Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr13_0121300
Sequence Length
1316 nt
GC Content
0.4369
GUUCAAGUGAUUCUCCUGCCUCAGCCACCCAAGCAGCUGGGAUUACAGGCGCCUGCCAUCACACCGGCUCAUCUUUGUAUUUUUGUAGAGACAGGGUUUUGCCAUGUUGGCCAGGCUGGUCUCAAACUCUUGACACCUCAAGUGAUCCACCCACUUUGGCCAUCCAAAGUGCUGGGAUUACAAGCAUGAGCCACCACGCCUGGCCAACGCCUCAGACUUUCUAUAGACCCAUCUUAAAACAGAAGACCAAGGUUCCAAAAAUUCAAUAUAAUCAGCCACUAAUUUUAACAUUCAUCAAGGGAAGAUAAAAAGAGUUUAGAGAUAUGAUGUAUCAUAUCCACUCUACAACAAAAAUUUUGUAUUUAUGAAAUGAAGCAGGAAAAUGUGACCUACUAUCAAGGGGGAAAAAAGAGUCAAAAGUCCAUUAAUACAGACAAAGGAAUAAACAAGGACUUCAAAACAGCUAUUAUGAAUACAUUCAAAGACUUAAAAGAAAAAUAUGGUCACAAUGGGGAAUCUUGGCAGAUAAAUGGAAUUUUUUAAACAAAAUACUGUAACUGAAGGGUGCAUUCACUGAAAACAGGCUUCACUGCACAUUAGAUACAACAUUUAAAAGAGUCUCUGAAAAACAGAGAAAAAAAUUAAUACAUACUCAUGGACCAAUUUUAAACAGAAUAAUGUGUAAGCAGAAUCUCAAGAGGAAAAACAGAGGAAUGGGGCAGAAAAGGUUUUGUUUUUGUUUUUUUUGAGACAGAGUCUCAUUCUGUCACCCAGGCUGGAGCACACUGGCACGAUCUCGGCUCACUGCAAGCUCCGCCUCCCAGUUUCACACCAUUCUCCUGCCUCAGCUUCCCAAGUAGCUGGAACUACAGGCACCCGCCACCACGCCUGGCUAAUUUCUUUUUGUAUUUUUAGUAGACGGGGUUUCACCAUGUUAGCCAGGAUGGUCCAGAUCUCCUGACCUCAUGAUCCAUCCGCCUUGGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGCAUGAGUCACCGCGCCCGGCCGGUAUUUUUUAAGUAAGGUCUAAAAUGUACCAAAUUUUGGGAAAAAGUAUCAACUUACAAAUCAAAUAGGCCAGGUGUGGUAAUCCCACGCCUGUAAUCCCAGCACUUUGGGAGCCCAAGGCGGGCAGAUCACAAGGUCAGGAGUUCAAGACCAGCCUGACCAACCUGGUGAAACCCCAUCUCUACUAAAAAUACGAAAAAUUAGCUGGGCAUGGUGGCGUGCACCUGUAAUCUCAGCUUACUCGGGAGGCUGAGGCAGGAGAAUUGCUUGAAUCCAGGAGGCAGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-509.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -529.49
Frequency: 0.0000
Diversity: 249.26
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((((((((((((((((((.(((.((.(((((((((((((((.(((.(((........)))...((((((((....))))))))..((((...(((..(((((((((((((((((((..((.((((....))))(((((((...((((((((....))))))))...))))))).))..))))..)))).))))))))))).((((.((..((((....((((.((.....((((....((((((((((..............(((..((.((.................))))..)))....(((((...(.(((((((....)))))))))))))..........((((((.(((((...)))))))))))...(((((((..((......))........(((((..((((((..........................))))))..............((((....))))..))))).............)))))))....))))))))))((......))...................))))....)).)))).......(((....)))(((....(((((((((...................((((((.....))))))..((((((....(((....)))....))))))........))))))))))))))))..))..)))).....(((.((((((((((((((.((((((((((((..........))))))))))))..)))))))....((((.(((((.((.((((.((....)))).)).))...)))))))))............))))))).)))..((((((........)))))).......)))))))(((((((.(((((((((((((...(((((((((((((((((.((((((((((((.(((.(.((((.(((((..((.((((((((((..(((((..((((((((((.(((((((((((((((((((((((((.((.(..((((((((.(((((((((.(((((.(......)))))).)))))....(((((....((((....)))).....)))))..)))).))))))))...).)).))))))))))))))))))))))))).))))))))))..)))))..)))))))))).))..))))).)))).).))).))))))))))))...)))))))))))))))))))))))))))))).)))))))).)).)))))))))))))))..)).))).))))))))))))))))))))))))))((........).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((((((((((((((((((((.(((.((.(((((((((((((((.((,{(((......,,|(({,{{((({((.{((((((,((({..(((((({{...{(((((((((((((((((((..,,.((((....))))(((((((...((((((((....))))))))...))))))).,}..))))..)))).))))))))))))...}}|,...,....,})))).}}}}...}}))))}}|,}}}}|,................,,,..{{.,,..,,,,.....,......||||,|,}....{((((...(.(((((((....)))))))}})))),..{{{,....|}}}}..,,,,,..,}||,||||||...|||||(({.{{....,}}|}|......{{{{{..((((((..........................)))))).....{{{{{{{,.((({....}))}..||||,.............)))).,..{{(({{{,{{.{{(({...{((({.,{{{{,.....,}}},..{({(,(((,.{{((({,....(((....))),,,....|||||,|||}.},,,...}||,......((((((.....))))))..,,,,{,....{{,.,,,))),,..}})))}....,...},})))})}}}}....,{{{{,{{{{{{(((((({{{{{((((((,,,....})))))))))))))))))))))||(((({{...}))))))),}}}((((.(((((.((.((((.((....)))).)).))...)))))))))..)})},.,},,))))).,.))))},,}},))))).,}}))))),.....,.)))}..((((((((.((((((((((({,..{(((((((((((((((((.((((((((((((.(((.(.((((.(((((..((.((((((((((..(((((..((((((((((.(((((((((((((((((((((((((.((.(,.((((((((.(((((((((.((((,,(......}))))).)))))....{((((....{{((....}))).....))))}..)))).)))))))).,.,.)).))))))))))))))))))))))))).))))))))))..)))))..)))))))))).))..))))).)))).).))).))))))))))))...)))))))))))))))))))))))))))))).)))))))).)).)))))))))))))))..)).))).))))))))))))))))))))))))))((.,....,.).)
Back