Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr12_0583100
Sequence Length
529 nt
GC Content
0.3365
AAAAAAAAAGGGUAAAAGCAUUGAGAGGGAAUCACAGCUUUUGGUUUUAGGUUCUAGUUCUGGCUCUGCCACAAAUUUUGUGGCUGUGAACAAGUAAUUUAAUCUUUUUGGACGUUGGUGUCUUUAUAUUUCAAGUGGAGGGAAGAAGUGUGAGGGGGUAUUUAUCAUAAAAAUUCCCUACCAUAUUUAAAAUUAUUAUGUAUCUUCCCUCUAGAACAAGUUAUAAGCAAGCUGACGGCAGUUUUCCAAAGUGCCUAGAACAUAUCUUACAUAUAACAGAUGAUAAAAGAAUACAUAGGCAACGUUGAUACAGAUAUUGCUCAAGAAAACUAUUUUUCACAGGGCAGUGGUUAAAAGAAAGAGGUUUGAGAAUCACAGCUAUUUAAUGACGAAGAAACAUAAAAAGUGUAUUGUAUUAGAAAGUAGUUUAUAGAAUGCUGAGAUAAGAGAGUGACUUACUGUGACUUGCAUAAUCAUUCACUUUCCUUGAGAAAUCAUACUGAUUAAAUUCUUUCUCUUUUCAGACAGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-109.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -121.45
Frequency: 0.0000
Diversity: 151.93
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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