Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ZNF91_0004100
Sequence Length
2183 nt
GC Content
0.3234
GAGAAUGGCGUGAACCCGGGAGGCGGAGCUUGCAGUGAGCCGAGAUCACGCCACUGCACUCAAGCCUGGGCGACAGAGCGAGACUCCGUCUCAAAAAAAAAAAAAAGAAAAUUCAUACUAGAGAGAAACCCUACAAAUAUAAAGAAUGUGGCAAAUCUUUUAACCGGUCUUCAACCUUUACUAAACAUAAGGUAAUUCAUACUGGAGUAAAACUCUACAAAUGUGAAGAAUGUGGCAAAUCCUUUUUCUGGUCCUCAGCCCUAACCAGACAUAAGAAAAUUCAUACUGGACAGCAACCCUACAAACAGGAAAAAUUUGGCAAAGCCUUUAACCAGUUUUCACACCUUACUACAGAUAAGAUAACUCAUAUUGGAGAGAAAUCUUACAAGUGUGAAUAAUGUGGUAAAGUCUAUAAAAAGUCCUGAAUUCUUAACAGACAUAAUAUUAUUCAUACUGGAGAGAAACUCUACAAACCUGAAAGAUGUGCCAACGCUUUUGACAAGUCAAACUUUUCUAAACAUCAAGAAAAUCAUGCUGCUGAGAAAUCCUAGAAAUGUGAAGAAUGUGACAAAGCCUCUAAAUGAUUGUCACACUUGAUCGUAGGUAAGAUAAUUCAUACUGGAGAAAACUACCAGUGUGAACAAUGUGGCCAAGCUUUGAACUAAUGCUCACACCUUAAUGCAUAGGAAAGCAUUUAUGCUUGAGAAAAAGUGAACAAAUAUAGACAAAAAGCCAUUAAUACCUGCUCACAUCGUACUCAAAUUCAGAGCGUUCAUACUAAAUAAGAAGUGUAAUUACUGUCAAACGACUGAUCAGAAAAUAUGUCUUUAAAGUACAGAAGAGUAUUUUGAAAAAGCAUUACAAAUAUGAAGAGGCAUUAUUUAUGACCUUUUCUAUGGAAAGGUAAGGACAUUAAAAAUGUAAGAUGCAUGAUGAAAAUUUAAGUAGAGAGGAUCUUUAUGGUUAACUUAUAAUAUCGAGUGAUGCAUGAGGUAGAUGUUCAGAUUAAUAUUCUGCAUUAUUAUGAAAGAAAAACAUUCUUAAUUUUAGUUAAAGUUUAGUAUGAUUUAUUGUAUUUUUAUGAAAUAUAUGUAGCAUAUUUUUAAAUUAUAAAUUGCAUGUGAACUUUUCAACCAAACAGUUUUAACAUGUUAAAUACUAUCAUGAAUUCAAUGAAGUGUUAUUAUGCCAGUAACUUUAACCUAUUCCACCUUACUCAAGGGUGUAGGUAAAAGAUGGUAAAAAUACACUAUUUGGUAAGAUAAUGGACUGACAUCUCUAGUGAUUUUUUUUGCCAGUGAGUUUUAAUUGCCAUUAAGUUAAAGAAUAUUGUUCCCAUAGGCUAAAUUUUUAUUUUUAUUUUCUCAUUUAAAUGUAUUUGACUUAAUUUUUGUGGAUACCUAAUAUGUGUACAUAUUAUGCCAUAUGUGGCAUAUUUUGAUACGGACACACAAUAUAUAACAAUCGCAUUAGACUAAAUGCGGUCUCCAUUACCUCUAGCAUUUAUUCUUUGUAUUACAAAUAAUUCAAUUCUACAGUUUUAGUUAUUUUUAAAUGUACAAUUAAAUUGUUGUUGACUACAGGAUUAUUUUUAUGGUCAUAAUAAAACUUAUAUACAAACAUAAGUAAAAUCCAUAUAUUUCUGAGUCCCGAAUAAAUCUUUUUUAAUUUUUUCAUAUAUUUUUCUUCGAACAUGUGGCCUCUGCCUGCAAGCACAUAUGGACUGUUAGUAUUGAUUUACAUAGAGUUAAAUAUACACAUCUGUUAGUCUAAGAUGAAUCUUAGGUGUAAAUAAAUUAUGGAGUGUGUUUAAGUUCGAAACUAUUUUUAGCAGAAAAAAGCAAUAUUGGAACAAAAUCAUUUUAAGGAGGUGUCUAAUUUACUACAAAACAAAAAUUCUCAAAAAUGCUGAAAGCAAAUUUAUACUCUGCUUUGUAUUGAAUUUCUUGCUGUACAAUCUUUUGGCUUAUGGUUCAGAGUCUCCCCAUGCAAAUUCUGUUUUAACUUGACUGGUACUCAUGCUAGACCCAUAAUUUUUUGUUGUUGUUGUUUAAUAGGUUUUUUGUUUGCUUAAUUGUUUGUUGUUGUUGUUGUUUGUUUGUUUUUGAGACAGAGUCUUAAUCUUUCUCCCGGGCUGGAGUGCAAUGGUGCAAUCUGGGCUCACUGCAACCUCCGCCUUUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-522.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -566.48
Frequency: 0.0000
Diversity: 503.47
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.............)(.(((((((((((.((((((((((((.((((..(((((.(((((((.((((((((.((.(((..(((((((.((((((((((.........((....)).......(((.((((...((((..(((((.(((..(((((((.....(((((((.....))).(((((........)))))((((((.((((((...))))))....))))))...(((((....((.....((((((...........)))))).....))....))))).(((((((((((......(((((((((....(((...(((.....((((((.....((..(((..(((((((((((..(((........)))..))))))..((((((((((((((......((((.....(((.........)))...))))...))))))))))))))((.((((..((((...((((.(((((.(((....))))))))...((((((((.........(((.(((((((.((((((...((((((..........((((..((((..((((...(((..((((((((..(((((((.((.(((((((.((...((((((((((((....)).))))))))))......(((((...((((((..(((((((....(((((.((((((........))))))))))).....((((.((..(((................)))..)).))))................))))))).(((((........))))).......(((....))).(((((((((..((((.((((((((((......))))))))))...)))).........((((((((((.....))).)))))))((((((.(((((((((..........((.((((((((((.((((((..(((((((((.....