Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ZNF292_0010500
Sequence Length
1923 nt
GC Content
0.4046
GAACUCCAUCAGUGCCUCCAAAAGCUCCAGUUCAGAAAUUCAGCUGCCAGGUCGAGGGAUGUACUCGAACCUAUAAUUCUUCACAGAGUAUUGGGAAACACAUGAAGACAGCACACCCUGACCAAUAUGCUGCAUUUAAAAUGCAGCGCAAAAGUAAAAAAGGUCAGAAAGCUAACAACUUAAAUACACCAAAUAAUGGAAAGUUUGUUUAUUUUUUGCCAUCACCGGUGAACAGCUCAAAUCCAUUUUUUACAUCACAGACCAAAGCCAAUGGGAAUCCUGCUUGUUCGGCCCAGUUGCAGCAUGUCUCGCCACCCAUUUUUCCAGCUCAUUUAGCAAGUGUGUCAACUCCAUUGUUGUCCUCAAUGGAAAGUGUCAUAAAUCCAAAUAUAACUUCUCAGGAUAAAAAUGAACAAGGUGGUAUGUUAUGUUCCCAAAUGGAAAAUUUACCUAGUACUGCCUUGCCAGCACAAAUGGAAGAUCUAACCAAAACAGUUCUGCCUUUGAAUAUUGACAGUGGCUCAGAUCCUUUCCUUCCUUUACCUGCAGAAAGUAGUUCAAUGUCUCUCUUCCCUUCACCAGCAGAUAGUGGGACUAAUUCUGUUUUUUCCCAACUGGAAAAUAAUACAAAUCAUUAUUCCUCACAGAUUGAAGGAAACACUAAUUCCUCCUUUCUAAAGGGGGGUAAUGGUGAAAAUGCAGUUUUUCCUUCACAAGUGAAUGUUGCAAAUAACUUCAGUAGCACCAAUGCCCAACAGUCUGCACCUGAAAAAGUUAAAAAAGACCGUGGGCGGGGCCCAAAUGGGAAGGAAAGAAAACCUAAGCACAACAAAAGGGCUAAAUGGCCUGCAAUUAUCAGAGAUGGGAAAUUUAUCUGUAGCAGGUGUUACAGGGCUUUUACUAAUCCCAGAUCACUGGGUGGGCACUUAUCCAAGCGAUCUUACUGUAAACCACUGGAUGGAGCCGAAAUUGCUCAAGAACUUCUACAGAGUAAUGGACAGCCUUCUCUUCUUGCCAGCAUGAUUCUCUCCACAAAUGCAGUAAAUUUGCAGCAGCCACAACAAUCUACCUUCAAUCCAGAAGCAUGUUUUAAAGAUCCAUCAUUUCUACAGCUUCUUGCUGAAAAUCGCUCGCCAGCAUUUUUACCAAAUACAUUUCCUCGAUCUGGUGUGACUAACUUUAAUACCAGUGUCAGUCAAGAAGGUAGUGAAAUUAUUAAACAGGCUUUGGAAACUGCUGGCAUUCCCAGUACAUUUGAGGGUGCCGAAAUGCUUUCUCAUGUUUCAACAGGUUGUGUCUCUGAUGCAUCACAAGUAAAUGCAACGGUGAUGCCAAAUCCAACUGUACCACCCCUGUUGCACACUGUAUGCCAUCCAAACACCUUGCUGACCAACCAGAAUAGGACGUCAAACUCCAAAACUUCCUCCAUUGAGGAAUGUAGCAGCUUGCCUGUUUUUCCAACGAAUGACUUACUACUGAAGACUGUUGAAAAUGGUUUGUGCUCUAGUUCAUUUCCUAAUUCUGGUGGGCCAUCACAAAAUUUUACCAGUAACAGUUCUCGUGUUUCUGUUAUAAGUGGUCCUCAGAACACAAGAUCCAGUCAUUUAAAUAAAAAGGGAAACAGUGCUUCUAAGAGAAGAAAGAAAGUUGCUCCUCCACUAAUUGCACCUAACGCUUCCCAAAACUUGGUAACAAGUGACUUAACAACAAUGGGACUCAUAGCAAAGAGUGUUGAAAUCCCAACUACUAACCUUCAUUCAAAUGUAAUUCCAACUUGUGAACCUCAGAGUUUGGUGGAAAAUCUAACACAGAAAUUAAAUAAUGUUAACAAUCAGUUAUUUAUGACUGAUGUAAAAGAGAAUUUCAAAACCAGUCUUGAGUCCCAUACAGUGUUAGCCCCUUUAACAUUAAAAACUGAAAAUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-468.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -505.94
Frequency: 0.0000
Diversity: 365.84
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(....)(((((((((........))..(((((.........)))))..((((((((.......)))).))))...(((((....))))).(((((((..((((((.((.((((....((((((.....((((((((...))))))))((....))......)))))).......................(((.((((((...((((.......((((((......)))))).....)))))))))).)))......(((.((((((((...(((((((.((((..((((((((((((((((...(..((((..(((((((((.(((.(((((((((...((((.((..(((((((.......)))))))...)).)))).((((...............)))).........(((((((((((((....((((.....)))).....))...)))))))))))(((.......)))..(((((..(((...((((((.......))))..))....)))...)))))(((((((((((......((((((..((((((..(((((((............)).)))))...)))))).)))))).((((((.....))))))...................((((....((((((((((((((...((((((((...))))))))...)))))...........)))))))))...)))).((((((...........))))))((..((((((.(.((((....................)))).))))))).)).......)))))))))))....