Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ZNF609_0003300
Sequence Length
832 nt
GC Content
0.5349
GUCUGAGAACAUAGCUGAAGCUGAAAAUAGGAAAGCUGGGGGCAAGGAAGAGCCUUGAAUCUUGAGGUGGGACGUUGACUCUAAGAUGUCCUUGAGCAGUGGAGCCUCCGGAGGGAAAGGAGUGGAUGCAAACCCGGUUGAGACAUACGACAGUGGGGAUGAAUGGGACAUUGGAGUAGGGAAUCUCAUCAUUGACCUGGACGCCGAUCUGGAAAAGGACCAGCAGAAACUGGAAAUGUCAGGCUCAAAGGAGGUGGGGAUACCGGCUCCCAAUGCUGUGGCCACACUACCAGACAACAUCAAGUUUGUGACCCCAGUGCCAGGUCCUCAAGGGAAGGAAGGCAAAUCAAAAUCCAAAAGGAGUAAGAGUGGCAAAGACACUAGCAAACCCACUCCAGGGACUUCCCUGUUCACUCCAAGUGAGGGGGCAGCUAGCAAGAAAGAGGUGCAGGGGCGCUCAGGAGAUGGUGCCAAUGCUGGAGGCCUGGUUGCUGCUAUUGCUCCCAAGGGCUCAGAGAAGGCGGCUAAGGCAUCCCGCAGUGUAGCCGGUUCCAAAAAGGAGAAGGAGAACAGCUCAUCUAAGAGCAAGAAGGAGAGAAGCGAAGGAGUGGGGACUUGUUCAGAAAAGGAUCCUGGGGUCCUCCAGCCAGUUCCCUUGGGAGGACGGGGUGGUCAGUAUGAUGGAAGUGCAGGGGUGGAUACAGGAGCUGUGGAGCCACUUGGGAGUAUAGCUAUUGAGCCUGGGGCAGCGCUCAAUCCUUUGGGAACUAAACCGGAGCCAGAGGAAGGGGAGAAUGAGUGUCGCCUGCUAAAGAAAGUCAAGUCUGAAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-271.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -286.30
Frequency: 0.0000
Diversity: 178.25
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((..(..(.(((((....(((....)))...))))).)..)..)))..((.(((((.((((..((((((.((...((((.....(.(((((...(..(((..(((((.((((((...(((((..(((....((.(((.(..(.(((....))).)..).))).))..(((((.((.(((....(((....))))))..)).)))))((.....))..((((......)))).....((((((((((.((((.(((.....))).)))).....(((((.((((.((..((.....(((((...((((.(((((.((.((...(((.((((((((....(((.........(((....))).....((((.......))))(((((.((((((((((((....)))).(((.((((......((((((((.(((((..((..(((((((..(((((.((.....)))))))..))).....))))..))..)))))))))))))..(..(((........((((((..((.....))....)))))).((((.....))))...)))..).((((......)))).....)))).))).....))))))))...)))))......((((((....))))))...)))..)))))))))))))))))))).).)))..)))))....))..)).)))).))))).(((((((...((....))...))))))).)))))))))).))).)))))..)))))).)))........))..)))..)...))))).)..))))..)))))))).))))...))))).))......
Thermodynamic Ensemble Prediction
((({,,.....{((((...,((,.....}}...))))|{(,.(((((.....)))))..}}|,.,((((((((.({.{((((,.,{((((((...(({.,.,.,{((((....}},..)),,}...}}}...((({((((,....,.}}})..})))..,....}))))))))))))}},}..)))))))...)))(({{{{.{{,.,||,}....},.((((......))))......(((((((((.((((.(((.....))).)))).....(((({.((((.((..{{.....(((((...{{{(.(((((.{{.((...(((,((((((((....(((.........(((....))).....((((.......)))){((({.(((((((({(((....)))},{((,(({{.,,},,((((((((.(((((..{{..(((((((..(((((,({.....}))))))..))).....))))..))..)))))))))))))....{(((..,{..{.((((({..((.....})..,.)))))).|(((.....))),...|||..,.((((......)))).....}}}}.)}},}...))))))))...))))}......((((((....))))))...)))..)))))))))))))))))))).).))}..)))))....)}..}),)))).})))).(((((((...((....))...))))))).)))))))))((((.(((((((.((((((((...(......)...)))))))).........))))))).))))|||......,})}..)))}....))
Back