Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ZNF609_0007700
Sequence Length
2745 nt
GC Content
0.5290
UGCUGCCAAUACACCUUUUGGUGCCAGUGGUCAACAAUGACAUCUCAUCUCCCUGUGAGCAGAUCAUGGUUCGUACCCGAUCAGUUGGGGUCAACACAUGUGAUGUGGCUCUGGCCACAGAGCCUGAGUGCUUGGGCCCCUGUGAACCUGGAACUAGCGUCAACCUUGAAGGCAUCGUGUGGCAGGAAACAGAAGAUGGGAUGUUGGUGGUAAAUGUAACGUGGAGGAACAAGACAUAUGUAGGUACACUCCUUGACUGCACACGACAUGAUUGGGCACCCCCAAGGUUCUGUGACUCCCCGACCAGUGACCUGGAAAUGCGCAAUGGCCGGGGUAGAGGCAAACGCAUGCGUCCCAACAGUAAUACACCUGUCAAUGAGACAGCCACAGCCUCUGACAGCAAAGGGACCAGUAACAGCAGCAAAACCCGGGCAGGAGCCAAUAGCAAAGGCCGUCGGGGCAGCCAGAAUUCUUCAGAGCACCGCCCACCUGCCAGCAGCACUUCUGAGGAUGUCAAGGCCAGCCCUUCCUCAGCUAAUAAGCGGAAAAACAAACCCCUUUCAGACAUGGAGCUGAAUUCUAGCUCAGAGGACUCCAAAGGGAGCAAGCGUGUCCGUACUAAUUCCAUGGGCUCAGCCACUGGCCCCCUUCCUGGGACAAAGGUAGAACCCACUGUUCUGGACAGAAACUGCCCCUCCCCCGUCCUAAUUGACUGUCCCCACCCAAACUGCAACAAGAAGUACAAGCACAUCAAUGGACUUAAGUACCACCAAGCUCAUGCCCAUACAGAUGAUGACAGCAAGCCGGAAGCGGAUGGGGACAGUGAGUACGGAGAGGAACCUAUUCUCCAUGCAGAUCUUGGGAGCUGCAACGGUGCAUCUGUCUCACAAAAAGGUUCCUUGUCCCCUGCCCGCUCAGCUACCCCCAAAGUUCGACUUGUAGAGCCCCAUAGCCCUUCUCCUUCAAGCAAAUUCAGCACAAAAGGCCUCUGUAAGAAAAAGUUGAGUGGGGAAGGGGACACAGACCUUGGGGCCUUAUCCAAUGAUGGCUCUGAUGAUGGACCCUCAGUGAUGGAUGAAACAAGCAAUGAUGCCUUUGAUUCUUUAGAAAGGAAGUGUAUGGAAAAAGAAAAAUGUAAAAAACCCUCUAGUUUAAAACCUGAAAAGAUUCCUUCCAAGAGCCUAAAGUCAGCCCGUCCCAUUGCCCCUGCCAUCCCCCCACAGCAAAUCUACACCUUCCAGACAGCCACCUUCACAGCAGCGAGCCCAGGCUCUUCCUCAGGCUUGACCGCCACAGUGGCACAAGCCAUGCCCAACAGUCCCCAACUCAAGCCCAUUCAGCCCAAGCCCACUGUUAUGGGAGAACCUUUCACAGUCAACCCUGCCUUGACUCCAGCCAAGGACAAGAAAAAGAAAGACAAAAAAAAGAAGGAAUCUUCAAAGGAACUUGAAAGUCCUCUGACCCCUGGGAAGGUGUGUCGAGCAGAGGAAGGCAAAAGCCCAUUCAGGGAAUCUUCAGGAGAUGGGAUGAAAAUGGAGGGGCUCCUAAAUGGCUCAUCAGACCCCCACCAAAGCCGACUGGCUAGCAUCAAGGCUGAAGCCGACAAGAUCUACAGUUUCACGGACAAUGCCCCCAGCCCUUCCAUUGGAGGCAGUAGCCGCCUUGAAAACACUACCCCUACUCAGCCCCUGACUCCCUUACAUGUGGUGACCCAGAAUGGAGCUGAAGCCAGCUCAGUCAAAACCAACAGCCCUGCAUACUCUGACAUCUCUGAUGCUGGGGAGGAUGGGGAGGGCAAGGUAGACAGUGUCAAAUCAAAGGACGCCGAACAGUUGGUUAAAGAAGGGGCUAAGAAAACUCUUUUUCCCCCUCAGCCUCAGAGCAAAGACUCACCAUAUUACCAAGGCUUUGAGAGUUACUAUUCUCCAAGUUAUGCACAGUCCAGCCCUGGGGCUCUGAACCCCAGCAGCCAGGCAGGAGUGGAGAGCCAGGCCCUGAAGACAAAAAGGGAUGAGGAACCUGAGAGCAUAGAAGGGAAAGUGAAGAACGAUAUCUGUGAAGAAAAGAAGCCCGAGCUGAGCAGUUCCAGUCAGCAGCCCUCGGUCAUCCAGCAGCGUCCCAAUAUGUACAUGCAGUCCCUGUACUACAACCAGUAUGCCUAUGUACCCCCCUAUGGCUACAGCGACCAGAGUUACCACACCCACCUUCUGAGCACUAACACGGCUUACCGGCAGCAGUACGAAGAACAGCAGAAACGCCAGAGCUUAGAGCAGCAGCAGCGGGGAGUGGACAAGAAGGCAGAGAUGGGCCUGAAGGAGCGGGAGGCAGCACUCAAGGAAGAGUGGAAGCAAAAGCCGUCAAUUCCACCAACUCUCACCAAGGCCCCCAGCCUGACAGACCUGGUGAAAUCAGGACCUGGCAAGGCCAAGGAGCCAGGGGCUGACCCAGCCAAAUCAGUCAUCAUUCCCAAGUUAGAUGACUCUUCAAAACUCCCGGGCCAGGCCCCUGAAGGCCUUAAAGUGAAGCUGAGUGAUGCCAGCCACCUAAGCAAGGAGGCCUCUGAGGCCAAGACAGGUGCUGAGUGUGGUCGACAGGCAGAGAUGGAUCCAAUACUCUGGUACCGACAGGAGGCAGAGCCCCGGAUGUGGACAUAUGUUUAUCCUGCCAAGUACUCAGACAUCAAGUCAGAGGAUGAGCGGUGGAAGGAGGAGCGGGACCGCAAAUUGAAGGAGGAAAGGAGUCGGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-846.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -899.04
