Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_ZNF827_0000300

Sequence Length

383 nt

GC Content

0.5065

GGGAAGACAGGAAGACCCCCAGCGAAUCAAAUAGCCCCUCUUCAUCCUCCCUCUCAGCUCUGAGUGAUUCAGCCAACAGCAAAGAUGAUUCAGAUGGCUCCCAGAAAAACAAGGGCGGGAACAAUCUGCUGGUCAUCUCUGUCAUGCCUGGGAGCCAGCCCUCACUGAACAGUGAGGAAAAGCCAGAGAAAGGGUUCGAAUGUGUUUUUUGCAACUUUGUCUGCAAGACGAAGAACAUGUUUGAGCGUCAUCUGCAGAUACACCUCAUCACCCGGAUGUUUGAGUGUGAUGUGUGCCACAAGUUCAUGAAGACCCCCGAACAGCUGCUGGAGCAUAAGAAAUGCCACACUGUCCCCACCGGUGGGCUCAAGUAAGGAAAGCAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-105.20 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -113.63

Frequency: 0.0000

Diversity: 98.19

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((.((...(((((......((..........))...))))).)).))))(....(((((((.....))))(((.((((..(((((((.....((((((((((.....((..(((((((...(((....)))..)).))))).)).))))))))))..(((((((....))))))).....((.......))(((((((((((((........((((((((...))))))))))))))))))))))))))))(((.((((((((((.((......))..)))).))).))).))).....((((............)))).)))).)))............(((.(((((.......))))))))............))).)

Thermodynamic Ensemble Prediction

((((.({...(((((......((..........))...))))).}},))))(,,,.{((((((((.(((..((.....))...))).))))))}((((((((((....,({.,((((((....,{|..,,}}}..,}})))),.},.))))))))))..(((((((....)))))))....||,{{{,...|.(((((((((((((({{{{,..{{{{{,,|,,,)),}))))))))))))))))).}..)))|{{.{(((((((((.{({......}..))}).))).})),))}.....((((..{.........)))).|||},|}}.||{{.....,,||{.{((((.......}))))))),,......,,...},.)