Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr12_0221400
Sequence Length
538 nt
GC Content
0.4498
GUGACCAGCACUCUGCAGAGAAUUCUCCCUUGGGCAACUCCUGAUGGCCACGGAAGACCGGGUGAGUGAUAGUCACUUAACUGUAUAGACAACUCCUACUGUAUCAUGUCAUACAUGCGUUUUUGGCACUACUGACACCAGCAACAUUUAAUGGAAUCAUUUGGGAUUUUCCCCUCAAUCACAACAUGGCUGUGGCCAGUGCAGGGAAAUACAUAUGAAGGAUGUUUCCCAAGUUCUGGCUGAGGAUACACAGUGACAGAUUUUGAAAUAACAAAGUCCACUGUACAUGCAUCACUUUGAAGGGUGUGCAAAGUCUCGACUCAGGCAAAUUCAAGGGUCAGAUUAUUGUCAGUGGAAAUGCUGAGAUUUAAGCAUUGCCACUGAAAGGAGUUCAUACAGGACCACACUCACCAACCACUUCUGCAAUGGAAGGGAAUGAUAGAGGGUACAAAGCGAGAAAGCAUGGAUUCUGAAGAACAUGGGAAUAUUAGGUGCUCCUGAGGGUAUCUGCGGAAUCUCACAGUUUUGGAUGGAUUGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-160.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -169.88
Frequency: 0.0000
Diversity: 67.49
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....((((..(((((((((.......((((((((.....(((((((.((.(((....)))((((((((...(((......((((((.((..((((((...(((((.(((((....(((.......)))....)))))(((...........)))........((((...))))((((..((((.......))))(((((.((.(((((((((........).))))))))..)).))))))))))))))((((((...(((((((......)))))))))))))...((((.(((((....))))))))).(((((.(((((..(......)..))))))))))....(((((((.((((((........)))))).))))))).)))))))))))))))))..))))))))..((.(((((.....)))))))........(((((.((..((......)).)).)))))..........))..)))))))....))))))))..))))))))(((.((......))))))..))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
....((({..,((((((((.......((((((((,{.,.(((((((.((.(((....)))((((((((.,.(((......((((((.((..((((((..,(((((.(((((....(((.......)))....))))),((,,.........||}........((({...})))|{{{..{{{{.....,,))}|(((((.((.(((((((((........}.))))))))..)).))))))}}}))))){(((((...(((((((......))))))))))))}...((((.(((({....})))))))).(((((.(((((..{......}..))))))))))....(((((((.,(((((........)))))}.))))))).))))))))))))))))).,))))))))..((.(((((.....)))))))..,,....(((({.({..((......)).}}.}))))......,,},)}..))))))),),,))))))))..)))))))){{{,{,,,....,)}},)},))))
Back