Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr12_0309600
Sequence Length
218 nt
GC Content
0.5505
CACAGCAGUUGGGAGGCUUUGCUUUGAACUCAGUGCUGCCCUGUCAGUGAUAAGCAGAACCAGGCUGCACUCAGAUGACAUCUAACCACGGAAGGAGCAUUUGGACUGGCCUUAGCCAGAGGGAAAUCACCCACCAUAGCAGUCAGAGCUUGAGUUCCCACAAGCCUCACAACCACAGGCCAGAGUGCUCUGGGGCCCUAAGUGGUCUUGAGGGGCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-73.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -76.65
Frequency: 0.0044
Diversity: 33.43
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.(.((((.((((......)))).))))).)))((((((((((...))))..........((((((..(((((((.(.(((..(...)..))).)))))))).(((((....))))).(((......)))......))))))...(((((........)))))((((..(((((((((((((....)))))...)))..)))))..))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.(.((((.((((......)))).))))).)))(((((({{((.,,,,...}},,.....((((((..{((((((.(.(((..{...,,.,)),)))))))}.(((((....))))).(((......)))......))))))...(((((........)))))((((..((((({(((({{(,...}))}},,,)}}..)))))..))))))))))
Back