Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ZNF292_0005600
Sequence Length
1561 nt
GC Content
0.4094
AUAAGGAAACUUCACAGAACAACUUCAUACUGUGUUUUGCGAGAAAGAGGAUCAAGAGAUGGGAAGAAACAGGGGAAGGUCGGAGAGACUCUGAGGCUGCUUCUUCAGCAUGUCAAAGUGCCACAGUUUGGGGUAUCAGUUUCUGAGCCCCAGCACCUGCAAAAGUGAGUCUCUGGAUUGGGAUUAUAUGUAUAAUAGUGACAUGAUUAGGCAAAUAAAAGGCUUUAAUUUCUGUGUUUACAUCGAAGCUGAAUAAUCUUGGAUAUAAUGUAGGCAGCUUGGGUAUAAUGUAGGCAGCUUCAUCUCAUGACCAGCUACAAUGUCAUUUGUUCAUCAUUACAUUUAACAAUGCCAAGAGGGUACAGAAACAUGGAUUCCCCUCUUCCCCAGCAUCUCUGUCCCUGCUUGGAACUUAAAAGAUCAGGAAUAGCUUUACCUUUGGGUUUCAUGUGGAUUGAGCUAAGGAACUUAUCUCUGGUUGUUUUUAUCCUCACGUAGAAUCUAUUUUGUACCAUGAAGGUUUGGGAUAUAAUGGGAUUGUGAGGUGAGGUGCAAGUGUGGAUGAGAGCAAAUUUGUUUCAGGGUUCAUCUGGGAAAGAUUGCAGUGUUUUUUCCUGGAUAUCUGAGAAACACGUUUUUCCACUUCAACUUUACUGAGAAAUUUUGCUGUGGAGUUGGUUUUGGACCUAGUUGAGUAUCCCCCGACACCCCAUCCUACAUCCUGCACUGUGGCUGCAGGUUUUCUGUCCUUUCUGUCUCUAGCAAUCAGUAUUUGCCCUCACUUCUUAGGGGGAAAGGAAAGGAAAGGAUUAGUUGAGAGCCAAGGUCUGUGAAUAUAUGGCUACUCAGUCGGUGAGUAGUUAUUUUGUUGCCCUUUAGUUUACCAGCUUACUUUUUCUAUUGCUUUCGUCUAAUCACUUACUAAUUCUGUUAGUUGGAAGUUAGUAGAGAGGUCAAGGUAGUAAGUGCUUUGGUAGUAGAAUACAAUCCCCCCCACCCCUUCCCUCCCUCCAGUUUUUAAAAGUGCUUCUGUAUGCCAGAGGAUACAGGCCCUCAGGAAAUUUUUUUUUCCUUCAAUACCCUAUUUUCUAGGAAAAGAAACCUGAAUUUCCAUAUGUUUGAUUAAAUGAGUCUUAAACCCUGAAGUGUGGAGAGGACCAAUUGUGGCAGUCUUCUGUGUUAUAAAAACAUUUAAUUAGAAUCUCUCUUCAUUUAGCAUAACUAUAGAACCUUUUAGACACUCCUAGAAUAUGCAGAGAAAUGGAAAACUUCAGAAGAUCCUUUACCUUUAUUGGAGGUAUACACAGUGGCUAUCCAAAGUUAUGUUAAAGCCCGACCUUAUCUUACCUCUGAAUGUGAAAAUGUAGCCUUGGUUCUGGAACGCUUGGCAUUAAGCUGUGUUGAACUUUUACUGUGUCUGCCUGUUGAGUUAUCAGAUAAACAGUGGGAACAAUUUCAGACACUGGUGCAGGUAGCUCAUGAAAAGCUGAUGGAGAAUGGCAGCUGUGAAUUGCAUUUUUUAGCUACUCUAGCUCAAGAGACUGGGGUGUGGAAAAACCCG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-417.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -451.84
Frequency: 0.0000
Diversity: 445.69
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....((....(((.(((((((.(........)))))))).))).....((((..(((((((((((((....(((((((((((..((((...(((((((((((.....((((......))))..(((.(((((((.((((...)))))))))))...)))........((((((......))))))............(((((((((((((((.........)).))))))...))).))))(((.((((((..((...............))..)))))).))).......))))))))))))))).)))))........(((.(..(((........)))..).))).((((.....))))((......))..)))))))))))))....))))))))))((((.(((((((((((.(...((......))...).))))))))))).))))(((.(((((.((..(((((((.((.((((.(((..(((((((.....((((((.(((.(((........))).))).))))))..)))))))..))).)))).)).)))))))...((((.((((((.((((..((((((((((((.........))))))))))))))))..)))))).)))).((((..