Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_ZNF292_0007900

Sequence Length

403 nt

GC Content

0.3449

GUAGCUCAUGAAAAGCUGAUGGAGAAUGGCAGCUGUGAAUUGCAUUUUUUAGCUACUCUAGCUCAAGAGACUGGGGUGUGGAAAAACCCGGUACUGUGCACUAUUCUUUCCCAGGAACCAUUGGAUAAGGAUAAAGGUAAAUUUUCGAGAGACAGAGAAAAAAAAGAAUAAUUAGACUAGAAAAAAUAAGUGUUAAAGUUGUUUUGAUAUAAUUUAUCUCAAGAUAUUCCAAAGAAGGACCAUUUAAUUAAAUAUCUUCUGAGGUGUGCUUGAGGCCCUGCGCCUUUAUUUUAUUUUGGGGAAGAUGAAUUUAUACGAUUAUAGAAUCAUAGAUUAACAGAUAAACUAGAAUUUUUUCCCAACAUCUUUUUAACAGAGGAAUUCCUUCUGUAACUUCUGACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-79.20 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -89.35

Frequency: 0.0000

Diversity: 124.46

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((......(((((((.((.(((.(((....(((((.(((......))).))))).((((......))))((((((...........)))))).((((...((((((((((((((((.((...))...(((((((((((...(((((........))))).....(((((((((.(((..............)))..)))))))))............((((((.(((.((..((((((...((((....)))).))))))..)).)))))))))((...))))))))))))).)))))))))))).((.((((((....)))))).))))))....))))...............)))))).)).)))))))(((((((.....))))))).))((.....))

Thermodynamic Ensemble Prediction

{{{{{(,.,{{,,{(|{(.{({,({{,,{,{{{{{.{{,.,},.,}}},}}}}},|{{|||||,,||||((((((,,........,)))))).||||,,.,,,,{(((((((((,,......}|,,{{{(((((((((...(((((........))))).....{{{{{{{{{,,{{,........,.|,|,},..}}))))))),,,,.....,,,((((((.(((.((..((((((...((({....}))).))))))..)).))))))))){{...,,))))))))))),)))))))))))|{((.((((({....}))))).)))}||.,,..,,|.,...,,.,,..,,,))))}}.,},)},,},,(((((((.....)))))))..,,,,},,,}}