Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ZNF91_0005800
Sequence Length
1622 nt
GC Content
0.3909
GAAAUCUUCAACUCUUACUGAACAUAAGAUAAUUCAUACUGGAGAGAAACCCUACAAAUGUGAAGAAUGUGGCAAAGCAUUUAGCCAAUCCUCAACCCUAACUAGACAUACGAGGAUGCACACUGGAGAGAAACCAUACAAAUGUGAAGAAUGUGGCAAAGCUUUUAAUCGAUCCUCAAAGCUUACUACACAUAAGAUAAUUCAUACUGGAGAGAAACCUUACAAGUGUGAAGAAUGUGGCAAAGCAUUUAUAUCAUCCUCAACCCUAAAUGGACAUAAGAGAAUUCAUACUAGAGAGAAACCCUACAAAUGUGAAGAAUGUGGCAAAGCAUUUAGCCAAUCUUCAACCCUAACUAGACAUAAGAGGUUGCACACCGGAGAGAAACCCUACAAAUGUGGAGAAUGUGGCAAAGCCUUUAAAGAGUCCUCAGCUCUUACUAAACAUAAGAUAAUUCACACUGGAGAGAAACCCUACAAAUGUGAAAAAUGUGGCAAAGCCUUUAACCAGUCUUCAAUCCUUACUAACCAUAAGAAAAUUCAUACUAUCACACCUGUAAUCCCACUACUUUGGGAGGCCGAGGCGGGCGGAUCACGAGGUCAGGAGAUGGAGACCAUCCUGGCUAACACAGUGAAACCCCUUCUCUACUAAAAAAUACAAAAAAUUAGCCGGGCGUGGUGGCGGGCGCCUGUAGUCCCAGCUAUGCGAGAGGCUGAGGCAGGAGAAUGGCGUGAACCCGGGAGGCGGAGCUUGCAGUGAGCCGAGAUCACGCCACUGCACUCAAGCCUGGGCGACAGAGCGAGACUCCGUCUCAAAAAAAAAAAAAAGAAAAUUCAUACUAGAGAGAAACCCUACAAAUAUAAAGAAUGUGGCAAAUCUUUUAACCGGUCUUCAACCUUUACUAAACAUAAGGUAAUUCAUACUGGAGUAAAACUCUACAAAUGUGAAGAAUGUGGCAAAUCCUUUUUCUGGUCCUCAGCCCUAACCAGACAUAAGAAAAUUCAUACUGGACAGCAACCCUACAAACAGGAAAAAUUUGGCAAAGCCUUUAACCAGUUUUCACACCUUACUACAGAUAAGAUAACUCAUAUUGGAGAGAAAUCUUACAAGUGUGAAUAAUGUGGUAAAGUCUAUAAAAAGUCCUGAAUUCUUAACAGACAUAAUAUUAUUCAUACUGGAGAGAAACUCUACAAACCUGAAAGAUGUGCCAACGCUUUUGACAAGUCAAACUUUUCUAAACAUCAAGAAAAUCAUGCUGCUGAGAAAUCCUAGAAAUGUGAAGAAUGUGACAAAGCCUCUAAAUGAUUGUCACACUUGAUCGUAGGUAAGAUAAUUCAUACUGGAGAAAACUACCAGUGUGAACAAUGUGGCCAAGCUUUGAACUAAUGCUCACACCUUAAUGCAUAGGAAAGCAUUUAUGCUUGAGAAAAAGUGAACAAAUAUAGACAAAAAGCCAUUAAUACCUGCUCACAUCGUACUCAAAUUCAGAGCGUUCAUACUAAAUAAGAAGUGUAAUUACUGUCAAACGACUGAUCAGAAAAUAUGUCUUUAAAGUACAGAAGAGUAUUUUGAAAAAGCAUUACAAAUAUGAAGAGGCAUUAUUUAUGACCUUUUCUAUGGAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-364.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -396.81
Frequency: 0.0000
Diversity: 338.88
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(...((((((..(((((.......)))))..........)))))).....)((.....((((((((.((.(..((((..(((.(((((((((.....((..((((......(((((((((((.((.............))..))))....(((((...(((((((............)))))))....))))).......((((((((...(((....)))...))))))))((((((......))))))....)))))))...((.....)).................))))..))..............((((((...((((..........)))).))))))................((.((((((...((((((((((....((((..(((((((.(((.(((...)))....((((((.....))))))...........((....))..(((((((((.....(((((...........)))))......))))..)))))........((((.......))))......))).)).)))))..)))).(((((......))))).((....))(((.(..((((..((((((((..(((...)))))))))))......))))..)))))))))).((((.............))))))))(((((((.(.