((((((((((..............))))))))))...))))))))))).))).....((.((((((((((((....((((((((.(((((.(((.(..(((.((((((((.((((..((((.......))))(((........)))))))..))))))))..)))..).)))..)))))(((((((.((....(((((((((((.....))))))))))).(((((.(((...((((((((((((((.....(((((((((((((.(((((..............))))).)))))).)))))))((((((..(((..(((..((((((((((................((((..........((((((((...((((.(..((((((....(((((((........)))).(((((((((((((((((.................))))))))).....)))))))).....((((((((((((.(((((....((........))..)))))...((((((((........))))))))...))))))))))))...(((((.......(((((...........((((((......))))))))))))))))..))).......))))))..).)))).....))))))))........))))))).)))))))....)))..))).))))))...((((........)))).......(((..((((....))).)..)))..))))))).).))))))...((((((((((.((....))....)))))..))))))))))))))).))))).))))))))))(((((.......)))))...(((...((.(((((.(((......))).))))).))....))).)).)).))))))))))......)).
Thermodynamic Ensemble Prediction
....((....(((.(((((({,(........)))))))).)))..,{.((({,.(((((((((((({...,(((((((((((..((((...(((((((((((.....((((..,...}|}},,{{{.{((((((.((((...))))))))))}{{{.,|,....}|}((((((......)))))).,,|||......{||||||((((((((.........)))},)))}.,,))),}||}(((.((((((..{,..,{{{....,,,.,))..)))))).))).,..,}.))))))))))))))).))))).....,,,{({..,{(((....,...,||,...,,},||{{.....))})||,...,,)}..)))))))))))))....))))))))))||((.(((((((((((.{...((,.....)),..,}))))))))))).))||(({.((((,,((..(((((((.{(.((((.(((..(((((((.....((((((.(({.(((........))).})).)))))).}))))))),,))).)))).)}.)))))))...{(((.((((((.((({..((((((((((((.......,.))))))))))))))))..)))))).)))}.((((..((((((((((.,.{,....}}.,.))))))))))...))))))))))).}},,}}}.{(.(((((((({{{{....(((((((({{({((({(({({{((({{{{(((((.(((({.((({.......||}}{{{{.,,....,||||||,,||}.,||},}||||.|{{{|,{(((|((((,..({((..,.(((((((((((.....)))))))))))..,,))}},},,.,||||,,||}||,{,,,{{(((((((((((((.((((,..............))))).))))))},))))))||||{(,,(((..{{{.,||||||({{{,.,...,,.,,,,...||{{.,,,,.,,.,{{{{{(((...,,{{|(.,{(((((,,,,({.{,|{.,,,.}}.,,||{((,,,,(((((((((((..{{.........,,..))))))))))}}}})),|||||{{...((((((((((((.({{{{...{{(......}.)),,|}}}}...{(((((((.....,,.)}})))},...)))))))))))}..,{{{{|.,.,.,.({{{{......,....{(((((......)))))}}))))))))).,)))))}....)))))),,).}|||,....}}}|||||,,......|}||||}.}}}}}}}..,.}}}.,))).}}}}},....|||,,,,,,,.)})}...,}}}))),,|||||,.,|{{(({,{||..,}}))})}}}}}}}}|,,{((((((((((.{{,...,,....)))))..})))))))},,,,,}}))),))),)))))))){{(((.......|||||..,{(({{{,{{({,|,.,.,}})),})))})||||,.,,}))))..}),)}.))))))))))......)).
Back