Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_chr10_0112300

Sequence Length

1309 nt

GC Content

0.3789

GUUGUUAAUGAAGCAAGAUUUCCACUAAGAUUAUAGCAAUAAAGUUUUGCAUUGUCAUAGUUUUCUCUACUGGAAUUGACUCUAAGACAAGCAUCCCCAAUAUGACUCCAUCCUUCUCCACAAAGAUGAGCUGGUAAAGCCUGGCAUUCUUGCUGUCUCUGAUCCCACUGGCAAUUCAAGUUUAGUGAACAGCUUUUACAGCUGGUAAGUUUGUUACAAAUCUGCUCAUUUCUCACAUGACAUUUGGUGUAGUUCUUGACAGACAUACUGCAGUUACUAUUUGCCGAAAUGCAUUUCUUGUCAUCACACCAUUGGCACCCAUUUGUAUUGGCAGUACAGCUGGCACAAUCUGCAUAUCUGUAACAUCUGUCAUCAGAAGCAGCUGUUUUAGGAGGGCACUUUGCUCUAAGAAUAUUAUUAGUAUUCCCAGAUUCCCAAGAUUCACAGUGAUUUUUAUUCCAAACACAUUUUAUCCCUGGACCAGCAUUUUUACAAAGUUCUUCAUCUCUGAAAGCCUUGCAAUUUGGAGGCUUGUAUACAAGGAUAUCAUUAAGGAGUACACUAGAAAAUCCCCCAAAUAUAUACAUGGACCCGUUAAUGACUACUGCAGAGUGUCCAAAUCUGUUGACAUCUCUAUGAAGAUUUGGUUUUGGUAGUAUUUUCCAUUCAUCACAAGCUAUGUCAUAUGCCAGGAAAUCGGCAGAAAAACAUUUUGCACCGUUACUCAAGGAAGUGUCAUUAUGGGUAUUUCCUCCAAAAAUAAGCAUAGCUCCAUUGAUAAGAACAGCUGAAUGAAGGUAUCUGGCAAACCCACUUUCUUUCAAAAUAGUCCAAGUCUUAGUGUUAACUUCAUAUUUAUAAAGAUCAUCAACCAAUCCAUAUUUGUUCCCUGGCAAUGCUUUAUACCCUCCAUGAACAUAAAUGGACUUUGUUAUUUCAUCAUACACACUAGUAUGGCCAUAUCCACCUUGUACAAUAGCUCCUUUAGUUUCUGGAACAAGCCAAGUGUUUGAUGAGAUAUGGUAUUCCUGUAUGCUGCUUGUAUAACCAUAUAUUGCAGAAUAUCCAAAUAUUAUGAUCAUGACAACAUCUCUACUAUCCAACUCCAUAAUAUGUGCUGAAUGUCCCUCCACAGCAUACUGCUGACCAUGUCCAAGAACAGUAGGAGUUUUUGUACUCCAUGACUGACUAUGUAUGUUAAAAACCCAUAAUUCAUCUGUGACAUUGCCAUCAUUUGUUUCAAUUCUGCCUCCAUACAUAAAGAUGUUUUCCUGAUAUAAAGCAAGAGAGUGUCCAUAUCUCUGGAGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-283.30 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -310.94

Frequency: 0.0000

Diversity: 301.86

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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