Frequency: 0.0000
Diversity: 773.66
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((......(((.((((((((((.(((((....))))(((.(((((((((((((.((.(((((((((.(..(((((....)))))..)))).))))......(((((((....)))))))((((((((...((((((((...(((...(((((((((..(((...)))((((.(.((........)).).)))).)))))))))(((...((((.(((((.((.(((((.(((((((((.((((......(((((((....(((((.(((((.(((((((((((.((((....(((((.(((.((..(.......)..)).))).)))))(((((((....((.((..((...((((........))))....))..))))....)))))))......((((((((.((.((((..(((...((((((.(((.((((...((..((.((((.(((((.(((.((..((((((((((...((..........)).))...))))))))..))..)))..)))))(((((.(((....)))((...........))...((....))((((((.....)))))).)))))((((....))))...(((....))).........)))).))..))...))))..))).))))))......((((..((((((((..((((..(((......((((..((((....(((.((((((((((.((..(((.........)))....((.(((((((((.(...(((........)))...).)))).....)))))...))..((.....)))).)))))))))).))))))).))))......))))))).))))....))))..)))).....)))..))))...)).....))))))))(((((((.(((((((((((...............(((((((((((.....((......................))......)).)))))))))....)))))))))))..))))))))))))))))))))...........((.(((((((((...((((.((((((..(((...............((((((((..(((....)))..)))).))))(((((((((..........((((......))))...........((.(((((((....((((.....((.....(((((.((((((.(.((((((.(((.(((((...................(((..............((((....))))((((((..(((((((((((...(((((....))))).((((...(((...........(((((.(((..........)))..))))).....(((((.(((......)))(((((........)))))..........)))))..........((((....))))..((((.((....))))))..)))...))))..)))).))))))).))))))))).....(((.....))).....((((.(((((....((..(((..((((((.......((((.................))))((((((((.((.(((((((((((((..............)))))).((....((((.((((........)))).))))....)))))))))...............((((((((((..((((........)).))..)))...)).))))).)).))).))))).........)))))).)))..))...))))))))))))))))).)))))).).))))))))..))).(((((.........))))).))......))))...)))))))))........)))))))))..(((((((((((((......))).........((..((((((((((((....))))))...........((.(((.(((((((((.......))))))......))).))).)).)))))).))((((..........)))).)))))...)))))..((((((.......((.....))....))))))............))).))))))..))))..))))).)))).))((....))......))))))))))))...)))))))..))))))))).....)))).)).)))...)).)))))..))))...))).......((((.(((..((.(((.((.(((....(((((...(((........................))).)))))))).))..))).))..))).))))......((((........))))..))).))))).))))))))))).......((((((((....))......))))))......((((((((((.....))))........))))))..((((.(((((....((((..((((.((((((((..(((((.......(((((((............)))))))........))...)))...))))))))..(((.(((.(((...)))...))).))).(((.(((.....))).)))))))..))))....))))).)))))).)).)).)))))..)))))))))......).)))))))))).))).)))))....((((.(((((.....(((((.((((.(((....((((..