Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_chr11_0643900

Sequence Length

273 nt

GC Content

0.4652

UCAUUCUCACUCAGACAAGAACUGGUUUUCCUUGCAGGGCAAUCCUGUUCCUCAUUCUCCUUAUAGAAAAAGGAGAAUGCCCAAACUUAGUGGUUCACGUCAAAGCUCAGCACAAUCUUGGGGCACUGGGAGGACUAUGGAUUCUAGUGGUCAAUCCAUUAGCAGCAGGCAGACAUCCAUCCUCGGAAGGCAUGGUAAGUGAUGGUGAGCAACCACUAUGGCUCCUUGACCCCAGUGACUUCAGAUGUUCAUUUCAAAAGUGAAGGAGAAUAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-75.40 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -80.76

Frequency: 0.0002

Diversity: 60.68

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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