(((((((((((((((.....((((((((((((.(((...(((......)))....)))))))))))).)))(((((.....)))))........(((.(((((((((((......((((((((...)))))))).....)))))...)))))).)))...(((((((((((.((......)).)))))..))))))..((((((.((((.......)))))))))).............((((.(((((...((((((.....))))))))))).))))(((((((......(((..(((((((((.((...((((.......))))...)).)))))))))..))).....))))))))))))))).((((...))))))))))).....)))))))))..)))))))))......))))))).)).......(((((..(.((......((((.((...(((((((....)))))))...)))))))))..))))).........((((((((......)))))))).))).))))))...(((.........)))......(((((((.((((.((((..(((((......))))))))).)))).)))))))..((((((.((((....)))).)))))).......((((((........))))))....))))))..))))))).))..(((.((((........)))).)))...........))))))....))))))))))))))......((((.((((.(..(((......)))..).))))..))))..(((((((....((......))....))))))).........)).))))))).....((((.((..((((....((........)))))))).))))..))))))))..)))...))))..))))..)))).........)))))).........((((((...........))))))))).))).))))))).))).......))))))))..)))).)))))))).))........)))))..)))..))))))))......)))....)))...))))))))))))))))))))...))))....)))))))..))).)))))..))))....)))).))).)))))))))).)))))))..))).)).)))))))).))))))).)))))..)))).)))))))))))).))))))))))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.............)(.(((((((((((.((((((((((((.((((..(((((.(((((((.((((((((.((.(((..(((((((.((((((((({.........,,....}|.......{((.((((...((((..(((((.(((..(((((((.....(((({{(,,,,.|||{(,,,,......,}))),,,{((({.((((((...))))))....}))))),,.{({({....,,,{,..((((((...........))))))...,}),....})}}}.(((((((((((......(((((((((....(((...(((.....((((((,....,,..(((..(((((((((((..(((........)))..))))))..((((((((((((((.,,...((((.,.,.{({.......,,.))...)))),,.))))))))))))))((.((({.,((((...((((,(((((.(((....))))))))|..{(((((({....,....(((.(((((((.((({((..,((((((..........((((..((((..((((...(((,,((((((((,,(((({{(,{{.(((((({,,{...((((((((((((....)).))))))))))......(((({.((((((({,{,{((({,....{{....||||||}..|||,,},,}))||(((.....((((.{(..{{{.,..............,}}..)),))))....,.}}},..,}}}))))|{{,,((((.....,,,}||||...,.{{(((,...}}},}},|||{{{||{{{|,{{{{{(((((.,,,,,|||}}}||||,,,|,,,.......,.((((((((((.....))).))))))),||{{,.((((((((({{{,..,{||{{.((((((((((,((((((..(((((((((.....{{(((((((((((((.....(({(((((((((.(({,{.(((......))).,,.)))))))))))).}))(((((.....))))),,,,,,,,{{{{(({{,{(((((...{,,((((((((...)))))))),,.,.)))))},,}}}}}},.}},,.(((((((((((.({......}}.)))))..))))))..((((((.((((.......)))))))))).,|||....,,},((((.(((((...((((((.....))))))))))).))))(((((((,,,,.,(((..{((((((((.{{...((((,....,,,)))...},.))))))))),,})),}...))))))))))))))).,,||...},))))))))).....)))))))))..)))))}}))},...}))))))}.}}.,..,,.{((((..{.{{.....,((((.((.,.(((((((....)))))))...)))))))}}..)}}},.........((((((((......)))))))).})).)))))}...|,|||||,||.,|||,,.{{{(((((((.((({.((((..{{{{{......}))),)))).)))}.))))))}|,,(((({,((((.,..}}}|,||}}}}..,,...((((((........))))))....,)))))},,))))))}))..|||,||||........,})),)))}.,,,}}}}}}},,)}}|.,,})))),})))))))..|{,||||||(({({(..((({{,{{,|}}..,})))),,}}}},,|||||||}...{((((({....}))))))}}}.........)).))))))),,...((((.({..{,(({{{.,,...,,,,,},,,,,}).))))..))))))))..})),,,))))..))))..)))).........))))))....,||..{{((((...........}))))})))}})).))))))).))).......))))))))..)))).)))))))).))........)))))..)))..})))))))......)))....)))...))))))))))))))))))))...))))....)))))))..))).)))))..)))).,..)))).))).)))))))))).)))))))..))).)).)))))))).))))))).)))))..)))).)))))))))))).))))))))))).)
Back