Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_ZNF609_0007500

Sequence Length

369 nt

GC Content

0.5068

AUGGAGUCCCCUGUUUCCACACCAGCAGUGCUGCCAAUACACCUUUUGGUGCCAGUGGUCAACAAUGACAUCUCAUCUCCCUGUGAGCAGAUCAUGGUUCGUACCCGAUCAGUUGGGGUCAACACAUGUGAUGUGGCUCUGGCCACAGAGCCUGAGUGCUUGGGCCCCUGUGAACCUGGAACUAGCGUCAACCUUGAAGGCAUCGUGUGGCAGGAAACAGAAGAUGCCAUUCUGGUGGUGUGUAGUGGUAUCUCAUUGUGGUAUUAAUUUGCAUUUCCCUGGGAUGUUGGUGGUAAAUGUAACGUGGAGGAACAAGACAUAUGUAGGUACACUCCUUGACUGCACACGACAUGAUUGGGCACCCCCAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-111.90 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -119.04

Frequency: 0.0000

Diversity: 104.21

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((.(((..((((((((...(((((.(((((..(((..((((....))))......((((....))))..(((((......)))))((...(((((((.(..(((((....)))))..)))).))))...)).(((((((....)))))))(((.((((.(..((...........))..).)))))))...)))..))))).)).)))..))))))))..))).))))(.(((.(((((.((((.((.((.....((((((.....((((((((((((((....)))).)).)))))))).((.(((((.....((........))....))))).))))).))))).)).)))).))))).))).)

Thermodynamic Ensemble Prediction

((((.(((..((((((((...(({{(.(((((..(({..((((....))))...,.,((({....})))..(((({......))))}{{,.,({{((((.(.,((({{....,}|)),,|}}}.}}}},..||,(((((((....))))))){{{.||{|,||,|||,.,,,..,,.))..)})))}))}...}))..))))).)),)))..))))))))..))).))))(,{{({,(((({((((,(({((....,{,|||}},...((((((((((((({....}))).)).)))))))),{.(((({.,,...((....}}..}}...)))).},))))))))),)},,,}|||{|,,,,}))),)