Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr13_0101200
Sequence Length
309 nt
GC Content
0.3948
GCGUGAGCCACUGUGCCCGGCCUAAAAUUAUUAUUUUUUAAAGUAAACAUUCCACACACGCAUAUACUUACGUUUGACUUUUCUUGUUUUGGAAGGGAGAAAAGAGGAAUAGAUACUUGGAGUGCAGUUAGGAAAAAAUCACUAACCAAUGAUACGUUAUUCCAUCCUAUACAGAUCAUAAAUAUAUUAAUUUUUUUUAAUUACCAAGAACAGGCACAUAUCCAACCUACUUCACCAGGUGUUCAAAGAGAAAAAUACAGCCGGGCGCGGUGGCUCAUGCCUGUAAUCCCAACACUUUGGGAGGCCGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-87.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -93.47
Frequency: 0.0001
Diversity: 58.34
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((((((((((((((.(((((........)))))(((((...(((((.((.(((..........))).)).((((((((.(((...))).)))))))).)))))...)))))(((((((.(((((((.....)).)))))..(((((.(..(((........)))..))))))......(((((......)))))............))))...))).((((........)))).(((.....))).......)))))))))))))))))))))((....((((((....)))))).....))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((((((((((((((((.,{{{{......,,}}}},,{(({...(((((.{{.(((........}.))).)).((((((((.(({...))).)))))))).)))))...})))|(((((((.(((((({.....}}.)))))..(((((..{,{({........)})}..))))).......,{{{{{,,,,|}}}}|,..........))))...))).{(((........)))),,{,.....))}.......)))))))))))))))))))))((,...((((({....}))))).....))
Back