(((............)))))))))))).)))........))))))))).......((((((((....))))))))............(((((....)))))((((......)))).)))).)...)))))....))))).....))))))(((((((.(((...)))...)))))))((.(((..........))))))))).)))))))........(((((.....)))))..............((((((((.....((((((.(((...((.((....)).))...)))))))))((.(((((((.(((....)))))))))).)).............((((((((((...........))))))).)))......))))))))...............))))))))...))).((((((((.(((.....))).))))))))...)))).)))))))).......(((((.(((...(((((((.(((.((...((((((((((.(((...........))).))))...)))))).)))))))).)))).............))))))))......(((........)))...((((((((....)))))).))(((((((((((((((((((....((((((((.......((.((((((((....(((((((((.....(((((((..........)))))))...)))))......)))).)))))))).))(((((.(((..............)))))))).......)))))))).........))))))))).))((((......))))...))))))))............((.......))))))))).(((((....)))))............((((((((((..((...(.((.(((((((.....(((((((.(((..((((...((.......))...)))).....))).)))))))......(((((..............)))))(((.(((((((....))))))))))........))))))).))).))..))))))))))..((((((((.....))))))))....)))))...))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(....)((((((({{........}}..(((({..,....,.)))))..((((((((.......)))),,)))...(((((....))))).(((((((..((((({{((.((((....((((((....,((((((((...))))))))|,....||......))))))..,{.......,,,.........{{{.{(((({.{{{{{({{{,,,.,{{({{......)))))),))}}....)))))).)))......(((.((((((((...(((((((.((((.,((((((((((((((((...{..((((..(((((((((.(((.{((((((((...((((.{,.,(((((((.......))))))}..,}}.}||,.{(((...............))))....,,,..((((((((((({{.,..((((.....)))).....}}...)))))))))))(((.......)))..(((((..(((...((((((.......))},.,))....))).,.)))))(((((((((((......((((((..((((((..(((((((............)).)))))...)))))).)))))).{(((((.....)))))}.,,,.......,,}||,..((((....((((((((((((({.,{(((((((,...}))))))).,.)))))...........)))))))))...)))).{(((((...........)))))}((..((((({,(.((((.....,..............)))).))))))),)).......)))))))))))....{{{..,.........}}}))))))))).)))........})))))))).......{(((((((....)))))))}....,.......(((((....)))))(((,......}))).)))).}...)))))....})))).....)))))}(((((((.(((...}))...)))))))((..,.,,........,,}),)))).)))))))........((({(.....))))},.............((((((((.....((((((.(((...,,,((....,}.,,...))))))))}((.(((((((.(((....)))))))))).))..........,,.((((((((((...........))))))).))),}....))))))))...............))))))))...))).((((({{(,(({.....))).))))))),...)))).)))))))).,,..{{((,,((((....(((((((.((,{((...((((((((((.(((..........,))).))))...)))))).))))))))},)))...}))}}}}).||},,.,,}.,....(((.{,...,,)))...,{((((((....)))))).}}((((((((((((((((((({...((((((((....,,,{..{(((({({,,,,||||{{({{...,.{{{{{{{.......,,,||}||||,|.}}}}}..,,,,},}}|}||||}}|,|.{{{|{,|||......,,,,,,,,)))))))).,},...)))))))).........))))))))).))((((....,.))},...))))))))............{{.......)}))))))}.(((((....)))))............((((((((((..((...{,(({((({{{{,,|,,{{{{{,,.,{,..{,,,...{,....,,,||,,.}|}}...,}))),)}))})),...,,{|{{{..,,..........,,}|,{(,{(((((({....))))))))))......,,}))))},.,,}.))..))))))))))..{(((((({.....}))))))}....)))))...))
Back