((((.......))))).))))))).((.((((((((((((((((.((..((((.((((((((((((((((((..((.(((.((...........((......)))).)))..))..))))).)))))))))............................((((((....(((((...........)))))....))))))..))))..))))(((((..........)))))..((((((.((((((...))))))....)))))).............))))))))))..))))))))))..((((.................))))...))))))))......)))).....))))))))..))))..))).))))))))............((((((..(((........)))..))))))..((((((((((((((......((((.....(((.........)))...))))...))))))))))))))((((.....))))........(((((.(((....))))))))............((((((........))))))..(((((.(((((...........((((((....((((((((....((.....)))))))))).......(((((((......((((((((((((....)).))))))))))....(((((.....((((..(((.((.((((..(((((.((((((........))))))))))).....)))).))....))).))))..)))))...)))))))))))))..........))))))))))..(((((........))))).....((((((......))).))).....((((.((((((((((......))))))))))...)))).....(((.((((((((((.....))).))))))))))....))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{...{{(({,.{((({..{{,,...||||,..,||,...,||}|,,....}|,.....{(((((((.{{,(,.((((,.(((.(((((((((.....,,..,,{{......((((((({{({.((,.......,},..,...})))....(((((...(((((((.,........,.)))))))....))))).......((((((((.,.(((....))).,.))))))))((((((......))))))....)))))))...((.....))......,,...,||...,|||.,,|.....}}......,((((((...((((.{,....,}.)))).))))))........}}}.....((.((((((...((((,{{{,,...,{((,..,{(({{(.{,{.(((...)))....((((((.....))))))............,...{(((((.((,,(.{....,)}.}}..)))))}...,,,||{...)))......,,||,,,.....{{{{.......}}}}......},,.|}.}}}},,,||},.(((((......))))).{,.{|||.(((.(..((((..((((((({..(((...)))))))))))......))))..)))),))))}.|,,..............}},,))))(((((((.{.((((.......))))).))))))).((.((((((((({((((((.((..((({.((((((((((((({{((({(((.((,,......,}}}}}})),.,,..{{{{{,,,..))}.))))).)))))))))..............,,....,,......((((((....(((((...........)))))....))))))..))))..}}}}(((((..........)))))..{(((({.((((((...))))))....)))))).............))}))))))},.))))))))))..((((....,.,.....},.,.))))...))))))))......)))}.....))))))))}.))))..))).)))))))}.,{,......,.{(((({..(((........)}}..}))))},.{(((((((((((((.,{...((((.,...,{{.......},,))...)))),,.)))))))))))))){|{(|{...)))).},....}||,,|,|{{,...,})}||{(((..,{||....{(((((........)))))}..(((((.(((((........,..{(((((.,..((((((((....{{.....)})))))))).,.....(((((((......((((((((((((....)).))))))))))....(((((...,,{(({..,{{.((.((((..(((((.((((((,......,))))))))))).....)))).}}....,,}.,,,,..)))))...)))))))))))))..........))))))))))..{((((........)))))...,.||{{{,...}}})},,))),,...||||,|(((((((((......))))))))))...}},,.....,{{.((((((((((.....))).)))))))}}),,..})
Back