Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr11_0656400
Sequence Length
335 nt
GC Content
0.3940
AUUUCAGGAAGGGACUUAACCUUUCUGAGCCCAUUUCCUCAUCAGUGAAAUCAGAAUAAUAAACGCACCCCCUGUACUCCAGGUGGGUGGAGGACUAAUUAAAAGGUAUUUACCACACUGUUUGCAUACAGUUGACACUAGAAAAUAUAGUUGCAUUAUUUUUCUGAAAAUCUGUUUAAGAUAUUGUAAGCUGCCCAGAACUCAGAGCAGGUACUCAGUAUAUGGCCGGACUUCAGGAAAGCUCUAAUGAUGAAAGAAUUUAGUGCCCUGGCUUGGCAGGAAAUUUCCCAUAGAAGAAGACAUUUUAAAGCUAUAGAUCCUGUUCUUAAGGAAGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-74.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -81.19
Frequency: 0.0000
Diversity: 77.36
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((((((((.......))))))))))....((((((...(((.....((((((.(((((...(((((((((.....)))).)))))...............(((....)))..(((((......)))))((..((((.......))))..))))))).))))))....)))......((((((....((((.(........).)))).....))))))...(((((...(((((...((.((((............)))).))))))).))))).(((....))).....(((((.(...((((......))))...).))))).)))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
..{(((((((((.......)))))))))}....,{(((({....,.,...,|,,,..........(((((((((.....)))).)))))}}}}|..........(((....)))..(((((......))))),|.{((((,,.....}}}|..|{{{{{(((((((({..((((.{{,..((((((..,.((((.(........).)))).,...)))))).}}}.)))).)))))))))|,.,|||}},,.......}))))})}({({.....,))))...,{{{{...{{((,{,,,...{|{,......}})}}},).)))),..))))}.
Back