Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_ZNF91_0003300

Sequence Length

352 nt

GC Content

0.3182

GUCUCAUCUCAGAUCUCUUGAAUUGGAAUCCAUAUUUUAACAAAAUCUGCAGCUCAUUGAUAUAUACGUUAAAAUUGGAGAGGUACCUUCUAACUUACUGUGACUUCUCCAUAUGAGAACUGGACAGAACUUACUGUGUAUAAUGUAAAUAUGGCACUCAAAACUGUAUAUGCUUGUGUUUAUGCCAUAAAUUUUAUGCUGUAUUAUUCAGAAAACUACAGUACCUACAGUGGUUUUGUGGAUCUUUUUUCAUUUUCUUUCCUCAGAAUGCAAAAAUAUAUUACAGAAUCUUUCUCUAUUUAACAAUAUUUUAUUGGAUAAUUCCAGUCUCUGUAACUCUCAAACACCUAGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-61.10 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -69.71

Frequency: 0.0000

Diversity: 89.15

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((......((((.((((......(((...))).((((((((........((......))........))))))))(((((((((..(............)..)))))))))...)))).))))((((......))))((((((.((...(((((((......((.((....))..)).....))))))).)).))))))......(((((.((((((((.((....)).)))))))).))))).(((((.((((((........)))))).))))).....((((((..((.....(((((((.((....)).))))))).....))..))))))))(((.........)))

Thermodynamic Ensemble Prediction

((..{{..{(((,{,,,,,|,..{{{...}},.{{((((((...,,...{{,....,})........))))))}}(((((((((,{,............),,)))))))))...||||.{(({((((......))))((((({.{(...(((((((....,,{{.{{....}}..},,},,.))))))).,,.)))))),,,,..(((((.((((((((.((....)).)))))))).))))).,((((,((((((........)))))).))))).....{{{(((.....,,,.{{{{,,.,{{,,...}|}))||,,..,)))))})))),,))(({.........)))