Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_chr12_0583500

Sequence Length

457 nt

GC Content

0.4770

GUGAGCAGAUCUCGAGGUCAAGAGAUGGAGACCAUCCUCACCAACACAGUGAAACCCCGUCUCUACUAAAAAUACAAAAAUUAGCUGGGUGUGGUGGUGGGUGCCUGUAGUCCCAGCUACUCAGGAGGCUGAGGCAGGAGAAUCGUUGAACCCGGGAGGUGGAGGCUGCACUGAGCCGAGAUCACGCUACUGUACUCCAGCCUGGUGACAGAACUCCGUCUUAAAAAAAAAAAAAAAAAAAUUAUGCAUCCCAACUACAGCCUCUGCUUAAUGUCAUAUUGCUUUGUUGUUGUUGUUGUUGUUGUUGUUGACGAUGUUUUGAGACACAGUCUCACUCUGUCGCCCAGGCAUCAUAUCCGGCUAAUUUUUGUAUUUUUGUAGAGAGAGAGUUUCACCAUCUUGGCCAGGCUGUUUUAACUCCUGACCUCCGGUGAUCCGCCCGCCUUAGCCUCCCAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-159.80 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -167.65

Frequency: 0.0000

Diversity: 74.56

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((.((.(((((((((((((.(((...(((((...(((..((((....(((((((.(..(((((((.(((((((((((((((((((((((((((((.(((((.((((((((....)))))..)))((((((((((((.((...(((.((.(.(((..((((.......))))...))).).))))))).)))).)).))))))...(((((((((..((((((((....................(((((.((((.(((((..(.((.((((..((........))..))))..)).)..))))).))))..)))))))))))))..))).....)))))))))))..))))))))))))))))))))))))))))))))))))..).)))))))....))))..)))..)))))..))).)))))).))).)))).)).))).((........)).

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((.((.(((((((((((((.(((.{,(((({,{.(((..((((....(((((((.(..(((((((.(((((((((((((((((((((((((((({.((((({(,,({{({|{|.||,.{{{||,.,,|||||||,||,{...{(,,((.{.(((..((((.....,.))))...))).).))))))},),)),)}))}|||{((((((((((((..((((((((....................(((((.((((.(((((..(.((.((((..((........))..))))..)).)..))))).))))..)))))))))))))..))).....))))))))))))}))))))))))))))))))))))))))))))))))))..).)))))))....))))..))).}))))),.))).))))))},)).)))).)).))).((........}).