Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr13_0134200
Sequence Length
406 nt
GC Content
0.3867
GUUUCUAAUUUUGGCCAGUAUAAGAGAUACAAAAUAAUAUCUCAUUGUUUUAAUUUGUAUUCCUCAAAUUACUAACAGAUUUGACAUCUUUUUAAUAUGCUUGUUGGUCUUUUGGGUUUCCUCUUCUGUAAAUUUCCUGUUCAUAUCCCUUACCCAUUUAAACACUGGAGGUUCUUGUCUUUAUAUUGUUGAUUUAUAUAUUUAAUUUUAUUAUUAUUAUUUUUUAGACAGGAUCUCACUCUAUGGCCCAGGGUGGAGUGCAGUGUUGCGAUCUCAGCUCACUACAACCUCCGUCUCCUGGGCUCCAGUGAUCCUUCCAUCUCAGCCUCCCGAGUAGCUGGGUGGGACUACAGACAUGCGCCACCGUGCCUGGCUAAUUUUUGUAUUUUUGUAUUGCAGGGACAGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-95.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -105.37
Frequency: 0.0000
Diversity: 104.65
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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