Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr13_0132800
Sequence Length
640 nt
GC Content
0.2766
UCUUUAGCUGUUGGCUCACAAUUUAUACACACACACAUACACACACACACACACACUUUUAAGAAGUUUAUCACUUACAUUUUUCUCAUUAUAAUAUUAUAUACUUUAUAUUAUCAUCAAAACUCUUGCUACCAUCACUUUCCAUAUUAUUAAUUCUUAAAAUAGAAAUUAAAAAGAAAACAUCAUGACUUGUCUCAUAUAAAAAUAAAAAAGGUGAUUUCAUUUUGCAUUUGCCUAACUCCUAACAAGAAUAAGGACUUUAUUCAUAUUUUUAAAACCUUUACACUUUUAACGUAUAUACUUUAGUAAAAGAAAAACAGUUUUACUCCUAUUUCUAGAAAGCUGAAUGAGUAUAAAGAAUGAAACUCUAAUACUGGAAAGACUUUAAAGUCUUCAGACAAGCCAGAUAGAAAUAUCUAUUUAUAAUACAGGUAAACAAUAGAUGGUCUAUUCUUUGACACAAUGCCAUUAAUGACAUUCAUUUGCCAAUAUAAAUAUUCUUAAUAGAGUACAUUCUACUUACUACAACCCCAUAAAUGUGUUGUUCAUGAUAUGUCAGACUCAGGUGGUAUGAUAAACAAGAUAGAUACAGAAAGCACAAAAAAGAGCUAUGAAAUUAAUAAAAAUGGGAAGAAUCUAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-79.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -94.88
Frequency: 0.0000
Diversity: 167.64
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....((((...))))......................................(((((...))))).......(((.(((((((((((((((((((..........)))))))..(((...((((((((((((((.((((((((((((((((((((......)).))))))..........((((...(((((((((.((((((((....((((((.............))))))............((((((.....)))))).))))))))...........((((((.(............))))))).....(((((((.((.........))))))))).))))).))))...)))).....))))).)))))))........(((....)))..((((((((((....)))))))........)))........))))))((((.(((.......((((((((..((((((((((....(((((((..((((((....))))))..........................)))))))...)))).))))))......)))))))).......)))))))........))))......))))...)))..........)))))))))))).)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.....({,{{{,|,,,..,,,.................................{((({...})))}.......{{{.(((((((((((({({((({.{.......,)))}}}}..(((...((((((((.{{{{{.,(({{..,,{{.((((((((......)))}})))}...,,.....,,.{{.{((((({,.,.....,,,,....((((({...{{,,.,|...}}))}}...,,,,.....{{{{{||,,.,}}}}}}.,,},,,||.......,...((({(,,{..,......,..})))))).....(((((((.,,..,.....,})))))))).,,}|||||..|||,,,....|||,,,,|}|||{(((((....)))))),))}}}}}.,|((((({...,}))}}}}........}}}},.....,))))|{((({{(((.,.....((((((((..((((((((((..,.{((((((..{{{......,|||||{.....},,,,.,,,.......,,,..))))))),..)))).))))))......)))))))).......))))))))}......))},.....,)))).,.)))..........)))))))))))).})}
Back