Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_ZNF609_0005800

Sequence Length

1126 nt

GC Content

0.4192

GUCAGGAGUUCGAGACCAGCCUCAACAUGGAGACACCCCGUCUCUACUAAAAAUACAAAAUUAGCUGGGCGUGGUAGUGCAUGCCUGUAAUCCCAGCUACUCGGGAGGCUGAGGCAGGGGAAUUGCUUGAACCUGGGAAGCGGAGGUUAUGGUGAGCCGAGAUCGCGCCACUGCACUCCAGCCUGGGCAACAAGAGUGAAACUCUGUCUCAAAAAAAAAAAAAAAAGAGAGAAAAGUAGAUGUCUCAGGGAAGGGAUGACCAUGGAGAGGGAGAAAGACAAGAGAACAGCUGAUCAAUGGGGCAGUGAGAACUUACACAUUUAUUGAUUAAGCUUACCUUCUUAUAUCGCACGUUUUGUGGCAACUACCAAACGUCUCUACUAAAAAUACAAAAAUUAGCCAGGCGUGGUGGCAGGUGCUUGUAUUUCCAGCUACUCAGGAGGCUGAGGCAGGAGAAUCGCUUAAACCAGGAGGCAGAGGUUGCAGUGAGCCGAGGUCGCACCACUGCACUCCAGCCUGGGUGACAGAGUAAGACUCUGUCUCAAAAAAAAAAAAAAAAAGUUUUUUCUUAUUUUAAAUUGAGUUGUUUGUUUUCUUAUUAUUGUGUUUUGAGAGUUCUUGAUACGUUGUGCAUGUAAGUCCUUUAUCAGAUGUGAUUAGCAAAUAUUUUCUUCCAGUCUGUGGCUUGUCUUUUCAUUAUCAGUGAUAAGAGAACAUAAGUUCUUAAUUUGGAAGUUUAGUUUAUCAUUGCUUUCGUUAAUGGGUCAUGCUUUCCAUAUCUAAAAUCUUUGUCUAACCUAAGGUUACAAAGGUAUUCUAUUUUAUUCCUGAAGUUUUGUAGUUGCAGGUUAUAUAUUUAGAUCUAUCAUCCAACUUUAGUUAAUUUUUAUAUAUGUUGCAAGGUAUGGAUUAAAAUGGUUUUGUUGUUGUUUUGGUUUUUUGUUUUUGAGACAGAGUCUUGCUCUGUUGCCCAGACUGGAGUGCAGUGACGCGAUCUUGGCUCACUGAAACCUCCGCUUCUCAGGUUCAAGCAGUUCUGCUGCCUCAGCCUCCUACAGGCACGCACCACGCCUGGCUAAUUUUUCUGUUUUUAGUAGGGACGGGAUUUUGCUAUGUUGUCAGAGUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-473.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -493.24

Frequency: 0.0000

Diversity: 162.78

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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