Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_chr13_0121000

Sequence Length

2720 nt

GC Content

0.3875

GGAAUGCAUGGUGGUUCUUUCUCCUUCUCACAGACUCUGUGUAUACCUCUAUUGUGGAAAUCCCAUGCUAUGUGUUACUAUUUGUUUAAGUAUGUGGUUCCUUCUACAUAGUUGUGUUUUGAAACCCCCAGAAGGAUAUAACAUAACAUUAACAUAUAUAAACUUUUGUGGGAGUCUAGGAAUGAGGCAAAUGGGGAAGGAAUGAGAGGUUUUUUAUUGUGUAUCUUUUUCCUUUUUGCCGUCUUACUUUUGGAGUAUAUAUGUGCAUAUAAUUUAAAAUAAUAAUAACCUUUAAAAAUACUAUAUCAGAAUCAACAGGAUUUGGUAACUUAUGUAAUGUGAGAGUUAGGGGAGAUGGAGAAGUCAAGAUGACUCCCAGGUUUCUAGCAUGAUGAUAAACCUAGUCAUGUCAUCCCCUACAACAUUUUUUUUUUUAAGAAAGAAAUCUGUUAUUAAUCAAGGUACAAGUUGGAAAGAUGUUAAAGAGUAAGAGAAGGUAGAUCAGUUUGGGAUAUAUUGUACUGGAGGUGUUGUGUCCAACAGUGCACUAGAAAAAGAAGAUGGGAAAUUCAGGAGAAUGGUCAGGGGACAUAGUUGUUACUAGAAGCCUUGGAGAAGAAGACACGUAUAUGAGGCUAAUUUAUCUAGGAAUUACUUAUUCUGUAAGACCAAUUAACAGGGAUGAAACCAAGACCCACAGAAUAAACUAAAAAAGCAACUAUAUCAAAACGACAGCGUAAGACCAUAUAUUGGUAUCCUUUUCAUACAGACAUCAGGCUCUCACUAAAAGAUUAUUUACUAAUUUAGUCCCCCAGGUUCAUAACAGAUUAGAAACAUCAAAAAAAGGUGUAGGAAUAGCUUCCAGAGGCAAUCAUCUGGCAGCAGCAUGAGGGUACAAAAACAAAAACAAAUAGUUUAAGACUUCAAAAAGCAUUGCAUUCUUUACUCUUCAUUAAAGCCAGAAAUCCCAUCUUUCCAUCAUCUAAGACUUGGUCAAAAUGGUUGCUCCUUCAAGAAUUUUUUCAUAGUUCCUGUACUCUCAGAGUAACAUGACUAAUCUCCAUUUGUCAAGUUUCCAAUUCCAAAUAUUGUAUUGAGCCCUUCCUGAAGGCACUAACUAUACUCUGGCUUGUUUUAUAAGUAUUUUUAUACCAGCCUCUUUCCUCCCACUUGAAUAUACAUCUCUUGAUUGAGUAUCUUUCAUCUUUGUAUCUCUAGCCAGCACUGUGCACCACAUCCUUGCACAGUAUGGAAGUAUGCAAACAUCCAUUCAGUAAUUAUCCCAUUUUUGCAUUCUCUAAAACUAUGUAAAUGGACUUUGCCACACAGUCUCCCUGCAAAAAGUUAUAACUGCUUUUUUACUGUGUACUUACAUUUUGGCACCAACCUAAGCAUUUGACCUGGCUUAUCCCAAACACUAAAGAAAUAAGGGGUGAUGGGAAGUGACAGCUAGUAGGUUCGGGGGUUUUAUUUUUAUGCUUUUUAACCAGCAUAUAAUUGUACAUGUUUGUGGGUUACAUGGUGAUACUUCAACAUAUACAAUGUGUAAUGAUCAAAUCGGGGUAAUUAACAUAUCCAUCACUUCAAACAUUUAUCAUUUAUUUGUGUUGGGAACAUUCAAAAGCCUCUCUUCUAGCUAGUUGAAAAUAUGUAACAACAACACAGGUUUGAACUGUGCAGGUUCAUUUAUACAUGGAUUUUUUUCAGUAAAAGUUACAGUGCGCCUCCCUCUCCUGCCUCCUCUUCCACCUCCUCUCUCUCUUCCACCUUGCCACCCUCGAGACAACAAGACUAAUCCUUCCUUUUCCUCCUUCUCCUCAACCUAUUCAACAGGAAGACAAGAAGGCUGACGACCUUUACGAUGAUCCACUUCCACUUAAUGAAUAGCAAAUAUAUUUUCCUUCCUUAUAAUUUUCUUAAUAACAUUGUCUUCUCUCUAGCUUGCUUUAAGAAUACAGAAUGGAGGCCAGGCGUAGUGGCUCACACCUGUAAUCCCAGCACUUUGGGAGGCCAAGGCGGGCGGAUCACCUGAGGUCAGUAGUUGAAGACCAGUCUGGCCAACAUGGCGAAACCCCGUCUCCACCAAAAAUACAAAAAUUAGCCGGGCGUGGUGGCAGGUGCCUGUAAUCCCAGCUACUCCAGAGGCUGAGACAUGAGAGUCGCUUGAACCCAUGAGGCAGAGGUUGCAGUGAGCCGAGAUCGUGCCACUGCACUCCAUGUGUUAACUGACUGUUUAUGUUAUCAGUAAGGCUUUCAAUCAACAGUAGGCUAUUACUACCAAAGUUCAGAGAAAUAAAAGUUAUAUGUGGAGUUUCAACUGCACAGGGGUUGGUGCCCCUAACCCCUUCGCUGUUCAAGGGUCAGCUGUAGUCACCCAGUACAACACUAGAACUUAUUCUUCCUAUCUAGCUAAAUUUUGUAGCCUUUAGCCAACCUCUCUCUAUCCCUUCUCACCUCUUGAGGAGCCCCCAUAAUAUUCUCCGUAAUGGCUCUACUCAUUUACAUUUGGUUUGGCGUUUUUCACAGAAGACAAAAAUGUUCCAAAAUCAGACUGUGAUGAUGGCUGCACAAACCUAUGAGUAUCCUAAAAAAUAAUGAAUUGUGUAUUUUCAAUGGAUUAUGGUAUGUGAGUUGUAUCUCAAUAAAGCUGCUUUUAAAAAUGAGGUUUCUGCUGUUAGUCCCACUGUUCAGAUUAAGAAGUUGAGAUUUAGUAAGAUUAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-636.40 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -694.72

Frequency: 0.0000

Diversity: 843.05

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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