(.((......)))..))))...))).)))).)))))...)))))...................)))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((((,...((((....))))....||}{{,....}},(((((((((((({((.({(((...(((((((.(..(((((....}))))..)))).))))...)))(((((((....))))))).....(((((((({((((((((.,(((,,...{{,({....,,|||{|,...{{((((((((...,,(..(((((((((,,(((,({...{(({..((,(((({,....{(....,,..||,,.,}})}}.}}}}}}.,}.}|((.((((((...(((((((({{((((,...(((((.(((,((.,{.......},}),.))).)))))(((((((....((.{(..((...((((........))))....)},,))))....)))))))......((((((((.{,.,,,{..{{....((((((.(((.((((.,.((..((,(({{.(((((.(((.((..(((((((((,...((......,...)}.),..,))))))))..))..)))..))))){(({{.(((....})){(,.........,||,,,,,,...,,((((((.....)))))).}}))}((((....))))...{{{.,,,}}}.........}))),))..))...)))).,))).)))))).....,{{{(,,{|,,,|||}}|((({(((...{{{,(({{..{{((....(((.((((((((((.({...{(,,........}}....{{.((((,((((.{...(((........)))...}.))))...,,))}))...}}..|{,,...,))).)))))))))).)))}})),|||}......}))))}.|||||.,{.,}})}.)))),..}),)),,))))},........)))))))){((((((.(((((((((((.........,,....((((((((({(.....{{.............,........))......)),}))))))))....)))))))))))..)))))))))))))))))))).....)))))).}}((((((...({.(({.|{{||,,,,.{{{{.{{,...(({....})),|||.}}||.,}}},}}}),,},}}}}.,...................,,..,},.}}}}....,||,,..,}..))).))..}))))).....,)}}),}))))))))..})))))))),}..,,,,,...........,,))),))....}},..)))))))..,.).)))))))){(((((((..(((((((((((...(((((....))))).((((...(((...........(((((.(((..........)))..))))).....(((((.,{{,,....,||(((((........))))).,,.}.....))))).........,({{({,..,|||{,,,,..,}}}},,}))))}})))...))))..)))).))))))).)))))))}......(((.....)))..,}..))))))))))))))..((((((((((((......,((((..((((.((........((((....))))........))))))))))}....|.......,,.....((.......,,,.)))))))))))){{.|||,,,.}||,}},,.................,}}||.,((({(((((((.{{((((((..{{(.,,.,.((((((....))))))..}}....((..(.,(((({(,,.((((((({{,(((({{(({.{{,{{{{{({{{{{{{|,.{{{,,,{.{{(((.........)}}||,,,...,}}}}},...{,,((((..{(((....}}))},,})))})}.{||{{{(((,.....}}}..........,..{((((.((((((....)))))).}}}}}.,}..,,{((((..,(((((((((((..{{{|}|..|||.|||.|||.||||{.{((({(.(((({...,.....{(((((,{{,.,({(((.((...{{.,(({{.{(..{{..{{...(((.........}}}....)}.,)},.}}..}))}..)),,..)).)))))}..))).,,.,}))))}....|{((,.{{(((...})))},}}},.,,,|,,|(({|.|{|,,{{,,,,.,}}|}})},,.,{||,.||,.((((.(((..((.(((.((.(((....(((((...(((.,,.,{..........}}......))).)))))))).))..))).))..))).))))......||||,....,||{({{...||,|,|||,{||..(((((......))))|,,.{{....})..,...}}}||||,.,|||,.,..{(((,,...))))...|}}||))))}...))))).})))}}..||{...||,)}),||(((((...}}}}}.....(((((((............)))))))}}}},...))}}.|}}}}.||||||||..{||||{...{{,..({{{.|{...}})}|}|,|{|..,,.,}),}}}|},,}}))))......((((({(((((((({{..{|......,.}}}}.)},,))))).))))))..,.)).)})})}))))))).,,}}}}}...|||}})))}).)).,}}},))))},,},..)))))))..)),),))}))..)}.}),,,)))})))))...}),})),},...}))))))).
Back