..(((........)))..).))).))(((((((((.(((((....(((.............))).....))))))))).)))))............)))))))))))))...))))....)))))).)(((.(((((.((..(((((((.((.((((.(((..(((((((.....((((((.(((.(((........))).))).))))))..)))))))..))).)))).)).)))))))...((((.((((((.((((..((((((((((((.........))))))))))))))))..)))))).)))).((((..((((((((((..............))))))))))...))))))))))).))))))))))))).)))).........((((((.......)))))).....))).)))))))))))).((((.......))))))))........(((((((.((...((...((((((((((.((((.((((...((((....(((((((((((.....)))))))))))....)))).)))).))))..)))))...(((((((((((((((((.(((((..............))))).)))))).))))))))))).(((((((.....)))))))(((......))))))))...))...))))))))))))......)(((((((.(.((((((((((..((((........)))).(((((((((((((((((.................))))))))).....)))))))).....((((((((((((.(((((....((........))..)))))...((((((((........))))))))...))))))))))))...............)))....)))))))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((((.((({,.{((.(((((({,(........)))))))).))}...(((({,..(({(((((((((...,,(((({.((((({,(({(...(((((((((({.....{(((.,,...}|||,,{{{.{((((((.((((...))))))))))){|{.,|,....}}}((((((......)))))).,,|,,......{||{|||((((((((.........))}},}))}.,,)))}|||}(((.((((((..{{..,{{{....,,,.,))..)))))).)))....,}.))))))))))))))).)))}},{{,.,,.{{{.{,{((({,.,{,,,|||{{|.,,,.,,(((((((((.{(({{....|{{....,,,,,,,,,)}}...,,))))}})}},|}|||,,{{{{{{.{,,,(({.,,,,}},..,||}}|||||||}.},||||.}|||||||||,|||||||,}}}}|,|,|||,.(((((({{{.{{((((({.(({.(((........))).})).}))}}}|})|)}}})}}))|,|||}|||||||||}}}}}||||.((((((.((({..((((((((((((.......,.))))))))))))))))..)))))).}}},.((((..((((((((((.,.{,....}}.,.))))))))))...))))....||||.|..,,,,}}))).,}})}}}}.,,},|{|||||,..,},)}}||}...,}}}},}}}}}}}|||||,{(((..,,,,,|||||||}{{{||,,.((({((((({{,,(({{{(({{,(((((.((((.((((...((((..,.(((((((((((.....)))))))))))....))))}))),.))))..))))).{||||||||{||{|||||,,||{{,....,,,,,,,,,{|}}}}.))))))))))))))))))),{|||{,}},,,)))))))|||,.,,,.}}}})))),.})}...}))))))}}}}},,,,|,,...,,|{,|,{{((((((.{,.,,)|})))}}}...(((((....(((((((((((..{{.........,,..)))))))))))))))).}))))...}}}}}}.(((({.{.,(((......,{{{{{((.(((((({.{{,.,,,|||{{,....}}|||||,,,..,,},,.,,,,,,},.,)))))).))))),},,.......))).,).)))))
Back