Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_ZNF827_0007500

Sequence Length

2018 nt

GC Content

0.3870

ACAAGGAAUAAGAAUACAUUUGACCACUUGAUAGCAGCCCUGGCACAAAGCCUAGUAGGAGUAAAGGUUAAAACUGUUGGCCUAAAUCAGUGUUUAAAGUUAACUUUGAGUUAGGGCUGUCCUUGAAAUGGAUUGUCCUUUGCUCUCAUGGAUUCUUGUGCAUAACUGAUAAAAAAUAUUCUCAUACAAUAAAUUGCACCAAUAUCAUUUUGUGAAUGUGUUGGUGGGUUGCAGGGGGCGCGUUAGGGGAAGCUGCCUCCUUGCAGCUUUUGUUUUAUACGUAUUUAAGCACUAAAUAAAAAUCUAUUUUGUCUCUUUUCCCUUGCUAAGUCUCUUGUCUCCCACGGCCCUUUUCUUUCUGGAUAUAUGUAUAUUUUUAGUAAGUAAAGGACUUACUGUAUGAAGUUUUUCUUUGGCAGACAGAAUGAUGAUGACUAUAAUAUGUUUAUUACAAGGUACAUCAUGCCAAUGCUCUUGGUGUGUGUGUGUGUGUGUGUGUGUGUGUCUACAAAGAAAUGUAUCAUUUUAUGUAUAAGCUAAGAUUUUGAUAAGUAGUCAUUUAUCUAUCCAUAGAAUGCUAUUUCUUAGACUGUAGAAUGCAUUGUUAUAUGGUUAGGGCUAUUGGGGGUGUUCAUUUUUGUUUAGGUUCUUUGACCUAGUAAAGACUUCCUGGUGAUUUCAGUAGUUUGGUAAUUUAUUACUGAUCUUCUAAGAAGUAUUGGUAAUGUUAAAAUGAAAACAUUUAUACAAAAAGAAAUAAAAGUCAAGGAAGCAGAUAAUCAACCGAUUUAUCAGCCUUAGCAGACAAUUUUUCUGAUAACGAUGUGGUAGCCAUGGUAAAUUUACUUCUGAUUGCUUGAGGGGACAGAUUCUAUGUGCCUUUUGUAAUAAGAGGUGCAUGAAAGGGUAAGGGAGCAAGUAAUCAAUCCGUGGACUAACCAGUCCCAUUUUGGUCUUUAGAUUGGCCUUUUGGUGAGUAAAUUCAAGCUAUCUUUUCAACAAAAGAAAAAUUUUGUUAUUAAUUUGCUGAAACGUGAGUAAGGAUGUAAGGAUGAGUAUAUCUUUUUGUUUGGAUAUCUCUAAGUAGCCCUAGUAAGGGAAGGCCUCUUUUGGUAAUGUCUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUGAGACAGGGUCUCACUCUGUUGCCCAGGCUGGAAUGCAGUGGUGCAGUCGUGACUCACUGCAACCUCUGCUUCCUGGACUCAAGUUAUCCUUCUGCUUCAGCCUCCCGAGUAGCUGGGACCACAGGCAUGCACCACCACACUUGGCUAAUUUUUAUAUUUUUGGUAGAGAUGCGGUUUCACCAUAUUACCCAGGCUGGUCUUGAACUCCUGAGCUCAAGUGAUCCGCCAGCCUUGACCUUCAAAAGUGCUGGGAUUAUAGGUGUGAGCCACCAUGCUUGGCCUAUUUUUUUAAACCUUUCAUUUGAAAGAAAUUUGAGUAAAAUUGAGAGAUAAGCAAAAAUUUAUUAGUCCACUCAUAGUCCUUCCAGCCUCACAGGACUUAACACUGAUCAGCAAUGUGGUCGGUUUUAUGUAAUAAUAUCCAGCUUAUUACAAAAACUACAUUACAAACUGAGGCUAUAGUUGAGAAUCCAGAGGUGAACAAAUUCAGGAAAAAUGCCUCAGGCCUUCAUCCAAAUAUACUUAUAUUAGUUUUCUUGGGUUGCUGUAAUAAAGUAUCACAAACCAGUGCUUAAACAACAGAAAUUUAUUGUCUCACAAUUCUGGAGGCUAAAAGUCUGAGCUCAAGGUGUCCACAAGGCCACUCUCGCUCUGAAGGCGGUAGGGAAGGGUCUGUUCCAGACCUCUCGCCCAGCUUCUGGUAGUUUCUAGGCUUAUGAUAGCAUAACUCAUCUCAUGGUGUUCUUCCUGUGUGCAUGUGUGUCUCUGCAUCCAAAUUUCCCCCUUUUAUAAGGACACCAGUCAUACUGGAUUUGAGUCCACCCCAAUGACCUCAUCUUCACUUGAUUAUCUGCAGAAGCCUAUUUCCCAAUAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-537.44 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -579.68

Frequency: 0.0000

Diversity: 697.91

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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