Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr11_0643700
Sequence Length
429 nt
GC Content
0.3893
GAGAUGACACCACUCGUGGGGUGAACUGAAAAGAGAUCAACUUUAUUUUUAAAGUAGUAGUAGAAUUCUCCAUUGGAACCAAUAUCUGCGUCUGUUGCAGUCACCUGGGCAACACUAGUCCUUAGAGGUGUGCUUUCUGCUAUGGUAACAGAGUAUGUUGUGGGUGAAAACAAAGGUCUCAGAUCAUUCAUAUCUAAAACCUGUAUAUUCACUUUGGUCCAUGCUUCCAAAUCCUCUCCUCUGACAGAACCUUUUACUAUCAAUAAAUAAUUAUCCUGGAUUUCCCUAUUUAAUAUGGCAGAAUUGCCACCUUUAGUUCUUAUUCUGAGAAAACAGAAAUCUGCAAUGAUGACUUCCUCUGCUUUGAAAAAGCCUUCCUCGUCUCCGGACACUAUUCUGUAUUUGAUAUCCCAGGAUAGAUCUAUUAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-96.32 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -103.71
Frequency: 0.0000
Diversity: 92.10
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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