Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr12_0222400
Sequence Length
584 nt
GC Content
0.3818
GUUCAUGGUAACCCAUGUAUCUUUGGGUAGCUCUCAGCCUGACUUGCCAUUUCCAUGUCUUAUACUUCUCUGUCUUUAUUUUCUCUGAGUUCUUGACUUCCUUUUGCCCUUGUCUUUAUUGAACUUCAUCCUGUUAGUUUCUGAUUACUUGUCCAAUUUGUUGAGGUCAUUUUCAAUUCUAAUUGCAUCCCCCAAGACUUUAGCCUACACUUUAAAUUCAGUCUCAUCUAUGAACUUAAUGAGUAUGCUGUUUCGGUAACAAAGUCAUGGAUGAUCAUCUUAACUAGAAAUGAAUCCAGGACUGAGCCCUGUGCAGCACCAUUUUUAGUGUUUACUCAUUAGAGGAAAUGUAUAGGCAGGUGCUUUAAUGAAGUUCAGUUUAGAAAAUAUAGGCCUCCUUCUUCAGCAUCUGGAAUUACUUGGCUAGAAUUUUUAACAUUUUUGGCAAUUCAAGGCUGUAUUUCUAUACAAGUGAAAUUUAAUUAAUCAAAGUCAUUCUCAAAAUGUAACCUUAAGGUCAGGCGUGAUGGCUCAUGCCUGUAAUCCCAGAACUUUGGGAGGCAAAGGCAGGUGGAUCACCUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-139.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -151.74
Frequency: 0.0000
Diversity: 132.62
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(..(((((....)))))...)(((((((.(.(((..(((((.((((((.....................................((((....((((((......(((..(((((..((((((((((((......(((.((((..........(((((.(((((((....)))))))...)))))......((.((((...(((.(((.(.((((.((((..........)))).)))).).))).))))))).))......((((.(((((.....(((.....))).....))))).))))....((((((((...((...(((((((......)))))))))...)))))))))))).)))...))))))))))))..)))...))..))).......(((((...))))).(((((((..(((((......(((.(((((......))))).)))..)))))..)))))))..............))))))..)))).......(((....)))(((((((((....)))))))))...((((((....))))))))).))).)))))))).))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(,.(((((....))))).},|(((((((.(.(({..(((((.((((((...............,,......},...,,,......((((....((((((......(((..{{(((..(((((((((((({{((,.,(({((((,,.....,,.{{{{,.(((((((....}}}}}}}...,}}}).,.....,..|||||||||.,,,.,.,,,,.{{(({,,{{{{,{{||||,||}},|,||,{||||,..,)}},.,,}}|)),}))||},{,,{,{.....))),}),,,,,))}))}}|{{{((((({{{{{,,,.,,(((((((......)))))))))...)))}},}))))).))),..))))))))))))..)))...}}..))).......{{{{{...})))).(((((((..(((((......(((.((((({....,))))).))),.)))))..)))))))..............))))))..))))....,..(((....)))(((((((((....)))))))))...((((({....})))))))))}}).)))))))).))))))))
Back